| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_44 | = 1136 | 0 (0.000) | 304 (0.510) | 80/256 | 0.1 | 100% | coding (1/1134 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_48 | = 844 | 0 (0.000) | coding (843/843 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Chitinase (EC 3.2.1.14) | |||||
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
TTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_44/1003‑1136‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTGGTAATTTC < AssemblyC74_contig_48/844‑712 GTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGC > 1:2654114/1‑135 TAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCG < 2:456505/135‑1 ACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTAT < 2:2092272/135‑1 TATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATAT < 2:821661/135‑1 TCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTT < 2:107627/135‑1 CGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTG < 2:2722179/135‑1 TCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGA < 2:1278793/135‑1 CACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAA > 1:540645/1‑135 CACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATAT > 2:1701902/1‑122 CACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATAT < 1:1701902/122‑1 CAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACA > 2:95025/1‑135 CAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACA > 2:1008902/1‑135 CAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACA > 1:74004/1‑135 CAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGAATCAATATCACAGTTTTGGAACA > 2:681243/1‑135 TGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTG > 2:1581314/1‑135 TCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGACACAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTATGGAACATATTAGAAAGA > 1:2471382/1‑135 CCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGAT < 1:2856523/135‑1 CCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGAT < 2:1974711/135‑1 ACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAAGATCACAGTTTTGGTAAATATTTGAAAGATTGGT > 2:1177566/1‑135 CCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTT < 2:362737/135‑1 CAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTG > 1:593475/1‑135 CAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTG > 1:811461/1‑135 CAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTG > 2:8881/1‑135 CAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTG > 2:1988733/1‑135 CAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTG < 2:2150781/135‑1 AGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGT > 1:1289140/1‑135 AAATTTAACGTAGTTAACTTACTACAACCCGTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAATTCAAGCGTATCAATATCACAGTATTGGAACATAGTTGAAAGATTGGTTGTTTTA > 2:1342520/1‑135 AAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTA > 1:1225418/1‑135 AAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTA < 1:942036/135‑1 AAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTA > 1:2671621/1‑135 AAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGG > 1:670734/1‑108 AAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTCGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTA < 2:2029811/135‑1 AATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAG > 2:1459625/1‑135 AATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAG > 2:1549683/1‑135 AATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAG > 1:185424/1‑135 GTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCC < 1:1057603/135‑1 GTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCC < 1:2895036/135‑1 AAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACC < 2:2511036/134‑1 AATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAG < 1:1136205/135‑1 AATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAG > 2:2245995/1‑135 TACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTA < 1:1906033/135‑1 TACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTA < 1:2451865/135‑1 ACAACCCTTTAACATCTTGCTCATATTCGTGACTCTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCTATATAACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATC < 2:2770186/135‑1 ACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATC < 1:1808180/135‑1 ACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATC < 1:1457374/135‑1 CAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCA < 1:829989/135‑1 AACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAA > 2:2885162/1‑135 ACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAAC > 1:1382424/1‑135 TTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATAC > 2:2354038/1‑135 TTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATA < 1:1429650/66‑1 TTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATA > 2:1429650/1‑66 AACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTT < 1:2314794/135‑1 ACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTA > 1:2026441/1‑135 ACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTA > 2:1649412/1‑135 CATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCA > 1:1543881/1‑124 CATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCA < 2:1543881/124‑1 TGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGT < 1:2795223/135‑1 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTT > 2:1222941/1‑135 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTT > 1:2130085/1‑135 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTT > 1:1094070/1‑135 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTT > 2:2417985/1‑135 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTT > 2:71243/1‑135 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATC > 1:2867973/1‑117 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCG < 2:416292/47‑1 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCG > 1:416347/1‑47 ATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAA > 1:2535341/1‑134 TTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAAAATACTTTAATCCGTTAAAATCC > 1:2251448/1‑135 TCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCT < 2:2654114/135‑1 TCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCT < 1:373852/135‑1 CGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTT > 2:556163/1‑135 CACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACA > 1:220069/1‑135 CACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACA > 1:2336263/1‑135 ACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACA > 2:1907977/1‑134 CCAACTACTTAAATCAAGCTTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTATAATCCGGTAAAATCATTAAACATTCCCGCCAGG > 2:1802903/1‑133 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGA > 1:1005866/1‑135 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGA > 2:247739/1‑135 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGA > 2:2591671/1‑135 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGA > 2:2804688/1‑135 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGA > 1:1615053/1‑135 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGA > 1:469927/1‑135 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGA > 1:1198948/1‑135 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGA > 2:1346299/1‑135 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGA > 2:1292284/1‑135 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAAC < 1:1170498/121‑1 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATAAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGA > 1:870913/1‑135 CCAACAACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTATTGGAACATATTTGAAAGATTGGGTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCAGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGA > 2:1555779/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 2:2909329/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 1:1731574/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 1:2487428/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 1:978541/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 2:1116926/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 2:2461116/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 2:2320753/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCATAAACATTCCCGCCAGGGAA > 2:211790/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCATTAAACATTCCAGCCAGGGAA > 1:2699623/1‑135 TACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTG > 2:2677583/1‑135 ACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTGG > 1:257050/1‑135 AAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGACTTTGGTAAT > 2:2856903/1‑135 AAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTGGTAAT > 1:1983221/1‑135 AATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTGGTAAT > 2:657397/1‑134 TTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_44/1003‑1136‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTGGTAATTTC < AssemblyC74_contig_48/844‑712 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |