New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_51 | = 723 | 0 (0.000) | 206 (0.460) | 59/258 | 0.0 | 65.4% | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity/– | Conserved domain protein/– |
? | AssemblyC74_contig_61 | = 87 | 218 (0.360) | coding (336/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
GTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_51/593‑723 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAAT < AssemblyC74_contig_61/87‑3 GTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATG > 1:2491610/1‑135 TCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAATTGTTACGAATATGA > 2:2169423/1‑135 TCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGA > 1:96337/1‑135 TCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGA > 1:2057066/1‑135 TCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGA > 2:562431/1‑135 TCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACATCAAATGTTACGAATATGA < 1:1601462/135‑1 CTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAA > 2:651960/1‑135 CTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATT < 2:1146502/135‑1 CTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATT < 1:27077/135‑1 TTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTC > 2:109676/1‑135 AGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAATTGTTACGAATATGAATTCTATGTTT < 1:1284055/135‑1 AGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAATGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGG > 2:1699134/1‑135 AGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATATAGTATATGTTTAATGGATGTATTAGTTTAACTACCTTGGATGTAATCAAATGGGATACTTCAAATGTTAAGAATATGAATTATATGTTTTAT > 2:2022397/1‑133 AGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTAT > 1:1270650/1‑133 GATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGAAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAAATCTATGTTTTAT > 2:805308/1‑132 GTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCT < 2:51465/133‑1 GTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCT < 1:562431/133‑1 GTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCT < 1:1713502/133‑1 AGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGG > 1:415292/1‑134 AGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGG > 1:2200282/1‑134 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 1:216066/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 2:24258/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 2:742874/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 1:1504637/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 1:824905/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 1:785554/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 2:160697/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTT > 2:1775385/1‑120 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCAGTAGTAGATTAACTACCATTGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACTAATATGAATTCTATGATTTATGGCTGTGGCTCT > 2:313348/1‑135 ATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTC < 2:646185/133‑1 tttGAATACGTCGAATGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATTGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCTAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:1071734/132‑1 TTGGAATACGTCGAATGTAAATTATATAGAGTATATGTATAATGTCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTAATAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:498545/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:259623/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:759290/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:90661/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:724293/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:376733/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:312943/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:2317950/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:2491610/135‑1 TTGGAATACGTAGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:1195582/135‑1 GGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAA > 2:2206944/1‑135 GGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAA > 1:2563076/1‑135 GAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAAC > 1:1358717/1‑135 GAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAAC > 1:857041/1‑135 ATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACG < 2:1270650/134‑1 TACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGA < 1:1454459/134‑1 TACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGA < 2:2253021/134‑1 CGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTG > 2:1892540/1‑135 CGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGAAAATGGGATACGTCATATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAG > 2:1231907/1‑135 GAATGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGA < 2:888754/135‑1 GAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGATTATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGA < 1:1336911/135‑1 GAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGA > 2:1340214/1‑135 GAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGC < 2:1839757/118‑1 AAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGAT > 2:1547935/1‑135 TATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTG < 2:800193/135‑1 ATAGAGTCTAAGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGG < 1:2353129/135‑1 ttttTGTTTATTGGATGTAGTAGTTTTACTAGCTTTTTTGTAAGCAATTGGGATACGTCTAATGTTACTAATATGAATTATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG < 2:2137779/131‑1 ATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGT > 2:2071484/1‑135 ATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGT > 1:2473213/1‑135 TATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG < 1:344400/133‑1 TATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG < 2:1933533/133‑1 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCG > 1:1819172/1‑135 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCG > 1:1883909/1‑135 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCG > 2:139172/1‑135 TTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAG > 2:863463/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTATATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 2:1486657/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 2:610394/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 2:2327018/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 1:2236462/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 2:236008/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 1:1034938/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 1:727522/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 1:748683/1‑135 GCTGTCGTTGTTTAACTACCTTGGATGTACGAAAATGGGATACGTCAAATGTTACGTATATGAATTCTATGTTTTATTGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTT < 2:118898/135‑1 GCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTCACGAGTGTAGATGTAAGTACTTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 2:360747/1‑133 GCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 1:523499/1‑133 GCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGG < 2:642793/129‑1 GCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGG > 1:642793/1‑129 TGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATCCGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTC < 2:785480/134‑1 TGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTC < 2:68623/134‑1 TGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTC < 1:742874/134‑1 GTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTA < 1:109676/135‑1 GTAGTAGATTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTA < 2:2478094/135‑1 TAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTAT > 2:2350067/1‑135 AGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTAT > 1:1980483/1‑134 AGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTAT > 1:458513/1‑134 GTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTAT > 1:1839842/1‑133 GTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAct < 2:415292/134‑3 AACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAct > 1:1112946/1‑128 AACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAct < 2:1112946/130‑3 GGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCT > 1:2095080/1‑59 GGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCT < 2:2095080/59‑1 CAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTG > 2:579656/1‑51 CAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTG < 1:579656/51‑1 GGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTG < 1:301538/78‑1 GGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTG > 2:301538/1‑78 TTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:1157342/40‑1 AATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAA < 1:1047941/37‑1 AATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT > 2:1047090/1‑35 GTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_51/593‑723 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAAT < AssemblyC74_contig_61/87‑3 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |