| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_11 | 1 = | 0 (0.000) | 244 (0.330) | 81/258 | 0.2 | 100% | intergenic (–/‑1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Alcohol dehydrogenase (EC 1.1.1.1) |
| ? | AssemblyC74_contig_45 | = 1002 | 0 (0.000) | intergenic (‑96/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Integrase, catalytic region/– | |||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGTCTATGCGGATGCAGGCAGAGATATCAGCAGTAATGTCACTTCGTTGACCGTGGACCCAACGAATATTACAGATGGAGGAAACATAAAAGTAAAATTCTCGT > AssemblyC74_contig_11/1‑134 | aagctcgtttggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgcttttgcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTaa > 2:320629‑M1/130‑135 (MQ=255)aagctcgtttggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTaa > 1:558394‑M1/130‑135 (MQ=255) cgtttggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAatat > 1:1494093‑M1/125‑133 (MQ=255) cgtttggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATaa < 1:1624159‑M1/11‑1 (MQ=255) gtttggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAAc < 2:363369‑M1/12‑1 (MQ=255) gtttggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAAc < 1:1010057‑M1/12‑1 (MQ=255) ttggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAAtata > 2:933067‑M1/122‑131 (MQ=255) ttggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACAt < 2:1688909‑M1/14‑1 (MQ=255) tggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACAt > 2:1618458‑M1/121‑134 (MQ=255) tggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATc > 2:506557‑M1/121‑135 (MQ=255) tggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgatttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATc > 2:2189048‑M1/121‑135 (MQ=255) taagatgggtattagtcttttttgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacttaaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATTACTTCACTGa > 2:260330‑M1/116‑135 (MQ=255) taagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGa > 1:903600‑M1/116‑135 (MQ=255) taagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGa > 1:840020‑M1/116‑135 (MQ=255) taagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGa > 1:692033‑M1/116‑135 (MQ=255) taagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGa > 1:1691647‑M1/116‑135 (MQ=255) taagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGa > 1:1781806‑M1/116‑135 (MQ=255) taagatgggtataagtaatttatgttcactctccttttatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaaattaaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGa > 1:2244463‑M1/116‑135 (MQ=255) gggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCt > 2:2541672‑M1/110‑134 (MQ=255) gggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCt > 1:1165824‑M1/110‑134 (MQ=255) gggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCt > 1:43272‑M1/110‑134 (MQ=255) gggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaattagagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCt > 2:1020774‑M1/110‑134 (MQ=255) tataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGtt > 1:1322134‑M1/107‑134 (MQ=255) ataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATc < 2:1033519‑M1/15‑1 (MQ=255) ataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATc > 1:1033519‑M1/106‑120 (MQ=255) ataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCt < 1:481476‑M1/25‑1 (MQ=255) ataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCa < 1:1937666‑M1/30‑1 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTCCTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCAt < 1:2414864‑M1/31‑1 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCa > 2:1849266‑M1/105‑134 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCAt < 1:1565091‑M1/31‑1 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCAt < 2:1958133‑M1/31‑1 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCAt < 2:1780885‑M1/31‑1 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCAt < 2:1576933‑M1/31‑1 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCAt < 2:1767848‑M1/31‑1 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatgtgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCa > 2:2032433‑M1/105‑134 (MQ=255) agtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGt > 1:499092‑M1/103‑135 (MQ=255) atttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGTCt > 1:309294‑M1/99‑133 (MQ=255) atttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGTCt > 2:1116612‑M1/99‑133 (MQ=255) atttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGTCt > 1:2017802‑M1/99‑133 (MQ=255) atttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGTCTa < 2:1065028‑M1/36‑1 (MQ=255) tatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATc < 1:2123939‑M1/15‑1 (MQ=255) tatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATc > 2:2123939‑M1/96‑110 (MQ=255) tatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACt > 2:857861‑M1/96‑113 (MQ=255) tatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTcc > 2:1097482‑M1/96‑119 (MQ=255) tatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGTCTATGCg < 2:1258438‑M1/40‑1 (MQ=255) atgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGTCTATGCgg > 1:2449068‑M1/95‑135 (MQ=255) atgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGTCTATGCgg > 1:1258438‑M1/95‑135 (MQ=255) tgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGTCTATGCGGa < 2:1439920‑M1/42‑1 (MQ=255) tgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGTCTATGCGGa < 1:793230‑M1/42‑1 (MQ=255) actctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGTCTATGCGGATgcag > 1:177289‑M1/89‑135 (MQ=255) ctctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGTCTATGCGGATgcagg < 1:128499‑M1/48‑1 (MQ=255) tctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGTCTATGCGGATgcaggc > 2:2443626‑M1/87‑135 (MQ=255) 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTAATATAACATCACTGATTCCTGTTCATGTCTATGCGGATGCAGGCAGAGATATCAGCAGTAATGTCACTTCGTTGACCGTGGACCCAACGAATATTACAGATGGAGGAAACATAAAAGTAAAATTCTCGT > AssemblyC74_contig_11/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |