New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_40 | = 1604 | 0 (0.000) | 177 (0.490) | 57/258 | 0.8 | 100% | intergenic (‑113/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | hypothetical protein/– |
? | AssemblyC74_contig_52 | = 702 | 0 (0.000) | intergenic (+23/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Putative transposase InsK for insertion sequence element IS150/– |
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
AATAAATGTAATTCTTCCAACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_40/1472‑1604 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTTTGAAATA < AssemblyC74_contig_52/702‑570 AATAAATGTAATTCTTCCAACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATG < 1:1123810/135‑1 TAAATGTAATTCTTCCAACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAA < 1:2064474/135‑1 TAAATGTAATTCTTCCAACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAA < 1:1601213/135‑1 CCAACAGCCGATTCTCCGATAATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAAATAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAG < 1:807357/135‑1 AACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTT < 2:2465881/135‑1 AACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTT < 2:1078570/135‑1 AACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTT < 1:1538910/135‑1 AACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTCAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTT < 2:909238/135‑1 AACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTGTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTT < 2:789382/135‑1 AACAGCCGCTTCTACGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTT < 2:372509/135‑1 ACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTG > 2:1540345/1‑135 ACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTG > 2:73683/1‑135 ACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTG > 1:1735659/1‑135 ACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTG > 2:571092/1‑135 CTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTT > 1:227591/1‑127 TCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAAT < 2:1933865/135‑1 TCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAAT < 1:826131/135‑1 TGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTC > 2:684669/1‑135 TTATAAATATTTGTTAATTTTACATATTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTTCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTTCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCG < 1:1797265/135‑1 TTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCG < 2:886924/135‑1 TTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCG < 1:684669/135‑1 TTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCG < 1:2467686/135‑1 TTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCG < 1:2175608/135‑1 TTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCG < 1:241724/135‑1 TTATAAATATATGTTAAATTTACATCTTAGCCGACTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCG < 1:538920/135‑1 ATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGAT < 2:293896/135‑1 ATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGAT < 2:2509688/135‑1 TAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATA > 1:528986/1‑135 TAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATA > 2:1049413/1‑135 ATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTC < 1:1034951/135‑1 ATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTC < 2:599200/135‑1 TATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCT < 1:564405/135‑1 TTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGA > 2:2402260/1‑135 AATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAG < 2:701134/134‑1 AATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAG < 1:1724531/134‑1 TTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATA > 2:2537213/1‑134 TCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATT > 2:2317123/1‑135 TAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAA < 1:267583/135‑1 TAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAA < 1:60335/135‑1 TAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAA < 1:1684035/135‑1 TAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAACTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAA < 1:1953253/135‑1 CGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTT > 1:352812/1‑135 ATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTT > 1:1031709/1‑134 TAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTAT < 2:1945414/135‑1 ACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCC < 1:1557151/135‑1 ACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCC < 2:529007/135‑1 ATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTACTTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTACTGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTT < 1:399526/135‑1 CTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTT > 1:731929/1‑135 CTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTT > 2:1484811/1‑135 CTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTT > 1:2487906/1‑135 CTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTT > 1:760329/1‑135 CTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTT > 1:1665572/1‑135 CTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTT > 2:136465/1‑135 CTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTT > 1:1143307/1‑135 CTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCC < 2:2565727/128‑1 CTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCC > 1:2565727/1‑128 AAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTAT > 1:1190208/1‑135 aacTTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCACAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATT < 1:553425/132‑1 AAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATT < 1:902822/135‑1 AAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATT < 2:2175880/135‑1 AAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATT < 2:1562494/135‑1 AAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATT < 2:1735659/135‑1 AAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATT < 2:2142764/135‑1 AAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATT < 1:1538248/135‑1 AATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAG‑TTTATCCTTTTGTTATTAT < 2:1389700/135‑1 ATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTAT < 1:857355/135‑1 ATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTAT < 1:1049483/135‑1 ATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTAT < 1:2317123/135‑1 ATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTAT < 1:1924453/135‑1 ATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTAT < 1:1831051/135‑1 TGCATATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATAC < 1:1028268/135‑1 TGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATAC < 2:1252199/135‑1 GCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATAC > 2:2000523/1‑134 TAATTATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACT > 1:1870759/1‑135 ATATGTACTGCCCCTCACTGAACTGAACCCCAAACGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTT < 2:2534569/135‑1 ATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTT > 1:877629/1‑135 ATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATAAACTCATTT > 1:706649/1‑135 ATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACAACCTAATATACTCATTT > 1:2140028/1‑135 ATATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATAC < 1:1841511/117‑1 TATGTACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTT < 1:645257/37‑1 TACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTAGAACTATTTAATGTAATGTTTCCGATATTCTACTGGAGATACTCCATTTAACTTTAGTTTTTTCCTTTAGTTATTATACAAAATAATATACTCATTTAATg > 1:748062/1‑133 ACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATAC > 2:1868828/1‑111 ACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATAC < 1:1868828/111‑1 ACTGCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCC < 2:1816039/97‑1 GCCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTT < 1:686453/135‑1 CCCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTTT > 2:741633/1‑135 CCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATCTTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTCAGATACTCATTTAATGTACTTTG > 2:2430147/1‑135 CCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTTTG > 1:772464/1‑135 CCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTTTG > 1:990124/1‑135 CCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTTTG > 1:952432/1‑135 CCCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTTTG > 2:1920269/1‑135 CCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTTTG < 2:2219004/134‑1 CCTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATT > 2:505512/1‑101 CTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTTTGta > 2:123650/1‑133 CTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTTTGAA > 1:1470960/1‑135 CTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTTTGAA > 1:2373020/1‑135 CTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTTTGAA > 1:495870/1‑135 CTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTTTGAA > 2:1130388/1‑135 CTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTTTGAA > 2:439865/1‑135 CTCAATGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAAT > 2:645257/1‑37 AATAAATGTAATTCTTCCAACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_40/1472‑1604 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAACTGAACCCCAAAAGTTGAACTATTTAATGGACTGTTTCCGATATTCTACTGGAGATAGTCCATTTAACTTTAGTTTTATCCTTTTGTTATTATACCACCTAATATACTCATTTAATTTACTTTGAAATA < AssemblyC74_contig_52/702‑570 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |