| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_16 | = 21988 | 191 (0.870) | 252 (1.040) +CA |
62/254 | 0.7 | 72.8% | coding (146/387 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_26 | = 7770 | 0 (0.000) | intergenic (+560/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Glutathione reductase (EC 1.8.1.7)/– | |||||
Only 100 of 461 total aligned reads displayed.
AGCACCGTTTAAAGAAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCAATTTCAAAAAATAGCTTCTCATGTTTGTTGAATATTGTGACTTGTGACCGAGGAGTTGGCATGAGAACACCGTTTATTCGAAAAAA > AssemblyC74_contig_16/21854‑22121 | gaacaccgtttatcagGAGGTTGTGAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTtat > 2:1006793‑M1/17‑135 (MQ=255)gaacaccgtttatcagGAGGTTGTGAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTtat > 1:1690976‑M1/17‑135 (MQ=255) gCACCGTTTAAAGAAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTtat > 1:765344/1‑134 (MQ=255) ccGTTTAAAGAAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCTTAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATAcc < 2:1581624/134‑1 (MQ=255) ccGTTTAAAGAAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATAcc < 2:2137416/134‑1 (MQ=255) ccGTTTAAAGAAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATAcc < 1:1855720/134‑1 (MQ=255) accgtttatcagGAGGTTGTGAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAACTGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACcgtttatcaga > 2:306392‑M1/13‑131 (MQ=255) ttAAAGAAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAagag > 1:217782/1‑135 (MQ=255) aaaGAAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGt > 1:689015/1‑135 (MQ=255) cagaggTTGTGAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaa < 2:442054‑M1/134‑15 (MQ=255) cagaggTTGTGAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaa < 2:1823930‑M1/134‑15 (MQ=255) agagGTTGTGAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaat > 1:144046‑M1/1‑120 (MQ=255) ggTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGa > 1:1360136/1‑132 (MQ=37) gTTGTGAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaa < 2:2335801‑M1/130‑15 (MQ=255) gTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCTTAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGc < 1:1591681/133‑1 (MQ=37) gTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGc < 1:328754/133‑1 (MQ=37) ttGTGAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtg > 2:1763720‑M1/1‑115 (MQ=255) ttGTGAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtg > 2:167055‑M1/1‑115 (MQ=255) ttGTGAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtg > 2:1461373‑M1/1‑115 (MQ=255) ttGTGAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtg > 2:241429‑M1/1‑115 (MQ=255) ttGTGAAAAAGTCGCTTAGTCTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATAACGAGTAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaataagtg > 2:27010‑M1/1‑115 (MQ=255) ttGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCt > 2:1923360/1‑134 (MQ=37) ttGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCt > 2:1474185/1‑134 (MQ=37) ttGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCt > 1:100013/1‑134 (MQ=37) tgtgAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagt < 1:251418‑M1/133‑20 (MQ=255) tgtgAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagt < 1:552057‑M1/133‑20 (MQ=255) tgtgAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagt < 1:573022‑M1/133‑20 (MQ=255) gtgAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgtt > 2:571736‑M1/1‑113 (MQ=255) gtgAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagt < 1:603785‑M1/132‑20 (MQ=255) gtgAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAACTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCTGcc < 1:920390/135‑1 (MQ=37) gAAAAAGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATTGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTTGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCCTTTATcagaggttgtaaaatcagtgtttt > 1:2367520‑M1/1‑111 (MQ=255) aaaaaGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgtttt > 2:734281‑M1/1‑110 (MQ=255) aaaaaGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGtt > 1:1237252/1‑135 (MQ=37) aaaGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgttttgt < 1:1654947‑M1/134‑27 (MQ=255) aaaGTCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgttttgt < 2:1884789‑M1/134‑27 (MQ=255) tAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgttttgtcctgagtatt > 2:403182‑M1/1‑99 (MQ=255) aGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgttttgtcctgagtattagagaaac > 2:111408‑M1/1‑91 (MQ=255) aGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgttttgtcctgagtattagagaaac < 1:1651447‑M1/135‑45 (MQ=255) aTTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgttttgtcctgagtattagagaaacaca > 1:2043679‑M1/1‑88 (MQ=255) aTTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCa > 2:828433/1‑135 (MQ=37) aTTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCa > 1:283957/1‑135 (MQ=37) gAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCAATTTc > 1:198577/1‑135 (MQ=37) aaTTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCAATTTCaaaa < 2:2101173/135‑1 (MQ=37) aaTTTTGGGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCAATTTCaaaa < 2:2510918/135‑1 (MQ=37) tttGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCAATTTCAAAAAAt > 1:528066/1‑135 (MQ=38) gAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcatgggtttgtaatgagtattattgaaactaatgtaaaaatggttagtc > 2:2288759‑M1/1‑71 (MQ=255) 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cacaTTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgttttgtcctgagtattagagaaacaaatggaaaaatagttcctcatattttgccgtt < 1:422434‑M1/135‑78 (MQ=255) acaTTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgttttgtcctgagtattagagaaacaaatggaaaaatagttcctcatattttgccgttt > 1:1797630‑M1/1‑57 (MQ=255) tttttGCATTAATTTGGCTTAATTCCGATAAACTGGCTTTTGAACACCTTTTTTACCCAGAGGTCGTGTGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTTGCAATTTCAAAAAATATCTTCTAATGTTTGTTGAata < 1:1188604/135‑1 (MQ=14) tGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCAATTTCAAAAAATAGCTTCTCATGTTTGTTGAATAttgt > 2:2305527/1‑135 (MQ=255) tAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgttttgtcctgagtattagagaaacaaatggaaaaatagttcctcatattttgccgttttttgagctaa < 1:2305045‑M1/134‑89 (MQ=255) tAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgttttgtcctgagtattagagaaacaaatggaaaaatagttcctcatattttgccgttttttgagctaa < 1:1334458‑M1/134‑89 (MQ=255) tAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCAATTTCAAAAAATAGCTTCTCATGTTTGTTGAATAttgtgac < 1:861895/134‑1 (MQ=255) aaaTTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgttttgtcctgagtattagagaaacaaatggaaaaatagttcctcatattttgccgttttttgagctaata < 1:253708‑M1/135‑91 (MQ=255) ttGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCAATTTCAAAAAATAGCTTCTCATGTTTGTTGAATAttgtgacttgtga < 2:66875/135‑1 (MQ=255) tGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgttttgtcctgagtattagagaaacaaatggaaaaatagttcctcatattttgccgttttttgagctaataccgaa < 1:2410144‑M1/135‑96 (MQ=255) gCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATcagaggttgtaaaatcagtgttttgtcctgagtattagagaaacaaatggaaaaatagttcctcatattttgccgttttttgagctaataccgaagg < 2:346753‑M1/135‑98 (MQ=255) ttAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCAATTTCAAAAAATAGCTTCTCATGTTTGTTGAATATTGTGACTTGTGACCga < 2:791441/134‑1 (MQ=255) 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tataCCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCAATTTCAAAAAATAGCTTCTCATGTTTGTTGAATATTGTGACTTGTGACCGAGGAGTTGGCATGAGAACACCGTTTATTCGaaaa < 1:1043876/134‑1 (MQ=255) tataCCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCAATTTCAAAAAATAGCTTCTCATGTTTGTTGAATATTGTGACTTGTGACCGAGGAGTTGGCATGAGAACACCGTTTATTCGaaaa < 2:2350199/134‑1 (MQ=255) tataCCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCAATTTCAAAAAATAGCTTCTCATGTTTGTTGAATATTGTGACTTGTGACCGAGGAGTTGGCATGAGAACACCGTTTATTCGaaaa < 2:1974222/134‑1 (MQ=255) tataCCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCAATTTCAAAAAATAGCTTCTCATGTTTGTTGAATATTGTGACTTGTGACCGAGGAGTTGGCATGAGAACACCGTTTATTCGaaaa < 1:740524/134‑1 (MQ=255) tATcagaggttttaaaatcagtgttttgtcctgagtattagagaaacaaatggaaaaatagttcctcatattttgccgttttttgagctaataccgaaggacagctgattgaacactatttgttcggaaaaagtg < 2:1204541‑M1/135‑133 (MQ=255) tATcagaggttgtaaaatcagtgttttgtcctgagtattagagaaacaaatggaaaaatagttcctcatattttgccgttttttgagctaataccgaaggacagctgattgaacactatttgttcggaaaaagtg < 1:2270616‑M1/135‑133 (MQ=255) 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AGCACCGTTTAAAGAAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTATACCAAGAGGTCGTGAGCCTGCCGTTTAACTCTGAGTCACAAGTAGCAATTTCAAAAAATAGCTTCTCATGTTTGTTGAATATTGTGACTTGTGACCGAGGAGTTGGCATGAGAACACCGTTTATTCGAAAAAA > AssemblyC74_contig_16/21854‑22121 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |