| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_47 | 421 = | NA (NA) | 166 (0.590) +GCATTCATAGAA |
54/234 | 1.0 | NA | coding (420/879 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_47 | = 561 | NA (NA) | coding (560/879 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 527 total aligned reads displayed.
GCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAG > AssemblyC74_contig_47/428‑693 | aGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACaaa > 1:890571/1‑135 (MQ=40) aGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACaaa > 1:359172/1‑135 (MQ=40) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACaaa < 1:2387424/134‑1 (MQ=40) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCCTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACaaa < 1:1943039/134‑1 (MQ=255) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttc > 2:1421745‑M2/1‑131 (MQ=255) aaaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAg < 2:212554/134‑1 (MQ=255) aaaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgact > 1:1809290‑M2/1‑125 (MQ=255) aaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGtt > 2:1458858/1‑135 (MQ=255) aaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGtt < 1:540945/135‑1 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGtttt > 2:686332/1‑135 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGtttt > 2:286553/1‑135 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGtttt > 2:1232479/1‑135 (MQ=255) agaTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgttttcagg < 1:255013‑M2/134‑25 (MQ=255) gttGTAAGTACTTGTGATTAGTCGAATGTGACGAATATGAATTATAAGTTTCCTGGCTTTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAATTGTTACAAGTATGAATTCTATGTTTtatggc < 1:2508218/133‑3 (MQ=2) gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAATGTTACTAATATGACTTCTATGTTTCATGGATGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggg > 2:1733313‑M2/1‑110 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggg > 2:961770‑M2/1‑110 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTtgt > 1:1776128/1‑131 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTtgt > 2:2354416/1‑131 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTtgt > 2:2384025/1‑131 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTtgt > 2:1087326/1‑131 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTtgt > 2:1676696/1‑131 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTtgt > 2:678062/1‑131 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTtgt > 2:1314174/1‑131 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACt < 2:2519497/135‑1 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACt < 1:137884/135‑1 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGAGATGAATTCTATGGTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATTTGAGGTATATGTTTtgt > 1:1285697/1‑131 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTctct > 2:1283026/1‑135 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTctct > 1:647250/1‑135 (MQ=255) ttGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCttt < 1:1516182/135‑1 (MQ=255) ttGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggg > 1:681957‑M2/1‑99 (MQ=255) tACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGa < 2:186970/134‑1 (MQ=255) tACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGa < 1:2417907/134‑1 (MQ=255) aCGTCAAATGTTACGTATTTGAAGTCGAGGTTTTATGGGTGTGGCTCTTTCACGAGTGTAGAGGTACGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctttgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatc > 1:2121284‑M2/1‑92 (MQ=255) cGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAgtg > 2:876073/1‑135 (MQ=255) gTCAAATGTTACTACTATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcga > 1:1037050‑M2/1‑90 (MQ=255) gTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggg > 1:983463‑M2/1‑83 (MQ=255) gaatatgaCTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattg > 2:2001600‑M2/3‑78 (MQ=255) aatatgACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgg < 2:1950789‑M2/134‑59 (MQ=255) aatatgACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatagatgtaggtaattgg < 2:240176‑M2/134‑59 (MQ=255) gACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatac > 1:839722‑M2/1‑72 (MQ=255) aTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTTTGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATa > 2:562597/1‑135 (MQ=14) ttCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaattctatgtttgcatgggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgt > 2:428217‑M2/1‑69 (MQ=255) tGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatg > 1:934963‑M2/1‑64 (MQ=255) gTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaat < 1:1018904‑M2/73‑11 (MQ=255) gTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaat > 2:1018904‑M2/1‑63 (MQ=255) gTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCaa > 1:1168188/1‑135 (MQ=255) ttATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATg < 1:2336839/134‑1 (MQ=255) aTGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgact < 1:1001632‑M2/68‑11 (MQ=255) tGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTAc < 2:737534/135‑1 (MQ=255) tGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTAc > 2:1488991/1‑135 (MQ=255) ggCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaaggaatttggatacgtcaaaagttactaat < 2:510394‑M2/135‑80 (MQ=255) ggCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttc > 1:953605‑M2/1‑56 (MQ=255) ggCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttc < 1:591979‑M2/59‑4 (MQ=255) cTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgt > 2:1543668‑M2/1‑54 (MQ=255) cTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACTAATATGACTTCTATGTTATATGGCTGTGTCTCTTTAACGAGTGAAGATGTAAGTAATTTGGATACGTCCAAAGTTAcatt > 1:1970977/1‑132 (MQ=11) gtgGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAata < 1:171447/135‑1 (MQ=255) gCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggg > 2:1612916‑M2/1‑49 (MQ=255) gCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgttt < 1:2226190‑M2/68‑20 (MQ=255) gCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttc < 2:1389814‑M2/52‑4 (MQ=255) tctTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttct < 1:1421745‑M2/135‑89 (MQ=255) aCGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTg > 1:1896112/1‑135 (MQ=255) cGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgtttt < 2:370343‑M2/135‑96 (MQ=255) aGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGGTTTgggg > 2:1143331/1‑135 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGa > 2:268003/1‑135 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGa > 2:1802408/1‑135 (MQ=255) gtaagtaaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGaa < 1:237107/133‑1 (MQ=255) gtaagtaaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGaa < 1:1311552/133‑1 (MQ=255) gtaagtaaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGaa < 1:2184139/133‑1 (MQ=255) agtaaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGAGTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCACTGTTACGAATATGACTGCTTTGTTTTggggtagttg > 2:1052858/1‑128 (MQ=18) gtaaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGATTGTAGATGTAAGTTATTGGAATACGTCCAATGTTACGAAAATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACgt > 1:396729/1‑135 (MQ=255) gtaaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACgt > 1:1622330/1‑135 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt < 1:448718‑M2/134‑112 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt < 1:2251730‑M2/134‑112 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt < 1:1088227‑M2/134‑112 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt < 2:1781885‑M2/134‑112 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt < 2:815181‑M2/134‑112 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTAATATGACTGATATGTTTTATGGCTGTGTCTCttt > 1:75014/1‑59 (MQ=14) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACTAGTGTAGAAGTAATTAATTGTAATACGTCGAATGTTACGAATATGCATTGGCTGTTTTGCTGTGATACgtga > 2:1704693/1‑134 (MQ=21) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAATTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACgtgt > 2:1920523/1‑135 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACgtgt > 2:2487837/1‑135 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACgtgt > 2:623862/1‑135 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACgtgt > 1:474338/1‑135 (MQ=255) tttgTGAGACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatttttgcaggggttaattctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgaattctttgttttatggctgtggctcttt > 1:1588115‑M2/2‑22 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 1:2064322‑M2/1‑22 (MQ=255) aTTGGGAGACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 2:330877‑M2/1‑22 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGttt < 1:1195356/135‑1 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGttt < 2:647250/135‑1 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGttt < 2:2079067/135‑1 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGttt < 2:406655/135‑1 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGttt < 1:1451692/135‑1 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGttt < 1:1478366/135‑1 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGttt < 2:2243176/135‑1 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGttt < 1:286553/135‑1 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGttt < 1:719258/135‑1 (MQ=255) tggaTACGTCGAAGGTTTCttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacga > 2:925499‑M2/2‑19 (MQ=255) gggATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacga > 2:448718‑M2/1‑19 (MQ=255) ggATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTaga > 2:2191975/1‑135 (MQ=255) gATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagt < 2:1181535‑M2/135‑119 (MQ=255) tACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTAAATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTagagag > 2:2466237/1‑135 (MQ=255) aCAAATATGATTTATATGTTTTGTGTCTGTGTCTATTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATTCGTCCAATGTTACGAATATGCATTTGCTGTTTTGGGGAATTACGTGTTTAGAGAGTGTAGATgtaag < 1:2029763/134‑1 (MQ=37) | GCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAG > AssemblyC74_contig_47/428‑693 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |