New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_27 | = 7726 | 1 (0.000) | 290 (0.680) +CG |
74/252 | 0.4 | 99.8% | coding (703/705 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) |
? | AssemblyC74_contig_41 | = 1330 | 0 (0.000) | coding (1/411 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) |
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
ATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_27/7592‑7726 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATATAGCAAGTCGTAGTTTTTTA < AssemblyC74_contig_41/1330‑1199 || ATCCAGTTTTAACCAATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGC < 1:2420215/135‑1 GTTTTAACCAATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTAT > 1:1323103/1‑135 TTTTAACCAATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTAT > 1:581882/1‑134 TTTAACCAATCATTATGG‑AAAAAAATTATATTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATT > 2:732274/1‑134 ATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCA < 2:944976/135‑1 ATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCA < 1:2781504/135‑1 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAA > 2:290395/1‑135 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAA > 2:1732732/1‑135 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAA > 2:909532/1‑135 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAA > 1:973001/1‑135 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAA > 1:724096/1‑135 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAA > 2:529839/1‑135 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAA > 1:1585254/1‑135 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAA > 2:2425375/1‑135 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAA > 1:2385335/1‑135 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAA > 2:577374/1‑135 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCA < 2:2374514/131‑1 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCA > 1:2374514/1‑131 AAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTA > 1:1205502/1‑135 AAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCT < 2:2433742/134‑1 AAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAA < 1:1943236/135‑1 AAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAA < 2:1566585/135‑1 AAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAA < 1:1685832/135‑1 AAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAA < 1:533590/135‑1 AAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAA < 2:435319/135‑1 AATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGT < 1:314689/135‑1 TATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATT > 1:2910690/1‑135 TAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAG < 1:1428218/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 2:1313311/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:1057985/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:214075/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:682539/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 2:2598888/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:1732732/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 2:814263/135‑1 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTTCGGAATTTAGCAACGAAAC > 2:2827481/1‑135 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAAC > 1:1288104/1‑135 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAAC > 1:607459/1‑135 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCA < 2:2200171/100‑1 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCA > 1:2200171/1‑100 CGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACAT > 1:2470311/1‑135 CGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACAT > 1:1966162/1‑135 AAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGT > 2:1770364/1‑133 AAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGT > 1:1116409/1‑133 AATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTC < 2:724091/133‑1 AATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTC < 2:195377/133‑1 TTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCG < 1:2673229/135‑1 TTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCG < 2:1838005/135‑1 TTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCG < 1:2302050/135‑1 TTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCG < 2:39367/135‑1 GAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCG < 1:506304/134‑1 ATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA > 1:1654146/1‑103 ATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 2:1654146/103‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 2:1343285/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 1:1542548/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 1:932490/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 2:1893596/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 2:2003030/134‑1 AATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATT < 2:1080768/135‑1 AATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATT < 2:1205502/135‑1 TATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTG > 1:1632772/1‑134 TATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGA > 1:1010451/1‑133 ATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTTAACC > 2:1162680/1‑135 ATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACC > 2:2095161/1‑135 ATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACC > 1:372729/1‑135 TTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTT < 2:2538854/135‑1 TTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTT < 1:145255/135‑1 TAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCGTT > 2:216141/1‑135 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAG > 2:774038/1‑135 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAG > 1:1486240/1‑135 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTG > 2:1243980/1‑116 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTG < 1:1243980/116‑1 AATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGT > 1:655645/1‑135 AATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGT > 2:1493261/1‑135 ATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCG > 1:2655165/1‑102 AATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTA < 1:1845747/135‑1 AATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTA < 2:1028187/135‑1 AATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTA < 2:2454344/135‑1 AATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTA < 2:683560/135‑1 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAG > 1:881460/1‑135 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAG > 1:1765624/1‑135 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAG > 1:2104321/1‑135 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCT > 2:1564086/1‑122 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCT < 1:1564496/122‑1 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA > 2:2672128/1‑114 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATT > 2:2795246/1‑40 CAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGAT < 2:1966162/135‑1 CAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGAT < 2:300969/135‑1 TTAGTAGAAAAAAATGAAGTTATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTTGCAACGAATCATTTATGTCGCTCGGATCGTTTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTT < 1:2164081/135‑1 TTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAG > 2:1429695/1‑70 AGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCG < 1:1997973/91‑1 GTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCAT > 1:1368526/1‑135 GTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA > 2:2345584/1‑106 GTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 1:2345584/106‑1 AAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATAT > 1:28235/1‑134 AAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATT < 2:2499592/91‑1 AAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATT > 1:2499592/1‑91 AGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATATAGCAAGTCG > 1:1030619/1‑135 GTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATATAGCAAGTCGTAGTTTT > 2:2305493/1‑135 GGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGA > 1:472084/1‑35 || ATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_27/7592‑7726 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATATAGCAAGTCGTAGTTTTTTA < AssemblyC74_contig_41/1330‑1199 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |