| New junction evidence | |||||||||||
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AGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACTAATAAAACAAGCAATGACAATGGAAAC > AssemblyC74_contig_24/183‑449 | tttACAGATTCGACCTCTTCAACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACt < 2:2042331/133‑1 (MQ=18) agatccgattcatcaacttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatatcacggacacatcagCTTCa > 1:1278648‑M1/131‑135 (MQ=255) gctcagattcatcaacttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaatcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagCTTCaa < 1:143789‑M1/6‑1 (MQ=255) cAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCGACCACTACAAGTGATAGCACGGACACCTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTc < 2:2232840/133‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |