| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_34 | 2046 = | 106 (0.480) | 158 (0.680) +T |
33/256 | 2.9 | 75.0% | intergenic (‑223/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | PaaD‑like protein (DUF59) involved in Fe‑S cluster assembly/– |
| ? | AssemblyC74_contig_56 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Co‑activator of prophage gene expression IbrA | |||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
‑‑GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_34/2107‑2046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAATT > AssemblyC74_contig_56/1‑134 | ctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAA < 1:2355216/133‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 2:2049574/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 1:1572416/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 1:1538680/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 2:2237748/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 1:1822755/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 2:2266993/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 2:2371615/134‑1 TTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTA > 2:117002/1‑135 CTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATT < 1:810495/135‑1 AGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTAT > 2:2014257/1‑135 GTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTTTAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATT < 2:851870/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATCTAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:520928/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:1922191/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:1928819/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:2297772/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:1678946/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:156989/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:2176095/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:173015/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:1656861/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:2139390/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:2238156/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:1373192/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:396688/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:994542/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAAC < 1:1842236/101‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAAC > 2:1842236/1‑101 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAAATCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCAAAGTATTATTTat > 2:1047219/1‑133 TACACACCTTAATTTTTCTGTATAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:1257088/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTACTTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGGTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 2:2326746/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 1:575537/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 1:1048463/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 2:2540539/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 2:435783/135‑1 CACACCTTAAATTTTCTGTCTAGTTAATTGTATCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 1:1984128/135‑1 CACAACTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCAGATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 1:1893877/135‑1 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAA < 1:223197/135‑1 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGT > 2:1202521/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATCTAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGGATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:277003/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAATTATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:1740771/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:1567390/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:1486653/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:201272/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:1193864/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:289766/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:493095/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:919234/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:942835/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:125160/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:1266234/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:1402595/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:1418416/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:1584687/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:1768736/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:2370634/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:1776487/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:2117142/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:876120/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:2038823/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAA > 2:868299/1‑130 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:605970/125‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT > 1:605970/1‑125 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATGATTTCTAGTAACTGTA > 1:1024549/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATG > 1:65844/1‑71 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCAATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:774678/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAAGAGTAGCCTATCAATTCCAATCCTATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTCTAGCTATCACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATGATTTCTAGTAACTGga > 2:1908914/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTAAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATAAAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:1287134/1‑135 TTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGT < 2:2562104/135‑1 TTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGACTATCCATTCCAATCATATATGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGT < 2:2196776/135‑1 TTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTA > 1:1530099/1‑135 TTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGAT < 2:2470135/96‑1 TGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCG > 2:1695362/1‑135 TCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAATAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTATTATATCGAT > 2:2491367/1‑135 AGCCTATCCATTCCAATCATATAGGTGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACTAATATATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTG > 1:317099/1‑135 AGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTG > 2:68779/1‑135 AGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTG > 1:2286644/1‑135 GCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGA < 1:117002/135‑1 CCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTG > 2:671759/1‑133 TATCAATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATATATCCAAACATCTTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATATAGATTTAAACTTTATTGAG > 2:760031/1‑133 ATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTC < 1:1926467/135‑1 CCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 2:2437098/135‑1 CCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 2:876120/135‑1 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ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 1:1197833/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 1:816387/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 1:479870/133‑1 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 1:2546575/133‑1 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA > 2:479870/1‑133 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGAAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 2:1640087/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 1:166941/77‑1 ATTCAAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAAATCTAAAGATATAACGAAAAGAACCAAACATCTTCAAAGTATAATTTCTAGTAACTGTATTATAGCGATTTAAAATTTCTTGAGCTCGAA > 2:2314505/1‑134 TTCCAATCATTTAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAATT < 2:888775/135‑1 TTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAATT < 1:1442603/135‑1 TTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAATT < 1:1986829/135‑1 | ‑‑GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_34/2107‑2046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAATT > AssemblyC74_contig_56/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |