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TAAAAAACTACGACTTGCTATATTATGAAAATCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_41/1199‑1330 | tAAAAAACTACGACTTGATATATAATGAAAATCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaac > 2:1790007‑M2/1‑132 (MQ=255) aaaaCTACGACTTGCTATATTATGAAAATCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgac > 1:1925954‑M2/1‑129 (MQ=255) cGACTTGCTATATTATGAAAATCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatct > 1:1580627‑M2/1‑122 (MQ=255) gCTTTATTATGAAAATCTACAACATCTAAATGTTCAATTATCTTCAATCGATCAGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcattt > 2:2240626‑M2/1‑116 (MQ=255) 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TAAAAAACTACGACTTGCTATATTATGAAAATCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_41/1199‑1330 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |