New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_24 | 316 = | 292 (1.050) | 32 (0.590) +CTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTG |
8/50 | 1.6 | 37.5% | coding (316/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
? | AssemblyC74_contig_24 | = 325 | 258 (0.930) | coding (325/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
CTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACTAATAAAACAAGCAATGACAATGGAAACAAATCAAAA > AssemblyC74_contig_24/193‑458 | ccTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTa > 2:1482705/1‑135 (MQ=255) tctACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACa > 2:1761422/1‑135 (MQ=255) tctACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACa > 1:1465839/1‑135 (MQ=255) tctACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACa < 1:1426813/135‑1 (MQ=255) tctACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACa > 2:1377892/1‑135 (MQ=255) ctACCACAAGTGATAGCTCAGATACATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAg < 2:221332/135‑1 (MQ=255) tccACATTTGATAGATCAGATTCAACTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGac < 2:1439113/134‑1 (MQ=18) aCCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGac < 2:1505642/135‑1 (MQ=255) aCCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGac < 1:2373122/135‑1 (MQ=255) aCCACAAGTGATAGCTCAGATACATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGac < 2:1303915/135‑1 (MQ=255) cacaAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGacac > 1:884086/1‑135 (MQ=255) cacaAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGacac > 1:814490/1‑135 (MQ=255) cacaAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGacac > 1:2477565/1‑135 (MQ=255) acaAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGacac > 2:1025051/1‑134 (MQ=255) acaAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACAcg < 2:1456554/135‑1 (MQ=255) cttgttaTAGCTCAGATTCATATTCTACTAAAAGTGATATCAAGGAAACTTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTATTCCAAATGTGATTGATCAGATTCATCAACTTCAAGCGATTGTACAGACAcgt < 1:2068951/129‑1 (MQ=21) caAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACAcgt > 2:2416709/1‑135 (MQ=255) caAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTAAAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAAATTCAAGCGATAGTACAGacactt > 2:932501/1‑133 (MQ=255) aGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACAcgtc > 2:389143/1‑134 (MQ=255) tGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACgtcgtc > 2:33965/1‑135 (MQ=255) gATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACgtcgtc > 1:2270187/1‑134 (MQ=255) aGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTAcc < 2:1603532/135‑1 (MQ=255) aGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTAcc < 2:806120/135‑1 (MQ=255) aGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTAc < 1:120668/134‑1 (MQ=255) aGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTAc < 2:533340/134‑1 (MQ=255) cTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACcac > 2:1067897/1‑135 (MQ=255) tCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACcaca > 2:462142/1‑135 (MQ=255) aGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAg > 2:514993/1‑135 (MQ=255) tCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCg < 2:72243/133‑1 (MQ=255) tCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGa > 1:718419/1‑134 (MQ=255) tCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGAt < 1:133591/135‑1 (MQ=255) aTCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATac < 2:154256/135‑1 (MQ=255) aCCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGac < 2:908537/108‑1 (MQ=255) aCCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTAcc < 1:1883986/120‑1 (MQ=255) aCCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGt > 1:2537668/1‑135 (MQ=255) ccACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTc < 2:1786068/135‑1 (MQ=255) tACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGc > 1:2398429/1‑135 (MQ=255) cacaagtgatagcacggacacaTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGt > 1:155607‑M1/23‑97 (MQ=255) gTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTAACACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGAGATACACGTCATGCAAgt > 1:589583/1‑134 (MQ=255) gCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTcc > 1:29798/1‑134 (MQ=255) aCGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCtt > 2:360069/1‑134 (MQ=255) aCGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCtt > 2:485104/1‑134 (MQ=255) ggACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTtctc > 1:358790/1‑135 (MQ=255) acGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCaaaa < 2:608406/135‑1 (MQ=255) acGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCaaa > 2:1944589/1‑134 (MQ=255) aaGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGa < 1:1014661/135‑1 (MQ=255) gACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCCAGTGTCACCTTATCAAAAACAAGTTCGGATAAc > 1:1840554/1‑135 (MQ=255) aCAGTACATATACATC‑‑‑TACCAAAAGTGATAGATCATATTCATAAACTTCAAGCGAcattacagatactacctctaccacaagttatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctac > 1:1694572‑M2/1‑55 (MQ=255) aCAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACa < 1:1533149/135‑1 (MQ=255) aCAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACa < 1:1138835/135‑1 (MQ=255) aCAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACa < 1:1377892/135‑1 (MQ=255) cAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAgg < 1:1120101/131‑1 (MQ=255) cATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACttt > 1:2423138/1‑134 (MQ=255) cATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACttt > 2:2260778/1‑134 (MQ=255) ccTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTttaact > 2:674214/1‑135 (MQ=255) ccTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTttaact > 1:1484541/1‑135 (MQ=255) catctacCACAAGTGATAGCTCAGAGTCATCAACTTCAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagca < 1:2004368‑M2/133‑93 (MQ=255) ctctACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTttaactt > 2:713506/1‑135 (MQ=255) atctaCCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcac > 2:280172‑M2/2‑42 (MQ=255) atataccACAAGTGATAGCTAATATTAATCAAATACAAGCTAcattaaagatactacatctaccacaagtgatagcacggatacatcatattaaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcac > 1:547685‑M2/4‑42 (MQ=255) tctACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAATCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACTGGACGAACTttaactt > 2:2386612/1‑134 (MQ=255) tctACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATaca > 1:782574/1‑75 (MQ=255) tctACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATac > 2:232752/1‑74 (MQ=255) tctACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAATCAAGTTCGGATAACAGGACGAACTttaactt > 2:2537737/1‑134 (MQ=255) tctACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTttaactt > 2:1118481/1‑134 (MQ=255) tctACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTttaactt > 1:622306/1‑134 (MQ=255) aCCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTc < 1:2324559/76‑1 (MQ=255) cacaAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACtaa > 2:1884099/1‑135 (MQ=255) cacaAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACtaa > 1:1924885/1‑135 (MQ=255) cacaAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCAACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTTACTTAACtaa > 1:1276734/1‑135 (MQ=255) catttgataGCTCAGATTCATCAACTTAAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacat > 1:1066897‑M2/5‑34 (MQ=255) caATTGATAGCTCAGATTCATCATCTTCAAGCGATAGTACAGACAAGTCGTCTACAACAATCGATACTCGTCTTGCATGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACtaata < 2:170021/135‑1 (MQ=255) caAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACtaata < 1:480737/135‑1 (MQ=255) caAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACtaata < 2:1142436/135‑1 (MQ=255) caAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACtaata < 1:502882/135‑1 (MQ=255) caAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACtaata < 2:2101617/135‑1 (MQ=255) caAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACtaata < 1:66835/135‑1 (MQ=255) aaGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggata < 2:817783‑M2/74‑42 (MQ=255) aaGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaagtgaaagcacggaaacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgaaagcacggacacatc < 2:1721828‑M2/135‑103 (MQ=255) gATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagc < 1:1972987‑M2/134‑106 (MQ=255) aTAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACTAATAAAACa > 2:151747/1‑134 (MQ=255) aGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttca > 2:2499852‑M2/1‑26 (MQ=255) aGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACTAATAAAACAAGc < 1:908069/135‑1 (MQ=255) cTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACTAATAAAACAAGCaa > 1:848584/1‑135 (MQ=255) tCAGATTCATCAACTTCAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaattgttagcacggatacatcagctacaagagacagtacagatactacctctaccacaagagatagcacggacacaacagcttcaagt < 2:1915775‑M2/135‑113 (MQ=255) cAGATTCATCAACTTCAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagt > 1:954638‑M2/1‑22 (MQ=255) cAGATTCATCAACTTCAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagt > 2:1995869‑M2/1‑22 (MQ=255) cAGATTCATCAACTTCAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaag > 2:2364471‑M2/1‑22 (MQ=255) cAGATACATCAACTTCAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagt > 1:2193203‑M2/1‑22 (MQ=255) ttCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACTAATAAAACAAGCAATGACaa > 2:2311937/1‑135 (MQ=255) tcatcaACTTCAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagtgaca > 2:915262‑M2/1‑17 (MQ=255) tcatcaACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACTAATAAAACAAGCAATGACAAt > 2:1402887/1‑135 (MQ=255) taatcaacTTCAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagtgac > 2:2440754‑M2/3‑17 (MQ=255) acatcaaCTTCAAGCGAcagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagtgaca > 1:1754759‑M2/2‑17 (MQ=255) aCTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACTAATAAAACAAGCAATGACAATGGAAAc > 1:2133899/1‑135 (MQ=255) aCTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACGAATAAAACAAGCAATGACAATGGAAAc > 1:2219452/1‑135 (MQ=255) ttCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACTAATAAAACAAGCAATGACAATGGAAACat < 1:1073784/135‑2 (MQ=255) ttCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACTAATAAAACAAGCAATGACAATGGAAACaa < 1:399658/135‑1 (MQ=255) aaGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACTAATAAAACAAGCAATGACAATGGAAAAAAATc > 2:585071/1‑135 (MQ=255) gCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACTAATAAAACAAGCAATGACAATGGAAACAAATCaa > 2:2154006/1‑135 (MQ=255) | CTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACAAGTTCGGATAACAGGACGAACTTTAACTTAACTAATAAAACAAGCAATGACAATGGAAACAAATCAAAA > AssemblyC74_contig_24/193‑458 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |