| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_47 | 421 = | NA (NA) | 166 (0.590) +GCATTCATAGAA |
54/234 | 1.0 | NA | coding (420/879 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_47 | = 561 | NA (NA) | coding (560/879 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 493 total aligned reads displayed.
AGCTTTTCCGCCACTGGAACAAACAAAGAGATCAAAGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAA > AssemblyC74_contig_47/287‑555 | ttCCGCCACTGGAACAAACAAAGAGATCAAAGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGtt > 1:2325932/1‑135 (MQ=255) tCCGCCACTGGAACAAACAAAGAGATCAAAGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGttt < 2:424946/135‑1 (MQ=255) ctatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacggatatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttactgctatgtctgaTATGtt < 2:385271‑M1/6‑1 (MQ=255) cgatcgatgtaagtaattgtgatacgtcaaatgttactactatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgacTAATATgtttt > 2:1245547‑M1/125‑134 (MQ=255) agatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTTCAgg < 1:255013‑M1/12‑1 (MQ=255) agatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAgg < 2:2064322‑M1/12‑1 (MQ=255) agatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacaagtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgacTAatatgttttgtgg < 1:30606‑M1/15‑6 (MQ=255) gatgtaagtaattgggatacgtcgaatgttactaatatgacttctatgtttcatggatgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAggg > 2:1733313‑M1/123‑135 (MQ=255) gatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAggg > 1:1059853‑M1/123‑135 (MQ=255) gatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacaagtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgacTaatatgttttgtggt < 2:936660‑M1/16‑7 (MQ=255) aCTGGAACAAACAAAGAGATCAAAGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAggg < 2:2489131/135‑1 (MQ=255) atgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacggatatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgaTatgtttggtgggg < 2:1308188‑M1/14‑7 (MQ=255) atgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacaagtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgacTAATATgtttt < 1:1245573‑M1/11‑2 (MQ=255) gAACAAACAAAGAGATCAAAGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTa > 2:1943039/1‑135 (MQ=255) aattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGttt > 2:433458‑M1/114‑120 (MQ=255) aattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt < 2:1179037‑M1/22‑1 (MQ=255) attgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATc > 2:636043‑M1/113‑133 (MQ=255) attgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATc > 1:1172406‑M1/113‑133 (MQ=255) cAAAGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATc < 1:407802/133‑1 (MQ=255) cAAAGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGa < 2:306103/135‑1 (MQ=255) aaaGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGAt < 2:1099191/135‑1 (MQ=255) gcatatgacttatatgtttcatggatgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg > 1:951628‑M1/91‑135 (MQ=255) gaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg > 1:840367‑M1/91‑135 (MQ=255) aaCTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAGTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGa > 1:1630115/1‑134 (MQ=255) aaCTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGa > 2:2267762/1‑134 (MQ=255) cTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAggg < 2:1627201/97‑1 (MQ=255) cTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATAc > 1:1004431/1‑135 (MQ=255) cTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATAc > 2:1041567/1‑135 (MQ=255) cTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATAc > 1:186970/1‑135 (MQ=255) tgaatgaaCTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTa < 1:152320/105‑1 (MQ=255) tgaatgaaCTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGt > 2:1509935/1‑135 (MQ=255) tgaatgaaCTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGt > 1:2473253/1‑135 (MQ=255) tgaatgaaCTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGt > 1:272599/1‑135 (MQ=255) tgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACTTCAAATg < 1:361078‑M1/59‑1 (MQ=255) tgttccaaggttgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGttt > 1:1567712‑M1/77‑83 (MQ=255) aaCTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATg < 1:558246/135‑1 (MQ=255) cTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGtt < 1:773915/135‑1 (MQ=255) tggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTacgaa < 2:2382042‑M1/66‑3 (MQ=255) ccGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGa < 2:450006/135‑1 (MQ=255) ggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTTGGATACGTCAAATGTtacgaat < 2:510369‑M1/67‑4 (MQ=255) gCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAAt < 1:2387449/135‑1 (MQ=255) gctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGttt > 2:2226190‑M1/62‑68 (MQ=255) gctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTTCAggg < 1:1612916‑M1/13‑1 (MQ=255) ctaaaGTTACAACCATCGATTTGCGTGGGTTTGTTATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAAtt < 2:2570553/133‑1 (MQ=255) tctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCt < 1:1421745‑M1/76‑1 (MQ=255) aCCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTAt > 2:71042/1‑135 (MQ=255) agatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCtg < 1:2233297‑M1/90‑1 (MQ=255) agatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaaTGATATGttt < 1:1485008‑M1/10‑1 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg < 2:2005339/88‑1 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg > 1:2005339/1‑88 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg > 1:857947/1‑88 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCtgt > 2:1452338/1‑134 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCtgt > 2:2141776/1‑134 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAAGTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCtgt > 2:2393154/1‑134 (MQ=255) tatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTAACGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCtgt > 2:1271304/1‑133 (MQ=255) gtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGc > 1:1142224‑M1/42‑135 (MQ=255) taagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGTGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTgg < 2:595670‑M1/93‑1 (MQ=255) taagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTgg < 2:747493‑M1/93‑1 (MQ=255) cGTGGGTTTGATATGTCGTATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTACGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTATATGTTTTATGGCTGTGGctct < 1:2301523/135‑1 (MQ=255) taattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:1025811‑M1/37‑135 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:2426530/135‑1 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:1580616/135‑1 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:1756864/135‑1 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:1879801/135‑1 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:71042/135‑1 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:1721432/135‑1 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCtt < 1:2148495/134‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACAGGATAGATGTAAGAAATTGGGATACGTCAACTGTTACGAATATGAATTCTATTTTTTCTGGCTGTGGCTCttt < 2:1426436‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:1355626‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:1720176‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:2111968‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:1792806‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:1768017‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:2040413‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:473246‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaaTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg < 2:1384966‑M1/48‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaaTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg > 1:1384966‑M1/33‑80 (MQ=255) cttgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGTTTAACTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGACTATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:2347422‑M1/35‑133 (MQ=255) attgtgatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:1682082‑M1/35‑133 (MQ=255) attgggatccgtcgcaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATCCGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:501721‑M1/35‑133 (MQ=255) gggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGa > 1:1950789‑M1/32‑135 (MQ=255) ggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAg < 1:891771‑M1/105‑1 (MQ=255) cgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAg < 1:2369287‑M1/110‑1 (MQ=255) tCGACTGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGTTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTATGTGGGATACGTAAAATGTTACGGATATGAATACTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGAt < 1:1323562/135‑1 (MQ=14) tCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTGGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGAt < 1:449312/135‑1 (MQ=255) aaTGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgta > 1:2406269/1‑135 (MQ=255) ggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgtaag > 1:674987‑M1/19‑135 (MQ=255) gttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTGTAACGAGTGTAGATgtaagt < 2:35139‑M1/118‑1 (MQ=255) tACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACAATAGATGTAAGTAAATGGGATACGGCAAGTGTGACGTATAGGAATAGTATGTTTGATGGATGTGGCTCTTTAACGGGTGTAGGTgttagtaa > 1:590977/1‑135 (MQ=14) ttCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg < 2:547800/135‑1 (MQ=255) ttCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg < 2:2349239/135‑1 (MQ=255) tctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTgg < 1:219271‑M1/124‑1 (MQ=255) tctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTgg < 1:1930003‑M1/124‑1 (MQ=255) tctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTgg < 2:846478‑M1/124‑1 (MQ=255) cTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTggg > 2:882109/1‑135 (MQ=255) tgtcTGCTATGGGTGCAGGGGATATATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTAATATGACTGATATGTTTTTTGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATa < 1:1094212/132‑1 (MQ=11) gCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACg < 1:986224/135‑1 (MQ=39) aatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATAc < 2:962422‑M1/129‑1 (MQ=255) cTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGt > 1:1830792/1‑135 (MQ=38) TGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGt > 2:1977386‑M1/1‑134 (MQ=255) | AGCTTTTCCGCCACTGGAACAAACAAAGAGATCAAAGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAA > AssemblyC74_contig_47/287‑555 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |