| New junction evidence | |||||||||||
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CATTACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_45/868‑1002 | cATTACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCg < 2:1429811/135‑1 (MQ=255) gTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGttcttataaaga < 1:1188752‑M2/135‑13 (MQ=255) gTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGttcttataaaga < 2:1863922‑M2/135‑13 (MQ=255) tGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatc > 1:304117‑M2/1‑120 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |