| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_27 | = 7726 | 1 (0.000) | 290 (0.680) +CG |
74/252 | 0.4 | 99.8% | coding (703/705 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) |
| ? | AssemblyC74_contig_41 | = 1330 | 0 (0.000) | coding (1/411 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) | |||||
Only 100 of 596 total aligned reads displayed.
CATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_27/7591‑7728 | gTTTTAACCAATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtat > 1:2003030‑M1/1‑129 (MQ=255) ttttAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtat > 2:1399674‑M1/1‑131 (MQ=255) ttttAACCAATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtat > 1:581882‑M1/1‑128 (MQ=255) aaTCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattc > 1:774782‑M1/1‑120 (MQ=255) tCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattca < 2:1596755‑M1/135‑15 (MQ=255) ttATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTATAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataa > 2:314027‑M1/1‑118 (MQ=255) ttATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataa > 1:211913‑M1/1‑118 (MQ=255) ttATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaa > 2:934034‑M1/1‑115 (MQ=255) ttATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaa > 1:2385335‑M1/1‑115 (MQ=255) ttATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaa > 1:724096‑M1/1‑115 (MQ=255) ttATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaa > 2:1015354‑M1/1‑115 (MQ=255) ttATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaa > 2:2425375‑M1/1‑115 (MQ=255) ggaaaaaaattATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatc < 2:2187421‑M1/133‑25 (MQ=255) gAAAAAAAATTATCTTATTTACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatc < 2:2537703‑M1/135‑23 (MQ=255) gAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatc < 2:770771‑M1/135‑23 (MQ=255) gAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatc < 2:1512953‑M1/135‑23 (MQ=255) gAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatc < 1:2232676‑M1/135‑23 (MQ=255) aaaaTTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaa < 1:529839‑M1/135‑30 (MQ=255) aaaaTTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaa < 2:435319‑M1/135‑30 (MQ=255) aaaaTTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaa < 2:1050542‑M1/135‑28 (MQ=255) aaaaTTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaa < 1:1808436‑M1/135‑28 (MQ=255) aaTTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagt < 1:288649‑M1/135‑30 (MQ=255) taACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttag < 1:1428218‑M1/135‑43 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 2:1313311‑M1/135‑46 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 2:2331210‑M1/135‑46 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 2:2598888‑M1/135‑46 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 1:162678‑M1/135‑46 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 2:290367‑M1/135‑44 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 2:2487775‑M1/135‑44 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 2:2227880‑M1/135‑44 (MQ=255) cATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaa > 1:1681937‑M1/1‑85 (MQ=255) aTCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaac > 1:1541019‑M1/1‑84 (MQ=255) aTCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaac > 2:2827448‑M1/1‑84 (MQ=255) aTCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaac > 1:607463‑M1/1‑84 (MQ=255) aTCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaac > 1:1097167‑M1/1‑86 (MQ=255) aTCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaac > 2:1937382‑M1/1‑86 (MQ=255) aTCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaac > 2:126601‑M1/1‑86 (MQ=255) aTCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa > 1:1233746‑M1/1‑86 (MQ=255) aTCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 1:410313‑M1/129‑44 (MQ=255) aTCGACGAGAAAAATTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAACCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAAGGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataataatccaaaagtacggaatttagcaacgaagc > 2:270561‑M1/1‑84 (MQ=255) cgacgaGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacat > 1:1966162‑M1/1‑82 (MQ=255) gacgaGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatt > 1:1382810‑M1/1‑81 (MQ=255) gacgaGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaacgtacggaatttagcaacgaaacatt < 2:16546‑M1/135‑53 (MQ=255) agaAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTttatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatg < 2:1798103‑M1/135‑57 (MQ=255) gaAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgt > 2:1097088‑M1/1‑78 (MQ=255) gaAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatt < 2:614607‑M1/130‑53 (MQ=255) aaaTTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 2:1753357‑M1/119‑46 (MQ=255) aaTTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtc < 2:724091‑M1/133‑61 (MQ=255) ttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 2:1169029‑M1/135‑66 (MQ=255) ttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 1:21972‑M1/135‑66 (MQ=255) ttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 2:885270‑M1/135‑66 (MQ=255) ttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 2:39367‑M1/135‑66 (MQ=255) ttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 1:2673229‑M1/135‑66 (MQ=255) ttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 2:2076947‑M1/135‑66 (MQ=255) ttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 1:2302050‑M1/135‑66 (MQ=255) ttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 1:866799‑M1/135‑64 (MQ=255) ttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 2:2445749‑M1/135‑64 (MQ=255) ttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTAGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 1:2427006‑M1/135‑64 (MQ=255) ggggAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggat < 1:2629489‑M1/135‑67 (MQ=255) ccAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgatt < 1:690939‑M1/134‑74 (MQ=255) aaTGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaa > 1:657258‑M1/1‑59 (MQ=255) aaTGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattca > 1:2513047‑M1/1‑61 (MQ=255) aTGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaag > 2:1229518‑M1/1‑58 (MQ=255) aTGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa > 1:1654146‑M1/1‑58 (MQ=255) ttatatatttAAATCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagaaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataa < 2:1891676‑M1/132‑82 (MQ=255) tAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataa < 1:2353288‑M1/134‑82 (MQ=255) tAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataat < 1:354796‑M1/135‑81 (MQ=255) tAATATAATTAAAGCAATGAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctacagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataa < 2:798780‑M1/134‑80 (MQ=255) tatatTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 2:691583‑M1/115‑64 (MQ=255) tatTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattga > 1:1010451‑M1/1‑48 (MQ=255) atTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacc < 1:1287019‑M1/135‑87 (MQ=255) atTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacc > 2:2137934‑M1/1‑49 (MQ=255) ttAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctt < 1:892734‑M1/135‑89 (MQ=255) aaGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttag > 2:1696290‑M1/1‑42 (MQ=255) aaGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttag > 1:1035536‑M1/1‑42 (MQ=255) aaGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaaccttt < 1:120757‑M1/133‑92 (MQ=255) aaGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttag > 2:568558‑M1/1‑44 (MQ=255) aaGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataa > 1:1256803‑M1/1‑44 (MQ=255) aTTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 2:2655165‑M1/102‑66 (MQ=255) aTTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaattaagcaacgaaacatttatgtcgctcggatctattgaagataaatgaaaatttagatgtt > 2:1464519‑M1/1‑39 (MQ=255) aTCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtag > 1:474562‑M1/1‑33 (MQ=255) aTCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtag > 1:1709470‑M1/1‑33 (MQ=255) aTCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtag > 1:1765624‑M1/1‑33 (MQ=255) aTCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacct > 2:1564086‑M1/1‑33 (MQ=255) aTCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatt > 2:2795246‑M1/1‑33 (MQ=255) aTCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtag > 1:2171989‑M1/1‑35 (MQ=255) aTCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtag > 2:514559‑M1/1‑35 (MQ=255) aTCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataa > 2:2369066‑M1/1‑35 (MQ=255) aTCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 1:131447‑M1/78‑44 (MQ=255) cAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagat < 2:1966162‑M1/135‑105 (MQ=255) aTTAGTAGACAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacatttagatgttgtagattt < 1:1851721‑M1/135‑107 (MQ=255) aTTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattt < 1:1477537‑M1/135‑107 (MQ=255) agtagAAAAAAATGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattttca > 1:293690‑M1/1‑26 (MQ=255) gtagAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattttcat > 1:960985‑M1/1‑27 (MQ=255) agAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattttcataa > 1:2482766‑M1/1‑25 (MQ=255) aaaaaTGAAGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattttcataatat > 1:28235‑M1/1‑19 (MQ=255) aaaaaTGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctacagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattttcataata < 2:2261900‑M1/133‑113 (MQ=255) aaaaaTGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattttcataatat < 1:2772346‑M1/134‑114 (MQ=255) aGATATTGTCGcggtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattttcataatatagcaagtcg > 1:1580627‑M1/1‑11 (MQ=255) gTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattttcataatatagcaagtcgtagtttt > 1:1925954‑M1/1‑6 (MQ=255) | CATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_27/7591‑7728 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |