| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | AssemblyC74_contig_26 | = 7770 | 0 (0.000) | intergenic (+560/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Glutathione reductase (EC 1.8.1.7)/– | |||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
AGAAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_16/21866‑21988‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAGGTTGTAAAATCAGTGTTTTGTCCTGAGTATTAGAGAAACAAATGGAAAAATAGTTCCTCATATTTTGCCGTTTTTTGAGCTAATACCGAAGGACAGCTGATTGAACACTATTTGTTCGGAAAAAGTGACT < AssemblyC74_contig_26/7770‑7638 || atcAGAGGTTGTGAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATCAGAGGTTGTAA > 2:1653514/4‑135atcAGAGGTTGTGAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATCAGAGGTTGTAA > 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AGAAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_16/21866‑21988‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAGGTTGTAAAATCAGTGTTTTGTCCTGAGTATTAGAGAAACAAATGGAAAAATAGTTCCTCATATTTTGCCGTTTTTTGAGCTAATACCGAAGGACAGCTGATTGAACACTATTTGTTCGGAAAAAGTGACT < AssemblyC74_contig_26/7770‑7638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |