| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_51 | = 723 | 0 (0.000) | 206 (0.460) | 59/258 | 0.0 | 65.4% | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity/– | Conserved domain protein/– |
| ? | AssemblyC74_contig_61 | = 87 | 218 (0.360) | coding (336/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
TGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_51/590‑723 | tgtgTCTCTTTACCGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGaa < 2:2110903/134‑1 (MQ=255)tgtgTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGaa < 2:250295/134‑1 (MQ=255)tgtgTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGaa < 1:2432235/134‑1 (MQ=255)tgtgTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGaa < 1:2141453/134‑1 (MQ=255)tgtgTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGaa < 1:1792387/134‑1 (MQ=255) gtCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatg > 1:2491265‑M1/1‑131 (MQ=255) tctcTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatga > 1:2057066‑M1/1‑130 (MQ=255) tctcTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatga < 1:937820‑M1/135‑6 (MQ=255) tctcTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACATCAAATGTTACGAAtatga < 1:1601462‑M1/135‑6 (MQ=255) tctTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaat < 2:626527‑M1/135‑8 (MQ=255) ctTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaatt < 1:27077‑M1/135‑9 (MQ=255) ctTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaatt < 2:1269928‑M1/135‑9 (MQ=255) tttAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattc > 2:1195582‑M1/1‑126 (MQ=255) aaCGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTAACTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAATTGTTACGAAtctgaattctat > 2:2053654‑M1/1‑123 (MQ=255) gAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgtt < 2:1156749‑M1/135‑16 (MQ=255) aGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAATGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatgg > 2:1699134‑M1/1‑114 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGAAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaaatctatgttttat > 2:805308‑M1/1‑113 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAAATATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttat > 1:800193‑M1/1‑113 (MQ=255) gtaagtaaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggct < 1:562431‑M1/133‑24 (MQ=255) gtaagtaaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggct < 1:1713502‑M1/133‑24 (MQ=255) gtaagtaaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggct < 2:420422‑M1/133‑24 (MQ=255) gtaagtaaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggct < 2:51465‑M1/133‑24 (MQ=255) gtaagtaaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggct < 1:875534‑M1/133‑24 (MQ=255) gtaagtaaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggct < 2:1125581‑M1/133‑24 (MQ=255) agtaaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtgg > 1:2200282‑M1/1‑107 (MQ=255) agtaaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtgg > 1:415292‑M1/1‑107 (MQ=255) aaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctct > 2:742874‑M1/1‑104 (MQ=255) aaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctct > 2:160697‑M1/1‑104 (MQ=255) aaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctct > 1:1504637‑M1/1‑104 (MQ=255) aaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctct > 2:24258‑M1/1‑104 (MQ=255) aaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctct > 1:785480‑M1/1‑104 (MQ=255) aaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctct > 2:35440‑M1/1‑104 (MQ=255) aaTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttt > 2:1775385‑M1/1‑104 (MQ=255) aTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctc < 2:646180‑M1/133‑31 (MQ=255) aTTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctc < 2:646375‑M1/133‑31 (MQ=255) ttGGAATACGTCGAATGTAAATTATATAGAGTATATGTATAATGTCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTAATAAtatgaattctatgttttatggctgtggctcttt < 1:498545‑M1/135‑34 (MQ=255) ttGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGTATGTACGCAAATGGGATACGTGATATGTTACGAAtatgaattctatgttttttggctgtggctcttt < 2:312079‑M1/135‑34 (MQ=255) ttGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctcttt < 2:2491265‑M1/135‑34 (MQ=255) ttGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctcttt < 1:376733‑M1/135‑34 (MQ=255) ttGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctcttt < 1:312943‑M1/135‑34 (MQ=255) ttGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctcttt < 2:759290‑M1/135‑34 (MQ=255) ttGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctcttt < 1:2317950‑M1/135‑34 (MQ=255) ttGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctcttt < 1:451469‑M1/135‑34 (MQ=255) gAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaac > 1:1358717‑M1/1‑99 (MQ=255) tACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacga < 2:2253021‑M1/134‑39 (MQ=255) tACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacga < 1:1454459‑M1/134‑39 (MQ=255) tACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacga < 2:1110380‑M1/134‑39 (MQ=255) cGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtg > 2:1892540‑M1/1‑94 (MQ=255) gTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgt > 1:848067‑M1/1‑93 (MQ=255) gAATGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaga < 2:888754‑M1/135‑46 (MQ=255) gAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGATtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaga < 1:1336911‑M1/135‑46 (MQ=255) gAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggc > 1:1839757‑M1/1‑90 (MQ=255) gAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggc < 2:1839757‑M1/118‑29 (MQ=255) aaGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagat > 2:1547935‑M1/1‑89 (MQ=255) ggTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgt < 1:1272133‑M1/135‑49 (MQ=255) tataGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattg < 2:800193‑M1/135‑58 (MQ=255) ataGAGTCTAAGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgg < 1:2353129‑M1/135‑59 (MQ=255) atatGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt > 2:2141616‑M1/1‑70 (MQ=255) atatGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt > 2:2071484‑M1/1‑70 (MQ=255) atatGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt > 2:27678‑M1/1‑70 (MQ=255) atatGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgtgttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt > 1:1854656‑M1/1‑70 (MQ=255) tatGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttctggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacg < 1:1936394‑M1/133‑65 (MQ=255) tatGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacg < 2:1343808‑M1/133‑65 (MQ=255) tatGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacg < 2:657472‑M1/133‑65 (MQ=255) tatGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacg < 1:344400‑M1/133‑65 (MQ=255) gTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaa < 2:1084009‑M1/135‑70 (MQ=255) tttAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaag > 2:863463‑M1/1‑65 (MQ=255) tAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaagg < 2:585599‑M1/134‑72 (MQ=255) tGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtatatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttac > 2:1486657‑M1/1‑60 (MQ=255) tGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttac > 1:1152513‑M1/1‑60 (MQ=255) tGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttac > 1:1034938‑M1/1‑60 (MQ=255) tGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttac > 1:2236462‑M1/1‑60 (MQ=255) tGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttac > 2:2327018‑M1/1‑60 (MQ=255) tGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttac > 2:236008‑M1/1‑60 (MQ=255) tGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttac > 1:2513185‑M1/1‑60 (MQ=255) tGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttac > 2:1993274‑M1/1‑60 (MQ=255) tGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttac > 1:727522‑M1/1‑60 (MQ=255) ggCTTTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTTATCATCTGTGATACGTAAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttact < 2:567983‑M1/135‑77 (MQ=255) gCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttac > 1:523499‑M1/1‑58 (MQ=255) gCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttac > 1:1174510‑M1/1‑58 (MQ=255) gCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaagg > 1:642793‑M1/1‑58 (MQ=255) tGTCGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttc < 2:1307720‑M1/134‑79 (MQ=255) tGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATCCGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttc < 2:785480‑M1/134‑79 (MQ=255) tGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttc < 1:742874‑M1/134‑79 (MQ=255) tGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttc < 1:1250460‑M1/134‑79 (MQ=255) gtagtaGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttcta < 1:109676‑M1/135‑81 (MQ=255) gtagtaGATTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttcta < 2:2478094‑M1/135‑81 (MQ=255) tagtagTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctat > 2:2350067‑M1/1‑54 (MQ=255) agtagtTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctat > 1:1980483‑M1/1‑53 (MQ=255) gtagtTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatg < 2:707001‑M1/134‑83 (MQ=255) gtTTAACTAGCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCTAATGTTACGAAtatgatttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgact < 2:103710‑M1/134‑86 (MQ=255) gtTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgact < 2:2178686‑M1/134‑86 (MQ=255) aaCTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgact > 1:1112946‑M1/1‑45 (MQ=255) ggATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggct > 1:2095080‑M1/1‑36 (MQ=255) ggATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggct < 2:2095080‑M1/59‑24 (MQ=255) cAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctg < 1:579656‑M1/51‑25 (MQ=255) ggATACGTCAAATGTTACGAAtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattg < 1:301538‑M1/78‑58 (MQ=255) aatatgaattctatgttttatggttgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacg < 2:365686‑M1/66‑65 (MQ=255) aatatgaattctatgttttatggctgtggctctttaa > 2:1047941‑M1/1‑2 (MQ=255) aatatgaattctatgttttatggctgtggctctttaa < 1:1047941‑M1/37‑36 (MQ=255) | TGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_51/590‑723 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |