| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_34 | 2046 = | 106 (0.480) | 162 (0.690) +T |
36/256 | 2.4 | 75.5% | intergenic (‑223/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | PaaD‑like protein (DUF59) involved in Fe‑S cluster assembly/– |
| ? | AssemblyC74_contig_35 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/Co‑activator of prophage gene expression IbrA | |||||
Only 100 of 1184 total aligned reads displayed.
CCAGAAGCCAAAATTCTGTTCTTTTTATTAACTTTTGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_34/1912‑2107 | tgtgttcgatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattat < 1:1594812‑M2/1‑1 (MQ=255)tgtgttcgatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattat < 1:62001‑M2/1‑1 (MQ=255)atgaaaaggatttcagatgaaaatgtataggattctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctat > 1:1514235‑M1/135‑135 (MQ=255) gtgttcgatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTg > 1:2401783‑M2/134‑135 (MQ=255) tcgagctcaagaaagtttaaatcgctatactacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTgg < 1:594808‑M1/3‑1 (MQ=255) gatttatatcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTgg < 2:1902897‑M1/3‑1 (MQ=255) ttatatcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGAt > 1:649959‑M1/130‑134 (MQ=255) aatgatttcagatgaaaatgtataggattctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATa > 1:27193‑M1/130‑135 (MQ=255) cgatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATa < 1:2329594‑M2/6‑1 (MQ=255) tccacaatatgaaatttctaaagaatgcctagaaattctggaaaactccgtagatgcaaaaggtcgaaatattcatgtaacaaaattgcatgtgcctaagcctatacttattaacgaaaaagaaagtTGGATa > 2:1732413‑M2/128‑133 (MQ=255) gatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatgtaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATa > 2:416972‑M2/128‑133 (MQ=255) gatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATa > 2:46350‑M2/128‑133 (MQ=255) gatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATa > 2:2039539‑M2/128‑133 (MQ=255) gatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATa > 1:1056652‑M2/128‑133 (MQ=255) tcaagaaagtttaaatcgctatactacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATa < 1:2275263‑M1/6‑1 (MQ=255) tcaagaaagtttaaatcgctatactacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATa > 2:2275263‑M1/127‑132 (MQ=255) ccacaatatgaaatttctaaagaatgcctagaaattctggaaaactccgtagatgcaaaaggtcgaaatattcatgtaacaaaattgcatgtgcctaagcctatacttattaacgaaaaagaaagtTGGATAGGc > 1:2032758‑M2/127‑135 (MQ=255) caagaaagtttaaatcgctatactacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAgg > 2:671759‑M1/126‑133 (MQ=255) tttcagatgaaaatgtataggattctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTa < 1:1338041‑M1/11‑1 (MQ=255) tcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTa < 2:872315‑M1/11‑1 (MQ=255) tcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTa < 1:682993‑M1/11‑1 (MQ=255) atataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCt < 2:1310739‑M2/10‑1 (MQ=255) gtaatttttttatgatattattttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACaa > 2:609587‑M2/122‑135 (MQ=255) tattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAAtt < 2:2403324‑M1/16‑1 (MQ=255) aaaatgtataggattctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagaatcatgtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACt > 1:1024691‑M1/116‑135 (MQ=255) gaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGa > 1:483077‑M2/113‑135 (MQ=255) atgtataggattctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGa > 2:2558505‑M1/113‑135 (MQ=255) ggattctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGaaaa > 2:825480‑M1/106‑135 (MQ=255) ttattttcatacgaacgtagtaatatatctattgataaatgtttattaaaataatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGaaaaa < 2:2234525‑M2/31‑1 (MQ=255) actacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccatatatgattggaaTGGATAGTCTACAATTAACTAGACAGaaaaa < 2:2196776‑M1/31‑1 (MQ=255) ttttGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:2169433/135‑1 (MQ=255) ttttGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:335541/135‑1 (MQ=255) ttttGTAGGTTTATGATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:1137367/135‑1 (MQ=255) tgttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtagagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:148676‑M2/33‑1 (MQ=255) tacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 2:201272‑M1/103‑135 (MQ=255) tacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 2:28175‑M1/103‑135 (MQ=255) tacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 1:919234‑M1/103‑135 (MQ=255) tacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataataattttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 1:1740771‑M1/103‑135 (MQ=255) gtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 1:1088236‑M1/103‑135 (MQ=255) ggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:2513538‑M2/33‑1 (MQ=255) ggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:154863‑M2/33‑1 (MQ=255) ggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:1225852‑M2/33‑1 (MQ=255) ggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:860937‑M2/33‑1 (MQ=255) attttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:713051‑M2/33‑1 (MQ=255) attttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:746372‑M2/33‑1 (MQ=255) attttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:1077567‑M2/33‑1 (MQ=255) attttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:1232428‑M2/33‑1 (MQ=255) attttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:1926577‑M2/33‑1 (MQ=255) attttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgaatattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:422159‑M2/33‑1 (MQ=255) tctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 2:1493484‑M1/102‑134 (MQ=255) tctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 1:1986659‑M1/102‑134 (MQ=255) tctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 2:1700413‑M1/102‑134 (MQ=255) aagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGaaaa > 1:2117187‑M1/101‑130 (MQ=255) aagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 1:1200654‑M1/101‑133 (MQ=255) aagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 2:2364915‑M1/101‑133 (MQ=255) aagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 1:1766534‑M1/101‑133 (MQ=255) tatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgtgt > 2:2465963‑M2/96‑135 (MQ=255) ccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgt > 1:2450171‑M1/96‑133 (MQ=255) ttctggaaaactccgtagatgcaaaaggtcgaaatattcatgtaacaaaattgcatgtgcctaagcctatacttattaacgacaaagaaagtTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 1:1878789‑M2/43‑1 (MQ=255) agaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTATACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 2:1257088‑M1/43‑1 (MQ=255) agaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgt > 2:1629098‑M1/93‑130 (MQ=255) agaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 1:1656862‑M1/43‑1 (MQ=255) agaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 1:1842557‑M1/43‑1 (MQ=255) agaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 2:2331053‑M1/43‑1 (MQ=255) actggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 2:2136875‑M2/43‑1 (MQ=255) actggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 2:923007‑M2/43‑1 (MQ=255) gatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACt > 1:369805‑M2/89‑135 (MQ=255) gaaaactccgtagatgcaaaaggtcgaaatattcatgtaacaaaattgcatgtgcctaagcctatacttattaacgaaaaagaaagtTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTa < 1:1391808‑M2/48‑1 (MQ=255) atgggagatagaagagttaaaaattgaaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTa > 1:2498253‑M2/88‑135 (MQ=255) ggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTagaa > 2:796857‑M2/85‑135 (MQ=255) attaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTagaa < 1:2221478‑M1/51‑1 (MQ=255) attaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTagaa > 2:1034686‑M1/85‑135 (MQ=255) cAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAgaagaa > 2:536054/1‑135 (MQ=255) gtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAgaagaa < 1:1270378‑M1/54‑1 (MQ=255) attttctaactgttttattattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATAAAGTTGTGTAGACTAgaagaa < 1:1710434‑M1/54‑1 (MQ=255) atagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAgaagaa > 1:754325‑M2/81‑134 (MQ=255) aaaaaaTGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAtaagaa > 2:1658563/1‑134 (MQ=255) agagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTagaa > 2:1450339‑M2/76‑126 (MQ=255) agagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAt > 2:2109028‑M2/76‑134 (MQ=255) atgcaaaaggtcgaaatattcatgtaacaaaattgcatgtgcctaagcctatacttattaacgaaaaagaaagtTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATAc > 1:556059‑M2/75‑135 (MQ=255) tttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAtaccag < 1:2355216‑M1/64‑3 (MQ=255) gttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattctgtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAtaccag > 2:376511‑M2/72‑133 (MQ=255) gttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACTGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAtaccag > 1:2555238‑M2/72‑133 (MQ=255) gttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAtaccag > 1:1799905‑M2/72‑133 (MQ=255) ctgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAtaccag > 1:305181‑M1/72‑133 (MQ=255) taaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACataccagg > 2:1945543‑M2/71‑132 (MQ=255) aaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAacataccaggag > 2:177786‑M2/69‑130 (MQ=255) tCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatt < 1:80572‑M1/135‑11 (MQ=255) aaTAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtc > 1:1440663‑M1/1‑117 (MQ=255) gaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattat < 2:1400138‑M2/1‑1 (MQ=255) aCTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaag > 2:1178735‑M1/1‑100 (MQ=255) ccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGa < 1:100079‑M2/23‑1 (MQ=255) gagaACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaacttttt > 2:1359843‑M1/1‑93 (MQ=255) cttcttATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagca < 1:1305318‑M1/135‑58 (MQ=255) aGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:1135659/37‑1 (MQ=255) aatggATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaatcgtcaatc > 2:1832068‑M1/3‑64 (MQ=255) ttgGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaatcgtcaatct < 1:974744‑M1/134‑73 (MQ=255) atgGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaatcgtcaatct < 2:1562921‑M1/134‑73 (MQ=255) tGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttc < 2:2069456‑M1/104‑43 (MQ=255) tGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttc > 1:2069456‑M1/1‑62 (MQ=255) | CCAGAAGCCAAAATTCTGTTCTTTTTATTAACTTTTGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_34/1912‑2107 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |