| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_34 | 2046 = | 106 (0.480) | 162 (0.690) +T |
36/256 | 2.4 | 75.5% | intergenic (‑223/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | PaaD‑like protein (DUF59) involved in Fe‑S cluster assembly/– |
| ? | AssemblyC74_contig_35 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/Co‑activator of prophage gene expression IbrA | |||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_34/2107‑2046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTCAT > AssemblyC74_contig_35/1‑133 | tcctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTA < 2:1610606/131‑1tcctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTA < 1:304297/131‑1tcctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTA < 1:882162/131‑1tcctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTA < 2:2217478/131‑1 ctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAA > 1:1069060/3‑108 ctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAA < 2:1069060/106‑1 ATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAA < 1:670436/134‑1 ATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAA < 1:2459705/134‑1 ATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAA < 2:190681/134‑1 ATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAA < 1:1916623/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTACAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAAT < 1:2508634/135‑1 TTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATAT < 2:1089851/135‑1 TTTTCTTATAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATAT < 1:602452/135‑1 TAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAAT > 1:172246/1‑135 TAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAAT > 1:1992653/1‑135 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTT > 1:768299/1‑135 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTT < 2:918079/134‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTT < 1:370514/134‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTT < 1:290897/134‑1 ACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAA > 2:2173465/1‑135 ACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAA > 1:1295138/1‑135 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 2:1767311/135‑1 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 2:783452/135‑1 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 1:1180825/135‑1 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 2:13830/135‑1 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 1:1950237/135‑1 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 1:2165561/135‑1 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 2:36059/135‑1 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 1:1028336/135‑1 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTAGATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 2:2337837/135‑1 CACCTTAATTCTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGCCTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 2:2551678/135‑1 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACG > 1:1533003/1‑135 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACG > 2:2559905/1‑135 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACG > 2:26050/1‑135 CCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGT < 2:812655/135‑1 CTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTA < 2:1258233/135‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTCATCGTTTCAACGTAGA > 2:803801/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:1631740/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:1493484/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:1700413/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:1617861/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:1005207/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:204703/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:106909/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:180665/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:1338041/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:2495187/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:1174485/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:63359/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:544396/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:512151/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:1986659/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:944605/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:2092116/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:2092138/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:2472626/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:2281524/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:431448/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:451799/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:489289/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:644956/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTA > 1:2383312/1‑132 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 2:2075180/129‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 1:2054884/129‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTT < 2:915075/124‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTT > 1:915075/1‑124 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCG < 2:2104216/122‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAAATTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:1487484/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAA > 2:2326681/1‑77 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAA < 1:2326681/77‑1 AATTTTTCAGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:2030158/1‑134 TTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCC > 2:825480/1‑135 TTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCC > 2:587005/1‑135 TCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACAT < 2:1549616/135‑1 TCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACAT > 1:1653461/1‑135 TCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 1:1507101/119‑1 TAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATT < 1:1103939/134‑1 AGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACATGATTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTT > 1:1024691/1‑135 ATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCT > 1:928932/1‑135 ATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCT < 1:1326859/135‑1 ATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCT < 1:1516583/135‑1 TTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTG < 2:1375540/135‑1 CCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCC > 1:259998/1‑135 TATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCTTCTGAAATCCTg > 1:2037717/1‑134 TATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTT > 1:2063817/1‑135 TATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTT > 1:1213780/1‑135 TATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTT > 1:1362619/1‑135 TATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTT > 2:4421/1‑135 TATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTT > 1:1642890/1‑135 TATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCT < 1:648266/134‑1 TATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCG > 2:2223318/1‑95 TATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCG < 1:2223318/95‑1 ATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTT > 1:564143/1‑134 ATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTT > 1:2319256/1‑134 CCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTC > 2:1129791/1‑135 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTCAT > 2:1249270/1‑135 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTCAT > 2:1371724/1‑135 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 2:728998/97‑1 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC > 1:728998/1‑97 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACT > 1:1869970/1‑55 | ‑‑‑‑GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_34/2107‑2046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTCAT > AssemblyC74_contig_35/1‑133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |