New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | AssemblyC74_contig_19 | = 19031 | 0 (0.000) | 266 (0.700) | 78/256 | 0.3 | 100% | intergenic (+109/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity/– | Phage lysin, N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase (EC 3.5.1.28)/– |
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Only 100 of 571 total aligned reads displayed.
CTTTTGCCACCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_53/489‑622 | cTTTTGCCACCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGa > 2:2420829/1‑134 (MQ=255) cTTTTGCCACCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGa > 2:553784/1‑134 (MQ=255) ttGCCACCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgac < 1:1047179‑M2/134‑4 (MQ=255) ccACCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactact < 1:1537022‑M2/135‑8 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |