| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 573 total aligned reads displayed.
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aTCTCTTGTCAtattcgtctcatacttctctactaaaactctcgaagtcgcatttaataaagtcgacaattttaaagggtgcttagtggaataaactttatcaaactttctgattggtgcaccaactttttttg < 1:196649‑M2/134‑124 (MQ=255) ttGTCAaaaaagtctttttcagatatgaaaaaggaattcagctagcgttttcgaaaaagtattctaacgcaaaattagagaatcttcacacacatatcaaaacgttaaaacgaattgcttatggatttcgcagt > 2:1948630‑M1/1‑6 (MQ=255) tGTCAaaaaagtctttttcagatatgaaaaaggaattcagctagcgttttcgaaaaagtattctaacgcaaaattcgagaatcttcacacacatatcaaaacgttaaaacgaattgcttatggatttcgcagttt < 1:2277999‑M1/135‑131 (MQ=255) aaaaaagtctttttcagatatgaaaaaggaattcagctagcgttttcgaaaaagtattctaacgcaaaattagagaatcttcacacacatatcaaaacgttaaaacgaattgcttatggatttcgcagtttcacc > 2:42759‑M1/1‑1 (MQ=255) aaaaaagtctttttcagatatgaaaaaggaattcagctagcgttttcgaaaaagtattctaacgcaaaattagagaatcttcacacacatatcaaaacgttaaaacgaattgcttatggatttcgcagtttcacc > 2:1490866‑M1/1‑1 (MQ=255) aaaaaagtctttttcagatatgaaaaaggaattcagctagcgttttcgaaaaagtattctaacgcaaaattagagaatcttcacacacatatcaaaacgttaaaacgaattgcttatggatgtcgcaggttcacc > 2:1997295‑M1/1‑1 (MQ=255) | GAACGATGGGATACTTTTCTCTAAACAAATCTAATTCTTTCACCACGTCATTAAATAAGTCCTGTTTATCTTCTTGCGTAAGGTTTTGCTTGATGTATTCATCCAATGCTTTCCTTAACAATTCATCTCTTGTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_37/1616‑1750 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |