| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AssemblyC74_contig_40 | = 1604 | 0 (0.000) | 177 (0.490) | 57/258 | 0.8 | 100% | intergenic (‑113/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | hypothetical protein/– |
| ? | AssemblyC74_contig_52 | = 702 | 0 (0.000) | intergenic (+23/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Putative transposase InsK for insertion sequence element IS150/– | |||||
Only 100 of 448 total aligned reads displayed.
ATATTTCAAAGTAAATTAAATGAGTATATTAGGTGGTATAATAACAAAAGGATAAAACTAAAGTTAAATGGACTATCTCCAGTAGAATATCGGAAACAGTCCATTAAATAGTTCAACTTTTGGGGTTCAGTTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_52/569‑702 | atatTTCAAAGTAAATTAAATGAGTATATTAGGTGGTATAATAACAAAAGGATAAAACTAAAGTTAAATGGACTATCTCCAGTAGAATATCGGAAACAGTCCATTAAATAGTTCAACTTTTGGGgttcagttca < 2:2238208/134‑1 (MQ=255)atatTTCAAAGTAAATTAAATGAGTATATTAGGTGGTATAATAACAAAAGGATAAAACTAAAGTTAAATGGACTATCTCCAGTAGAATATCGGAAACAGTCCATTAAATAGTTCAACTTTTGGGgttcagttca < 2:666147/134‑1 (MQ=255)atatTTCAAAGTAAATTAAATGAGTATATTAGGTGGTATAATAACAAAAGGATAAAACTAAAGTTAAATGGACTATCTCCAGTAGAATATCGGAAACAGTCCATTAAATAGTTCAACTTTTGGGgttcagttca < 2:2447679/134‑1 (MQ=255) ttCAAAGTAAATTAAATGAGTATATTAGGTGGTATAATAACAAAAGGATAAAACTAAAGTTAAATGGACTATCTCCAGTAGAATATCGGAAACAGTCCATTAAATAGTTCAACTTTTGGGGTTCAGTTCAttgag > 1:709091‑M2/1‑130 (MQ=255) 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ATATTTCAAAGTAAATTAAATGAGTATATTAGGTGGTATAATAACAAAAGGATAAAACTAAAGTTAAATGGACTATCTCCAGTAGAATATCGGAAACAGTCCATTAAATAGTTCAACTTTTGGGGTTCAGTTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_52/569‑702 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |