New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AssemblyC74_contig_33 | = 3075 | 0 (0.000) | 176 (0.540) | 77/258 | 0.1 | 100% | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | hypothetical protein/– |
? | AssemblyC74_contig_4 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑2) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/Phage lysin, N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase (EC 3.5.1.28) |
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCATACTGGTATTT > AssemblyC74_contig_4/1‑135 | gttacgaatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCttt < 2:120705‑M2/4‑1 (MQ=255) gttacgaatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCttt < 2:475310‑M2/4‑1 (MQ=255) gttacgaatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCttt < 2:221626‑M2/4‑1 (MQ=255) gttacgaatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCtt > 1:1822376‑M2/132‑134 (MQ=255) 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catctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtgtgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTaaa > 1:1393209‑M2/113‑135 (MQ=255) atctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTaaaa > 2:862399‑M2/112‑135 (MQ=255) ctgcagctagatttaattttgttttaccaaggggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAAt > 1:1660228‑M2/110‑135 (MQ=255) ctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACttaaaagt > 2:2075587‑M2/110‑133 (MQ=255) ctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAAt > 2:2396111‑M2/110‑135 (MQ=255) ctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAAt > 1:1211099‑M2/110‑135 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCATACTGGTATTT > AssemblyC74_contig_4/1‑135 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |