| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_27 | 7574 = | 273 (0.920) | 280 (0.650) | 58/236 | 1.1 | 69.0% | coding (551/705 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) |
| ? | AssemblyC74_contig_37 | 11 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑425) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 619 total aligned reads displayed.
GTTAACGGATGTTCTTGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAA > AssemblyC74_contig_27/7440‑7709 | gTTAACGGATGTTCTTGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCAt > 2:840547/1‑135 (MQ=255)gTTAACGGATGTTCTTGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCAt > 1:2793504/1‑135 (MQ=255) ttAACGGATGTTCTTGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCAtt > 2:2538764/1‑135 (MQ=255) taacgaatagtttatggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaattt < 1:929932‑M1/2‑1 (MQ=255) aacgaatagtttatggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatttt > 2:2615971‑M1/133‑135 (MQ=255) aacgaatagtttatggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatttt > 1:2309418‑M1/133‑135 (MQ=255) aacgaatagtttatggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatttt > 2:283984‑M1/133‑135 (MQ=255) aacgaatagtttatggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatttt > 2:1358113‑M1/133‑135 (MQ=255) acgaatagtttatggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTg > 2:2135485‑M1/132‑135 (MQ=255) aaCGGATGTTCTTGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCAt < 2:2376326/132‑1 (MQ=255) aaCGGATGTTCTTGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTg < 2:946627/135‑1 (MQ=255) aaCGGATGTTCTTGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTg < 1:179751/135‑1 (MQ=255) cgaatagtttatggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGt > 1:1665838‑M1/131‑135 (MQ=255) cgaatagtttatggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGt > 1:1132913‑M1/131‑135 (MQ=255) gaatagtttatggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGtt > 2:646799‑M1/130‑135 (MQ=255) gaatagtttatggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGtt > 1:1076339‑M1/130‑135 (MQ=255) aatagtttatggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaattttattTTTGTTc < 2:2808432‑M1/7‑1 (MQ=255) aatagtttatggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTc < 2:114664‑M1/7‑1 (MQ=255) gTTCTTGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAAc < 1:840827/135‑1 (MQ=255) tttatggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaaatctctagaatgtcataggacccatttaaagtatttaaatttagtagtttaatatgtttaaaatttaatTTTGTTCAAACt < 1:1198581‑M1/12‑1 (MQ=255) ttGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATg > 1:1704925/1‑135 (MQ=255) ttGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATg > 1:286701/1‑135 (MQ=255) ttGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATg > 2:2880537/1‑135 (MQ=255) ttGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATg > 2:87985/1‑135 (MQ=255) ttGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATg > 2:24764/1‑135 (MQ=255) ttGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACATAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAAAAGGAAATTCGGCAATTGATTCTTTTAAATATACCATTTGTTAAAACTAtt > 2:1301777/1‑134 (MQ=255) ggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGaa < 1:1002682‑M1/17‑1 (MQ=255) gcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttattTTTGTTCAAACTATGAAc > 1:1642009‑M1/118‑135 (MQ=255) gcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAAc > 1:897939‑M1/118‑135 (MQ=255) gcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAAc > 1:2126091‑M1/118‑135 (MQ=255) cAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAAc < 2:759242/135‑1 (MQ=255) cAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAAc < 2:1556982/135‑1 (MQ=255) cAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAAc < 1:2901334/135‑1 (MQ=255) cAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAAc < 1:495773/135‑1 (MQ=255) tttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGtt < 2:2006805‑M1/6‑1 (MQ=255) tttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGt < 1:2478646‑M1/25‑1 (MQ=255) tttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaaatctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGt < 2:506304‑M1/25‑1 (MQ=255) tatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGttt > 1:2069098‑M1/109‑135 (MQ=255) gCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGt < 1:2832764/108‑1 (MQ=255) gCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAAcc > 2:1421825/1‑135 (MQ=255) catttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGtt < 1:1479002‑M1/6‑1 (MQ=255) aCCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAAc > 2:2184693/1‑119 (MQ=255) aCCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCa > 2:1733534/1‑134 (MQ=255) ttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTATCCAATCa < 1:143987‑M1/37‑1 (MQ=255) caAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTAt > 1:2235614/1‑135 (MQ=255) aaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGaa < 2:78573‑M1/45‑1 (MQ=255) aaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGaaa < 1:2433904‑M1/46‑1 (MQ=255) aatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGaaaaaa > 2:1611282‑M1/87‑135 (MQ=255) aatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGaaaaaa > 2:2108183‑M1/87‑135 (MQ=255) aatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGaaaaaa > 2:714676‑M1/87‑135 (MQ=255) aatgctgcattgagtaattctctagactgtaataggtcccatttatagtatttaattttagtagttgaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATACAGTTTTAACCAATAATTATGGaaaaaa > 2:1198581‑M1/87‑135 (MQ=255) aatgctgcattgagtaattcactagactgacataggaccccattacagaatttaattttagtagtttaatatgatttaaattaaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGaaaaaa > 2:1448695‑M1/87‑135 (MQ=255) aaaGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGGTGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGaaaaaaa < 1:273291/135‑1 (MQ=255) aaaGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGaaaaaaa < 1:1570485/135‑1 (MQ=255) aaaGAAAATTTACTTAGAGAAAATCAATCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGaaaaaaa < 2:355906/135‑1 (MQ=255) aGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTTATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAAt < 2:221229/135‑1 (MQ=255) aGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAAt > 2:2762017/1‑135 (MQ=255) tgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCttat > 2:2162846‑M1/77‑135 (MQ=255) tgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCttat > 2:432465‑M1/77‑135 (MQ=255) tACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCttat < 1:2650134/135‑1 (MQ=255) taggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGaaaa < 1:1867078‑M1/81‑1 (MQ=255) gATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAgg > 1:965410/1‑135 (MQ=255) atttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATcgacg < 1:199375‑M1/75‑1 (MQ=255) ttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGtt < 1:1529378‑M1/6‑1 (MQ=255) ttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGaa > 1:62440‑M1/45‑135 (MQ=255) ttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGa < 2:2405125‑M1/90‑1 (MQ=255) ttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGa < 1:1343285‑M1/90‑1 (MQ=255) ttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGa < 2:1057985‑M1/90‑1 (MQ=255) ttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGa < 1:441609‑M1/90‑1 (MQ=255) ttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGa < 1:814216‑M1/90‑1 (MQ=255) ttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGa < 2:1845747‑M1/90‑1 (MQ=255) ttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAAATGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGa < 2:2729740‑M1/90‑1 (MQ=255) aaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAAcc < 1:2598888‑M1/93‑1 (MQ=255) tAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCaa < 1:2160078/135‑1 (MQ=255) atttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGtt < 2:1692156‑M1/6‑1 (MQ=255) gAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATcgacg > 1:770740/1‑109 (MQ=255) gAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAAACAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGTGGAACCAATGATTa > 2:2235338/1‑135 (MQ=255) aattttagaagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATACTGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCTACGAGAAAATTTATGGGAACCAATGATTaa < 2:2577860‑M1/102‑1 (MQ=255) attttagtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAat < 2:314689‑M1/103‑1 (MQ=255) aaTACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGAtt < 2:2312774/132‑1 (MQ=255) aaTACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGAt < 1:1748290/131‑1 (MQ=255) aTACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCtt < 1:2549972/88‑1 (MQ=255) aCGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAatata > 2:396314/1‑135 (MQ=255) agtagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATAtt > 2:176699‑M1/28‑135 (MQ=255) ggCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATAtt < 1:1924676/135‑1 (MQ=255) tagtttaatatgttttaaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCtt > 2:1488209‑M1/26‑82 (MQ=255) aTTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGaaaaaaa < 1:580146/72‑1 (MQ=255) aTTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGaaaaaaa > 2:580146/1‑72 (MQ=255) tGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGc > 1:2199037/1‑135 (MQ=255) aTGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCaa > 1:1036739/1‑135 (MQ=255) ttAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAg < 2:1799300/100‑1 (MQ=255) ttAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATAAATATATTTAAAGCAATTAAt > 1:385714/1‑135 (MQ=255) aaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAAtt < 1:683560‑M1/126‑1 (MQ=255) aaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAAtt < 2:1971681‑M1/126‑1 (MQ=255) aaatttaatTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAA‑TTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAAtt < 1:330145‑M1/126‑1 (MQ=255) cATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGa > 1:1228331/1‑135 (MQ=255) aTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAAtt < 2:1887793/54‑1 (MQ=255) aTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGAt > 2:601352/1‑101 (MQ=255) aTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGaa > 2:1653610/1‑135 (MQ=255) aTTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGaa > 2:1210416/1‑135 (MQ=255) | GTTAACGGATGTTCTTGCAGATATGTATTTTGCACCTACACAAAAAAATAAAGAAAATTTACTTAGAGAAAATCATTCTAATAAAAGGATCTATGTAACAGGAAATACGGCAATTGATGCTTTAAAATATACCATTTGTTCAAACTATGAACATCCAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAA > AssemblyC74_contig_27/7440‑7709 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |