| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_33 | = 3075 | 0 (0.000) | 176 (0.540) | 77/258 | 0.1 | 100% | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | hypothetical protein/– |
| ? | AssemblyC74_contig_4 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑2) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/Phage lysin, N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase (EC 3.5.1.28) | |||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
CTGTTACGAATGTAGGAACATCATCTGCAGCTAGATTTAATTTTGTTTTACCAAAGGGAGATAAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_33/2943‑3075‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCATACTGG > AssemblyC74_contig_4/1‑130 TGTTACGAATGTAGGAACATCATCTGCAGCTAGATTTAATTTTGTTTTACCAAAGGGAGATAAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTT > 2:2227081/1‑135 GTTACGAATGTAGGAACATCATCTGCAGCTAGATTTAATTTTGTTTTACCAAAGGGAGATAAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAACTGGTTTGATGTCTAACTTT < 2:295175/135‑1 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AACATCATCTGCAGCTAGATTTAATTTTGTTTTACCAAAGGGAGATAAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTAC > 1:1806468/1‑135 AACATCATCTGCAGCTAGATTTAATTTTGTTTTACCAAAGGGAGATAAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTAC > 2:338629/1‑135 TCATCTGCAGCTAGATTTAATTTTGTTTTACCAAAGGGAGATAAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAA < 1:230932/135‑1 TCATCTGCAGCTAGATTTAATTTTGTTTTACCAAAGGGAGATAAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAA > 1:1038506/1‑135 TCATCTGCAGCTAGATTTAATTTTGTTTTACCAAAGGGAGATAAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAA < 1:328741/135‑1 TCATCTGCAGCTAGATTTAATTTTGTTTTACCAAAGGGAGATAAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAA < 2:972155/135‑1 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AAAGGGAGATAAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATG > 1:1625202/1‑108 AAGGGAGATAAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGA < 1:850786/135‑1 AAGGGAGATAAAGGTGATACTGGAGAAATTGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGA < 1:1495203/135‑1 GAGATAAAGGTGAACCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACTACAGCAAATGGTTTTATTTCTAACTTTGCATGATTATCAACTTAAAAATGGCATTGAATTAAACGCAGAAAATCGAGAATGG > 1:2554655/1‑135 AAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATAT < 1:358840/135‑1 AAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAAT < 2:465085/133‑1 AAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAAT < 1:1574227/133‑1 AAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAAAGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATAT < 2:2003862/135‑1 AAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATG > 2:248626/1‑135 AAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATG > 2:1926798/1‑135 AAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATG > 2:1942738/1‑135 AAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATG > 2:812470/1‑135 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CTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTGTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGA > 1:1417823/1‑135 GAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAACTGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGAT < 2:5039/135‑1 GAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATG < 2:2523636/134‑1 GAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATG < 2:1972506/134‑1 AAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTA > 1:1263821/1‑135 AAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGGGGAGATGTA > 2:1910397/1‑135 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AATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGC < 2:1914803/132‑1 AATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGG < 1:1651877/130‑1 AATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGG < 1:535893/130‑1 AATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGG < 2:63997/130‑1 AATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGG < 1:561006/130‑1 ATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGC > 1:378763/1‑135 ATGGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGC < 1:812470/135‑1 GGTTTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCG > 1:2084195/1‑134 TTGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCA > 2:409401/1‑135 TGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCAT < 1:2413751/135‑1 TGATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCA < 1:947753/134‑1 ATGTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCA > 2:2379447/1‑132 GTCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCATACTG > 1:791895/1‑135 TCTAACTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCATACTGG < 2:1918223/135‑1 CTGTTACGAATGTAGGAACATCATCTGCAGCTAGATTTAATTTTGTTTTACCAAAGGGAGATAAAGGTGATCCTGGAGAAAATGCGACAACTACAGCAGTAGCAACAACGACAGCAAATGGTTTGATGTCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_33/2943‑3075‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCATACTGG > AssemblyC74_contig_4/1‑130 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |