New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_27 | 7574 = | 273 (0.920) | 280 (0.650) | 58/236 | 1.1 | 69.0% | coding (551/705 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) |
? | AssemblyC74_contig_37 | 11 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑425) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein |
Only 100 of 645 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTCGTTAAT > AssemblyC74_contig_37/1‑145 | aattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAAttt < 2:2378890‑M2/9‑1 (MQ=255) accccactgtgctaaaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAAc > 2:213775‑M2/112‑135 (MQ=255) gtgctaaaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTa > 1:2842414‑M2/104‑133 (MQ=255) gtgctaaaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTa > 1:2322800‑M2/104‑133 (MQ=255) gctaaaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAac > 1:209192‑M2/102‑134 (MQ=255) gctaaaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAac > 2:2513590‑M2/102‑134 (MQ=255) ctaaaatctctatcgattcccctttttcctatatcaagagatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAacta < 2:1248081‑M2/35‑1 (MQ=255) ctaaaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatacattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAacta < 2:1345592‑M2/35‑1 (MQ=255) taaaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttatacaTTTGTACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAactac > 1:1491486‑M2/100‑135 (MQ=255) aatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAactact > 2:1186982‑M2/109‑135 (MQ=255) aaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAActacta > 2:374273‑M2/98‑135 (MQ=255) aaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctgtataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAActacta > 1:679779‑M2/98‑135 (MQ=255) ctaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAt < 1:526835‑M2/42‑1 (MQ=255) attaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAt < 2:2832529‑M2/32‑1 (MQ=255) ttaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAtt < 2:1648783‑M2/33‑1 (MQ=255) ttaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAtt < 1:4755‑M2/33‑1 (MQ=255) taaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAtt < 1:2141463‑M2/43‑1 (MQ=255) aatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaattaaatt < 2:640149‑M2/8‑1 (MQ=255) aatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTaa > 2:1442135‑M2/101‑135 (MQ=255) atcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTaaa > 1:1845129‑M2/90‑135 (MQ=255) cgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTaaa > 1:2525049‑M2/88‑133 (MQ=255) cgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTaaa > 1:2059286‑M2/88‑133 (MQ=255) cgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTaaa > 1:633421‑M2/88‑133 (MQ=255) tcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACttt < 1:1233694‑M2/52‑1 (MQ=255) ttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa > 2:2011428‑M2/92‑135 (MQ=255) ccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 2:2677040‑M2/54‑1 (MQ=255) ccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 2:1035107‑M2/54‑1 (MQ=255) ccctttttcctatatcaagatatccatttattgataatttaacattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 2:2746559‑M2/54‑1 (MQ=255) ccctttttcctatatcaagatatcaattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccATTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTCCTAAAATTAAATACTTTaa < 2:1949087‑M2/54‑1 (MQ=255) tcccctcaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 1:2886981‑M2/44‑1 (MQ=255) tcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 2:1504130‑M2/44‑1 (MQ=255) tcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 1:814216‑M2/44‑1 (MQ=255) tcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 1:263376‑M2/44‑1 (MQ=255) tcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 2:1845747‑M2/44‑1 (MQ=255) tcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 1:2200699‑M2/44‑1 (MQ=255) tcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 2:21109‑M2/44‑1 (MQ=255) tcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACATTaa < 1:2454344‑M2/44‑1 (MQ=255) tcccctaaagtttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 2:2225262‑M2/44‑1 (MQ=255) ctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAAt < 2:444841‑M2/56‑1 (MQ=255) ctttttcctatatcaagatatccattttatgataatttaaaattatcttccaaatataatcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAAt < 2:1603913‑M2/56‑1 (MQ=255) cccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAAt < 1:1780343‑M2/46‑1 (MQ=255) ctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATggg < 1:38299‑M2/49‑1 (MQ=255) cctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa > 2:2413147‑M2/74‑127 (MQ=255) aattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 1:2360183‑M2/44‑1 (MQ=255) ttttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTa < 2:1685832‑M2/54‑1 (MQ=255) ttttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTa < 1:1078879‑M2/54‑1 (MQ=255) tatatcaagttatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTa < 2:550485‑M2/64‑1 (MQ=255) tcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTa > 2:2900674‑M2/68‑131 (MQ=255) caagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACa > 1:837541‑M2/67‑135 (MQ=255) ttcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGt < 1:927540‑M2/61‑1 (MQ=255) gtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGt < 1:1028187‑M2/61‑1 (MQ=255) gtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGt < 1:300969‑M2/61‑1 (MQ=255) gtcgatgaacagtaaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGt < 2:2599120‑M2/61‑1 (MQ=255) agatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGt < 1:958700‑M2/71‑1 (MQ=255) gaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTaga < 2:1780118‑M2/66‑1 (MQ=255) attttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa > 2:2564793‑M2/57‑110 (MQ=255) attttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 1:2564793‑M2/54‑1 (MQ=255) attttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGt > 2:15508‑M2/57‑127 (MQ=255) attttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGaa > 2:2296431‑M2/57‑135 (MQ=255) attttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttatacaTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATAAAAAACTTTAAATTTGTCCTATGACAGACTAGAGaa > 1:1332390‑M2/57‑135 (MQ=255) aataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAAtt < 1:2725465‑M2/71‑1 (MQ=255) ataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAAt < 1:1732131‑M2/46‑1 (MQ=255) ataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAAt > 2:1732131‑M2/60‑105 (MQ=255) ataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAACTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCa > 2:142928‑M2/60‑135 (MQ=255) taagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCaa < 1:432465‑M2/77‑1 (MQ=255) ataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCaa < 1:2802254‑M2/87‑1 (MQ=255) ttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCAtt > 1:1470717‑M2/50‑135 (MQ=255) ttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACCAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTaga > 2:2174357‑M2/50‑115 (MQ=255) tccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTc > 1:1926300‑M2/45‑135 (MQ=255) cataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCAt > 1:1603108‑M2/43‑135 (MQ=255) tccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCAt > 2:1310186‑M2/32‑134 (MQ=255) tgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCaa < 2:768187‑M2/98‑1 (MQ=255) aatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCaa < 2:1135614‑M2/108‑1 (MQ=255) attcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAACACATATTAAACTACTAAAATTTAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATg < 2:711503‑M2/113‑1 (MQ=255) attcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATg < 2:2067768‑M2/113‑1 (MQ=255) attcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATg < 1:1537043‑M2/113‑1 (MQ=255) actggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGATTTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATaaa < 2:506304‑M2/110‑1 (MQ=255) actggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATaaa < 1:1151835‑M2/110‑1 (MQ=255) actggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATaaa < 2:412394‑M2/110‑1 (MQ=255) aacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAACTTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTGTTTCATTGCAAAAATGCTATaaa < 2:1912197‑M2/120‑1 (MQ=255) aacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATg < 2:814178‑M2/66‑1 (MQ=255) aacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATaaa < 1:1442755‑M2/120‑1 (MQ=255) aacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATaaa < 1:1386637‑M2/120‑1 (MQ=255) aacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATaaa < 1:1310186‑M2/120‑1 (MQ=255) acttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAg < 2:909617‑M2/121‑1 (MQ=255) cttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGt > 1:2280767‑M2/14‑135 (MQ=255) cctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTaa > 1:1973518‑M2/11‑134 (MQ=255) gttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGc > 1:737876‑M2/19‑135 (MQ=255) ttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGcc < 1:1002682‑M2/118‑1 (MQ=255) agtttgaacaaaATTAAATTTTAAACATATTAAACTACTAAATTTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACATTCTAGAGATTTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATaaa < 1:1198581‑M2/123‑1 (MQ=255) agtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATa > 2:322895‑M2/13‑133 (MQ=255) aacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTa < 1:984047‑M2/54‑1 (MQ=255) aacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAg > 2:2865963‑M2/7‑66 (MQ=255) aacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATg > 2:1479002‑M2/7‑109 (MQ=255) aacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATaaa < 2:2792158‑M2/110‑1 (MQ=255) aacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTc > 2:969915‑M2/7‑135 (MQ=255) aacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTc > 2:2340288‑M2/7‑135 (MQ=255) aacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTc > 2:1983315‑M2/7‑135 (MQ=255) acaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTCg > 1:1665838‑M2/6‑135 (MQ=255) aaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTCGtt > 2:2472927‑M2/4‑135 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTCGTTAAT > AssemblyC74_contig_37/1‑145 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |