| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_44 | = 810 | 795 (0.910) | 229 (0.470) +GCACTCTTGTCACCATCAAT |
52/216 | 0.0 | 40.6% | coding (327/1134 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_60 | = 439 | 0 (0.000) | coding (438/438 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | FIG00630508: hypothetical protein | |||||
Only 100 of 1084 total aligned reads displayed.
TTGATCTTATCTTGCGTTATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCTAGACTAGTTAGACTTGAACAATTCTCGAACAGATAATC > AssemblyC74_contig_44/676‑941 | tcaatcttatcttGCGTTATTCCATCATTCAAAACGGTATGCGCATCATCTTTAAACAACGTATTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAAt < 1:995023/132‑1 (MQ=255)tcaatcttatcttGCGTTATTCCATCATTCAAAACGGTATGCGCATCATCTTTAAACAACGTATTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAAt < 2:1860429/132‑1 (MQ=255)tcaatcttatcttGCGTTATTCCATCATTCAAAACGGTATGCGCATCATCTTTAAACAACGTATTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAAt < 2:2434988/132‑1 (MQ=255)tcaatcttatcttGCGTTATTCCATCATTCAAAACGGTATGCGCATCATCTTTAAACAACGTATTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAAt < 2:523940/132‑1 (MQ=255)tcaatcttatcttGCGTTATTCCATCATTCAAAACGGTATGCGCATCATCTTTAAACAACGTATTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAAt < 1:1239842/132‑1 (MQ=255)tcaatcttatcttGCGTTATTCCATCATTCAAAACGGTATGCGCATCATCTTTAAACAACGTATTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAAt < 2:1047446/132‑1 (MQ=255) caatcttatcttGCGTTATTCCATCATTCAAAACGGTATGCGCATCATCTTTAAACAACGTATTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAAtg > 2:1728427/3‑134 (MQ=255) ttatcttGCGTTATTCCATCATTCAAAACGGTATGCGCATCATCTTTAAACAACGTATTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAAtgcactc < 2:917840/135‑7 (MQ=255) tatcttGCGTTATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCtt < 1:2588490/135‑1 (MQ=255) ttGCGTTATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTtct > 1:1091137/1‑134 (MQ=255) ttGCGTTATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTtct > 1:1859904/1‑134 (MQ=255) gCGTTATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTtctctc > 2:1680344/1‑135 (MQ=255) ttATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCAt < 1:2820947/135‑1 (MQ=255) tATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATa > 2:558801/1‑135 (MQ=255) tATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATa > 2:326983/1‑135 (MQ=255) tATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATa > 2:2831138/1‑135 (MQ=255) tATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATa > 1:364654/1‑135 (MQ=255) tATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATa > 1:271379/1‑135 (MQ=255) tcatTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGa < 1:176509/135‑1 (MQ=255) ttCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTtctc > 2:2602500/1‑119 (MQ=255) ttCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACaa > 2:2236060/1‑135 (MQ=255) aaaaCAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAAttt > 1:1385508/1‑135 (MQ=255) aaaCGGTATGCGCATCATCTTTAAACAACGTATTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaatttt < 1:709955‑M1/135‑32 (MQ=255) aaCAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAAttttt < 2:1528915/135‑1 (MQ=255) aCAGTATGTGTATCAACTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTCATATTCGAAAAGCGAGTGAATTTAGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAAtttttt < 2:688360/135‑1 (MQ=255) ggtATGCGCATCATCTTTAAACAACGTATTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttac < 2:2489767‑M1/134‑36 (MQ=255) ggtATGCGCATCATCTTTAAACAACGTATTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaatttttta > 1:2148467‑M1/2‑100 (MQ=255) tgtgTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGcc < 1:252471/134‑1 (MQ=255) gtgtATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACTACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAAGATTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCt > 2:2644035/1‑135 (MQ=255) gtgtATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCt > 1:2319517/1‑135 (MQ=255) gtgtATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCt > 2:1358061/1‑135 (MQ=255) gtgtATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCt > 1:319407/1‑135 (MQ=255) gtgtATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGATTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAgacat > 1:2208297/1‑131 (MQ=255) gtgtATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATAGTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTGTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCt > 1:821661/1‑135 (MQ=255) gcgcatcatctttaAACAACGTATTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccat > 1:953987‑M1/5‑95 (MQ=255) gcgcatcatctttaAACAACGTATTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccat > 2:1267894‑M1/5‑95 (MQ=255) tttAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAAttt > 2:1464386/1‑87 (MQ=255) tttAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAatat > 1:1872184/1‑132 (MQ=255) tttAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAatat > 1:155310/1‑132 (MQ=255) tttAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAatat > 2:272281/1‑132 (MQ=255) tAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAatat > 2:1175176/1‑130 (MQ=255) aataatGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTc > 1:2490910/1‑135 (MQ=255) aataatGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTc > 2:95047/1‑135 (MQ=255) atGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAACAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAg < 2:1608458/135‑1 (MQ=255) tGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGa < 2:1945817/135‑1 (MQ=255) tGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGa < 1:915311/135‑1 (MQ=255) tGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGa < 1:1722215/135‑1 (MQ=255) cgtATTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataag < 1:2895649‑M1/134‑60 (MQ=255) aTTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAg < 2:2326044/131‑1 (MQ=255) aTTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGt > 1:1352725/1‑135 (MQ=255) aTTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAAt < 1:1415320/73‑1 (MQ=255) aTTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAAt > 2:1415320/1‑73 (MQ=255) aTTCACTGTGTTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataagaaa > 2:464459‑M1/1‑73 (MQ=255) tttACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATGCACTCTTGTCACCATCAATCACACAATTTTTTACACCACAAAACATATTAGTCATAGAAGTAACCTTCGAc > 1:2376156/1‑135 (MQ=255) tttACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATGCACTCTTGTCACCATCAATCACACAATTTTTTACACCACAAAACATATTAGTCATAGAAGTAACCTTCGAc > 1:2051094/1‑135 (MQ=255) ttACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataagaaaaaccttcgacg > 1:2768272‑M1/1‑62 (MQ=255) ttACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaata > 2:2384895‑M1/1‑62 (MQ=255) ttACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATGCACTCTTGTCACCATCAATCACACAATTTTTTACACCACAAAACATATTAGTCATAGAAGTAACCTTCGACg > 1:1979074/1‑135 (MQ=255) ttACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATGCACTCTTGTCACCATCAATCACACAATTTTTTACACCACAAAACATATTAGTCATAGAAGTAACCTTCGACg > 1:1460510/1‑135 (MQ=255) ttACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATGCACTCTTGTCACCATCAATCACACAATTTTTTACACCACAAAACATATTAGTCATAGAAGTAACCTTCGACg > 2:2879712/1‑135 (MQ=255) ttACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACg > 2:215386/1‑135 (MQ=255) tACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtccccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataagaaaaaccttcgacgt > 1:783144‑M1/1‑61 (MQ=255) tACGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATGCACTCTTGTCACCATCAATCACACAATTTTTTACACCACAAAACATATTAGTCATAGAAGTAACCTTCGACg < 1:1025601/134‑1 (MQ=255) aCGACATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATGCACTCTTGTCACCATCAATCACACAATTTTTTACACCACAAAACATATTAGTCATAGAAGTAACCTTCGACGt > 1:1505310/1‑134 (MQ=255) aCATCTTCTAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATGCACTCTTGTCACCATCAATCACACAATTTTTTACACCACAAAACATATTAGTCATAGAAGTAACCTTCGACGTATcc < 1:484837/135‑2 (MQ=255) ttctAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataagaaaaaccttcgacgtatcccaat > 1:637069‑M1/1‑52 (MQ=255) ttctAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAAtt < 2:1307002/135‑1 (MQ=255) ttctAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAAtt < 2:1236104/135‑1 (MQ=255) ttctAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAAt > 2:1892006/1‑134 (MQ=255) tctAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTg < 1:2088055/135‑1 (MQ=255) tctAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTg < 1:1000324/135‑1 (MQ=255) ctAACCAGATATTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataagaaaaaccttcgacgtatcccaattac > 2:252441‑M1/1‑50 (MQ=255) ctAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGc > 1:558226/1‑135 (MQ=255) aCCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTa < 1:1808000/135‑1 (MQ=255) atatatGACGCCTCTAAACTAATACCAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTCAGCCCTTAAATATTACTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCt < 2:1808250/135‑1 (MQ=255) atTTGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataagaaaaaccttcgacgtatcccaattacttacatct < 2:2077032‑M1/133‑94 (MQ=255) atTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCt < 2:599655/133‑1 (MQ=255) atTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCt < 1:1937287/133‑1 (MQ=255) tttGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataagaaaaaccttcgacgtatcccaatt > 1:749701‑M1/1‑39 (MQ=255) tttGATGCATCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaataacacaaatttttacaacatcaaaaatgtcacccataagaaaaaccttcgacgtatcacaattacttacatctaat > 1:2859302‑M1/1‑39 (MQ=255) tttGATGCACCTAAATTGATATCAGAAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataagaaaaaccttcgacgtatcccaattacttacatctaat > 2:419178‑M1/1‑39 (MQ=255) tttGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCTa > 2:811083/1‑133 (MQ=255) tttGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCTa > 2:1121395/1‑133 (MQ=255) tttGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCTa > 2:773721/1‑133 (MQ=255) gttGACGAATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAAGTTTCCTTTCTCTCCATAGATAATACAATTTTTTAAGCCCTAAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCTa > 2:1990862/2‑133 (MQ=255) aaattgatatcagaaaAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataagaaaaaccttcgacgtatcccaattacttacatctaatgtggttaaagag < 1:1141181‑M1/129‑109 (MQ=255) aaattgatatcagaaaAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataagaaaaaccttcgacgtatcccaattacttacatctaatgtggttaaaga > 1:1194074‑M1/7‑27 (MQ=255) aaaCTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCTAGACTAGTTAGACtt > 1:2637442/1‑135 (MQ=255) aattgatatcagaaAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataagaaaaaccttcgacgtatcccaattacttacatctaatgtggttaaagagc < 1:2434450‑M1/130‑110 (MQ=255) aattgatatcagaaAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataagaaaaaccttcgacgtatcccaattacttacatctaatgtggttaaagagc < 2:373674‑M1/130‑110 (MQ=255) aaCTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGTTGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCTAGACTAGTTAGACTTg < 1:1641242/135‑1 (MQ=255) ttAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCTAGACTAg > 1:418615/1‑118 (MQ=255) tcagaAAAACGAGTAAATgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataagaaaaaccttcgacgtatcccaattacttacatctaatgtggttaaagagccacaacct > 1:869882‑M1/3‑18 (MQ=255) tacaaaaGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTCTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCATAAATCTAGACTAGTTAGACTTGAACAATtct < 2:2676546/132‑1 (MQ=255) tAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCTAGACTAGTTAGACTTGAACAATtct < 2:2782436/135‑1 (MQ=255) tAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCTAGACTAGTTAGACTTGAACAATtct > 2:866553/1‑135 (MQ=255) aaGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCTAGACTAGTTAGACTTGAACAATTCTCGAAc < 2:734915/135‑1 (MQ=255) aaGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCTAGACTAGTTAGACTTGAACAATTCTCGAAc < 1:1682345/135‑1 (MQ=255) gAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCTAGACTAGTTAGACTTGAACAATTCTCGAACAGATAATc > 1:2254235/1‑135 (MQ=255) aaTgcactcttgtcaccatcaattacacaattttttacaccatcaaatatgtcacccataagaaaaaccttcgacgtatcccaattacttacatctaatgtggttaaagagccacaaccttggaacataccact < 1:1299829‑M1/134‑132 (MQ=255) | TTGATCTTATCTTGCGTTATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTACGACATCTTCTAACCAGATATTTGACGCATCTAAACTAATATTAGAAAAGCGAGTGAATTTTGCTTTCTCTCCATAGATAAGACAATTTTTTAAGCCCTTAAATATTTCTGTCATAGAAGTCACTTTGGACGTATCAAAATTGCTTAAATCTAGACTAGTTAGACTTGAACAATTCTCGAACAGATAATC > AssemblyC74_contig_44/676‑941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |