New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_27 | = 7728 | 0 (0.000) | 303 (0.700) | 72/256 | 0.6 | 100% | coding (705/705 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) |
? | AssemblyC74_contig_41 | = 1330 | 0 (0.000) | coding (1/411 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) |
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
AGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_27/7596‑7728 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATATAGCAAGTCGTAGTTTTTTA < AssemblyC74_contig_41/1330‑1199 AGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGT > 2:2589692/1‑135 GTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTA > 1:1966611/1‑135 TTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATT > 2:195904/1‑134 ACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCC < 1:2538764/135‑1 ACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCC < 2:85227/135‑1 AATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATT > 2:1615902/1‑135 TCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCA < 1:724006/135‑1 TCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCA < 2:312046/135‑1 TTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAA > 1:2682207/1‑135 TTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAA > 1:751033/1‑135 TTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAA > 1:2106008/1‑135 GAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATC < 2:909041/135‑1 GAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATC < 2:1512954/135‑1 GAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAA > 1:1255949/1‑133 AAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAA < 1:1034689/135‑1 AAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAA < 2:1050542/135‑1 AAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAA < 2:2793524/135‑1 AAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAA < 1:1263649/135‑1 AAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAA < 2:586109/135‑1 AATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAATTTTAGGGTAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTACTCAATTAGTAGAAAAAAATGAATATAGTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGT < 2:2375633/135‑1 AATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGT < 1:1210416/135‑1 ACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCA < 2:2146011/135‑1 aTGTTCATCGTCGATAAAATTTAGGGGCACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 2:2237564/134‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 2:2227880/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 2:1484596/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:982746/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:87985/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTCAGCAA < 2:1931144/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACAAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:1669726/135‑1 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAAC > 1:1097167/1‑135 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAAC > 1:786572/1‑135 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAAC > 2:126601/1‑135 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAAC > 2:2725996/1‑135 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:2861363/129‑1 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA > 2:2861363/1‑129 CGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACAT > 1:572662/1‑135 CGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTA > 1:902068/1‑135 GAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGT > 2:1097088/1‑135 GAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATT < 2:614607/130‑1 GAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATT > 1:614607/1‑130 AAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATT < 2:1220899/113‑1 AAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGGATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGCCTTTAGCAACGAAACATTTATtt > 2:354796/1‑131 AATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTC < 1:2507490/133‑1 ATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCT > 2:2633976/1‑135 TTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCG < 2:1439042/135‑1 TTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCG < 1:1222767/135‑1 TTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTAGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCG < 1:2427006/135‑1 GGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGAT < 1:2629489/135‑1 GGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGAT < 2:2287707/135‑1 GAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCG < 2:2667051/134‑1 AATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCA < 2:2513047/75‑1 ATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGTAG > 1:2921852/1‑135 ATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCG > 2:2801854/1‑123 TAATATATTTAAAGCAATTAATCATTTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGATACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 2:1034093/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAAT < 1:1534758/135‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAAT < 1:1401780/135‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAAT < 1:354796/135‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 2:170710/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 2:2473303/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 1:1653610/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 2:520949/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 1:174170/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 2:1664618/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 2:1312519/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 2:1255949/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 1:832787/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 1:396314/134‑1 TATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTG > 1:660787/1‑134 TATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCG > 1:691583/1‑115 TATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCG < 2:691583/115‑1 ataTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAATAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACC < 1:2849963/132‑1 ATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACC > 2:1785366/1‑135 ATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACC < 1:1287019/135‑1 TTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTT < 2:2199037/135‑1 TAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:499419/89‑1 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAG > 1:179927/1‑135 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAG > 1:2208615/1‑135 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCT < 1:2177744/105‑1 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAA < 2:720594/71‑1 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATACTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAG > 1:1624975/1‑135 GCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGAT > 1:187570/1‑135 AATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGT > 2:790259/1‑135 TTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTG < 2:156387/135‑1 AATCAATTAGTAGAAAAAAATGCAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTA < 1:2235338/135‑1 AATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTA < 2:1626021/135‑1 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAG > 2:424948/1‑135 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAG > 2:2110352/1‑135 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAG > 1:2171989/1‑135 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:131447/78‑1 CAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGAT < 1:2315416/135‑1 TAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTC < 1:1831397/135‑1 TAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTC < 1:424948/135‑1 GTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCAT > 1:1708012/1‑135 AGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAA > 1:2482766/1‑135 AAAAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATA > 1:1452443/1‑135 AAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATAT > 2:2368557/1‑134 AAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATAT < 2:485708/134‑1 AAAAATGAAGATATTGTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATAT < 1:2772346/134‑1 GTCGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATATAGCAAGTCGTAGTTTT > 1:1925954/1‑135 CGTTGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA > 2:1810133/1‑47 AGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_27/7596‑7728 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATATAGCAAGTCGTAGTTTTTTA < AssemblyC74_contig_41/1330‑1199 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |