| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_44 | = 1136 | 0 (0.000) | 304 (0.510) | 80/256 | 0.1 | 100% | coding (1/1134 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_48 | = 844 | 0 (0.000) | coding (843/843 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Chitinase (EC 3.2.1.14) | |||||
Only 100 of 639 total aligned reads displayed.
ATTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_44/1002‑1136 | tGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtgg > 2:568510‑M2/1‑132 (MQ=255) tGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaag < 2:704467‑M1/135‑4 (MQ=255) tAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggag > 1:2574397‑M2/1‑130 (MQ=255) tAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcg < 2:456505‑M1/135‑6 (MQ=255) tAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcg < 1:1397471‑M1/135‑6 (MQ=255) aCATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtat < 2:2092272‑M1/135‑9 (MQ=255) tACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttg > 1:794794‑M2/1‑124 (MQ=255) tACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttg > 2:314526‑M2/1‑124 (MQ=255) cTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaata < 1:1186838‑M1/135‑14 (MQ=255) tATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcc < 2:393727‑M2/135‑15 (MQ=255) tATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatat < 2:821661‑M1/135‑15 (MQ=255) tCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATc < 2:2513510/112‑1 (MQ=255) tCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagt < 2:236035‑M2/135‑24 (MQ=255) cGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtt < 1:2472607‑M2/135‑25 (MQ=255) cGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttg > 1:2252790‑M1/1‑111 (MQ=255) gTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagttt > 1:2432766‑M2/1‑110 (MQ=255) tCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttgga < 2:1278793‑M1/135‑27 (MQ=255) caGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaaca > 1:590708‑M1/1‑106 (MQ=255) gTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacata < 1:2150516‑M1/132‑32 (MQ=255) tGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttg > 2:1581314‑M1/1‑100 (MQ=255) tCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagct < 1:237122‑M2/135‑41 (MQ=255) tCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaaga > 2:1876266‑M1/1‑95 (MQ=255) cccAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagcta > 2:1685676‑M2/1‑94 (MQ=255) cAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttg > 2:1057603‑M1/1‑88 (MQ=255) cAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttg > 1:811461‑M1/1‑88 (MQ=255) aGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagt < 2:14401‑M2/135‑49 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta < 2:2870526‑M1/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta < 1:1096753‑M1/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta < 1:942036‑M1/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta > 1:107132‑M1/1‑83 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta > 1:1225418‑M1/1‑83 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttcgaacatatttgaaagattggttgtttta < 2:2029811‑M1/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATAtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggt < 2:373703‑M2/135‑53 (MQ=255) aaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttag > 1:2679727‑M1/1‑82 (MQ=255) aaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttag > 2:1549776‑M1/1‑82 (MQ=255) aaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttag > 2:1154372‑M1/1‑82 (MQ=255) aaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAAACCATGAAACTATTGCTCATAGTCGTGACACTAGACAGGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtcaagtttgtgaacattccagctcccgaagtaggt < 1:2204844‑M2/134‑53 (MQ=255) aaCGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttc > 2:2547458‑M2/1‑77 (MQ=255) gTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaa > 1:1139830‑M2/1‑74 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:1339441‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 2:1413003‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:229917‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:713600‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:2773318‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:1262777‑M2/1‑71 (MQ=255) aaaTTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgct < 1:1163280‑M2/134‑67 (MQ=255) aaaTTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaacc < 2:1772650‑M1/134‑67 (MQ=255) aaTTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccag > 2:1019553‑M2/1‑67 (MQ=255) aTTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagt < 1:1711855‑M1/135‑70 (MQ=255) tactacAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagtta < 1:1906042‑M1/135‑72 (MQ=255) cAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatca < 1:829989‑M1/135‑77 (MQ=255) cAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatca < 2:1986172‑M1/135‑77 (MQ=255) cATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:233636‑M2/1‑48 (MQ=255) cATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcattatcacagttttggtacatatgtgaaagtttggttgttttagttaaatccctaccaggtaaatcaacatacgttga > 2:2677188‑M1/1‑48 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaaca < 1:1879982‑M2/135‑94 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaaca < 1:1775873‑M2/135‑94 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaaca < 1:1553845‑M2/135‑94 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgtt < 2:2757092‑M1/135‑94 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgtt > 2:1222941‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgtt > 2:2176072‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagtta < 2:2423034‑M1/113‑72 (MQ=255) cTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacg > 2:2246317‑M2/1‑41 (MQ=255) tCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaa > 1:2107844‑M1/1‑40 (MQ=255) atatTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaattt > 1:664555‑M2/1‑38 (MQ=255) atatTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaattt > 1:2489562‑M2/1‑38 (MQ=255) atatTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaattt > 1:14401‑M2/1‑38 (MQ=255) atatTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaa > 1:990797‑M1/1‑38 (MQ=255) tatTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttg > 1:368311‑M2/1‑37 (MQ=255) ttCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 2:766717‑M2/1‑35 (MQ=255) tCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaa > 1:1509480‑M2/1‑34 (MQ=255) cGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 2:1813917‑M2/1‑33 (MQ=255) cGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatcctt > 1:2858269‑M1/1‑33 (MQ=255) gTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaac > 1:880721‑M2/1‑32 (MQ=255) gTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaac > 1:393727‑M2/1‑32 (MQ=255) acacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc < 2:1933858‑M1/104‑76 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatac < 1:7769‑M2/135‑108 (MQ=255) acTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacat < 2:1521669‑M1/135‑109 (MQ=255) aGACATGTCCCAACTACTGAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatc > 2:913834‑M2/1‑24 (MQ=255) gACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatcc < 1:1023785‑M2/135‑113 (MQ=255) aCATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatcca < 2:2135762‑M2/135‑114 (MQ=255) aTGTCCCAACTACTTTCATCcagcgtatcaatatcaccgttttggaacttatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttatacattcccg < 2:2471382‑M1/133‑114 (MQ=255) aTGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatg < 2:518387‑M2/135‑116 (MQ=255) aTGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccat > 1:253744‑M2/1‑20 (MQ=255) aTGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccg < 1:2637149‑M1/133‑114 (MQ=255) tGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgt > 2:64642‑M2/1‑19 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 1:1626002‑M2/135‑121 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 1:475226‑M2/135‑121 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatc > 1:2915128‑M2/1‑15 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccaggga > 2:2804688‑M1/1‑15 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccaggga > 1:1984443‑M1/1‑15 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccaggga > 2:1332172‑M1/1‑15 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccaggga > 2:2591671‑M1/1‑15 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccaggga > 2:1346299‑M1/1‑15 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccaggga > 1:1005866‑M1/1‑15 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc < 2:109931‑M1/90‑76 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 1:1829077‑M2/134‑121 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgacccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 2:873915‑M2/134‑121 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaa > 1:434910‑M1/1‑14 (MQ=255) actTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtcacaca < 2:2319317‑M2/135‑127 (MQ=255) aaTCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtcacacaggaag < 2:2906771‑M2/135‑132 (MQ=255) | ATTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_44/1002‑1136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |