| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_37 | = 1750 | 0 (0.000) | 264 (0.620) +AAAAAGT |
84/244 | 0.6 | 100% | intergenic (‑2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity/– | FIG00632365: hypothetical protein/– |
| ? | AssemblyC74_contig_62 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/Mobile element protein | |||||
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCGCAGTTTCACCAAT > AssemblyC74_contig_62/1‑130 | ggatacttttctctaaacaaatctaattctttcaccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtc > 2:882068‑M2/135‑135 (MQ=255)ggatacttttctctaaacaaatctaattctttcaccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtc > 2:1394102‑M2/135‑135 (MQ=255) cttttctctaaacaaatctaattctttcaccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCttttt > 1:64909‑M2/130‑135 (MQ=255) ttttctctaaacaaatctaattctttcaccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtcttttta > 1:2556541‑M2/129‑134 (MQ=255) ttttctctaaacaaatctaattctttcaccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTc < 1:750945‑M2/7‑1 (MQ=255) tctaaacaaatctaattctttcaccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCcgaga > 2:1056723‑M2/124‑133 (MQ=255) tctaaacaaatctaattctttcaccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGata > 2:2486352‑M2/124‑135 (MQ=255) aacaaatctaattctttcaccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGaa < 2:410741‑M2/16‑1 (MQ=255) aaatctaattctttcaccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGaaaaa > 2:1846004‑M2/117‑135 (MQ=255) aaatctaattctttcaccacgtcattaaataagtcctgtttatcttctagcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGaaaaa > 1:1594883‑M2/117‑135 (MQ=255) aatctaattctttcaccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAg < 2:2112715‑M2/20‑1 (MQ=255) taattctttcaccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGaa > 1:1541351‑M2/112‑134 (MQ=255) tcaccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAg > 2:1568126‑M2/104‑135 (MQ=255) ccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGt > 2:2509873‑M2/101‑135 (MQ=255) ccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGt < 2:1198271‑M2/35‑1 (MQ=255) ccacgtcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGt > 2:642256‑M2/101‑135 (MQ=255) tcattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCg < 2:841801‑M2/40‑1 (MQ=255) acattaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCg < 1:1744999‑M2/40‑1 (MQ=255) attaaataagtcctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGa < 1:2028140‑M2/41‑1 (MQ=255) ctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCg > 1:388089‑M2/82‑121 (MQ=255) ctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTaa > 2:2038676‑M2/82‑135 (MQ=255) ctgtttatcttcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTa < 2:2325774‑M2/53‑1 (MQ=255) 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tcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTa < 2:2433269‑M2/64‑1 (MQ=255) tcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTa < 2:1000393‑M2/64‑1 (MQ=255) tcttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTa < 1:1521656‑M2/64‑1 (MQ=255) cttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTag > 2:1657048‑M2/71‑135 (MQ=255) cttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTag > 1:198545‑M2/71‑135 (MQ=255) cttgcgtaaggttttgcttgatgtattcatccaatgctttccttaacaattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTATAACGCAAAATTag > 1:2163582‑M2/71‑135 (MQ=255) 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aattcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGa > 2:1770970‑M2/24‑135 (MQ=255) attcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGAt < 2:95702‑M2/113‑1 (MQ=255) ttcatctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGAtt < 1:829692‑M2/114‑1 (MQ=255) atctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCg > 2:420468‑M2/19‑135 (MQ=255) atctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCg > 1:1912108‑M2/19‑135 (MQ=255) atctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCg > 2:1552770‑M2/19‑135 (MQ=255) ctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCGCa > 1:451461‑M2/17‑135 (MQ=255) ctcttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCGCa > 1:970099‑M2/17‑135 (MQ=255) ttgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCGCAGt > 2:1948630‑M2/14‑134 (MQ=255) tgtcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTCGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCGCAGttt < 1:2277999‑M2/123‑1 (MQ=255) tcaaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCGCAGTTTc > 2:696923‑M2/11‑134 (MQ=255) aaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCGCAGt > 1:2127252‑M2/9‑129 (MQ=255) aaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCGCAGTTTCAcc > 2:1490866‑M2/9‑135 (MQ=255) aaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCGCAGTTTCAcc > 2:1340943‑M2/9‑135 (MQ=255) aaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCGCAGTTTCAcc > 2:802606‑M2/9‑135 (MQ=255) aaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCGCAGTTTCAcc > 1:735532‑M2/9‑135 (MQ=255) aaaaaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATGTCGCAGGTTCAcc > 2:1997295‑M2/9‑135 (MQ=255) aaagtCTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCGCAGTTTCACCAat < 1:1235685‑M2/130‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTTTTCAGATATGAAAAAGGAATTCAGCTAGCGTTTTCGAAAAAGTATTCTAACGCAAAATTAGAGAATCTTCACACACATATCAAAACGTTAAAACGAATTGCTTATGGATTTCGCAGTTTCACCAAT > AssemblyC74_contig_62/1‑130 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |