| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_34 | 2046 = | 102 (0.390) | 156 (0.640) +T |
35/254 | 2.3 | 75.5% | intergenic (‑223/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | PaaD‑like protein (DUF59) involved in Fe‑S cluster assembly/– |
| ? | AssemblyC74_contig_56 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Co‑activator of prophage gene expression IbrA | |||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
‑‑GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_34/2107‑2046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAATT > AssemblyC74_contig_56/1‑134 | ctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAA < 1:1990366/133‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 1:2086540/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 2:2342019/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 1:1335071/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 1:358326/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 1:1725823/134‑1 TTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACA < 1:1005333/135‑1 TTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGT < 2:1566263/79‑1 TTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGT > 1:1566263/1‑79 TTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTTTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCTTCACAGTA > 2:1155015/1‑135 TTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTA > 2:288053/1‑135 TAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTA > 1:1493033/1‑135 TAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTA > 2:240927/1‑135 TAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATG > 2:2540422/1‑86 TAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATG < 1:2540422/86‑1 TAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATT < 1:120891/83‑1 TAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATT > 2:120891/1‑83 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCGATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:787562/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGTGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:1481184/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:73438/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:2397733/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:1569268/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:293694/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:505940/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:215773/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:958272/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:1493033/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT > 2:1309103/1‑135 TACACACCATAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCACTCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:2142070/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 1:2709035/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 2:1540753/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 1:1923040/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 1:1742496/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 2:2835350/135‑1 ACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATG > 1:2274049/1‑78 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAA < 1:1023278/135‑1 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAA < 1:144998/135‑1 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGT > 2:2272350/1‑133 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTCTAGCTGTAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:2095450/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:2888659/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:1039941/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:1062042/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:539136/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:394691/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:380588/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:2719895/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:2684547/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:2329523/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:1705796/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:1144256/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:536860/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:2658804/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:1006806/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:1032096/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAAATGTA > 2:893445/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG > 1:1394394/1‑127 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 2:1394394/127‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 1:202792/127‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG > 2:202792/1‑127 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:2065930/125‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT > 2:2065930/1‑125 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG > 1:285602/1‑109 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 2:285602/109‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 1:1742753/109‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG > 2:1742753/1‑109 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTAT < 2:173860/70‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGAAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGACACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:130039/1‑135 AATTTTTCTGTATATTTAATTGTAGCCTATCCATTCAAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATATCTATAACGAATAGATCCAAAAATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:1801816/1‑135 ATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT > 1:424605/1‑124 TTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTA > 1:2357200/1‑135 TTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTA > 2:2132491/1‑135 TTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTA < 2:380442/135‑1 GTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGA < 2:404515/135‑1 TCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAAC > 1:2395233/1‑81 AGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCTATTTA > 2:479019/1‑135 AGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTG > 1:402967/1‑135 TATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCT > 2:1861633/1‑135 TATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCT > 2:1113880/1‑135 TATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCT > 1:2577019/1‑135 TATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACG < 2:303307/65‑1 CCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAACCATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 1:707706/135‑1 CCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 1:394688/135‑1 CCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 1:643175/135‑1 CCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 1:1410434/135‑1 CCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 2:1247120/135‑1 CATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA < 2:1473041/135‑1 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATATCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 2:1530148/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAAT < 1:1912597/135‑1 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 1:536646/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 2:2779027/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 1:2532392/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 2:2085630/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 2:1552611/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 1:2170755/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 1:2666597/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 2:1912597/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 2:1867859/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG > 1:246877/1‑95 TTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAATT < 1:2451477/135‑1 TTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAATT < 2:254711/135‑1 | ‑‑GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_34/2107‑2046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAATT > AssemblyC74_contig_56/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |