| New junction evidence | |||||||||||
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ACCCCAATCAAAGCCGCACTTCCATACGTCAGTGTTCCCGTAATCCATTCACTATTTCCTACCACATAAGGATTTACTTTCGTGATGGCATCACGTTGATTTAACAACTCTTGGGCTTTCGCTACTAGCTCCAATAATTCTTTTTTCTCGGATAGACTATCTGGTAATTTGTCCACTTCTTTTTTAGCATCATTGATCTTATCTTGCGTTATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTAC > AssemblyC74_contig_44/484‑752 | ccccAATCAAAGCCGCACTTCCATACGTCAGTGTTCCCGTAATCCATTCACTATTTCCTACCACATAAGGATTTACTTTCGTGATGGCATCACGTTGATTTAACAACTCTTGGGCTTTCGCTACTAGCTCCaata > 1:115540/1‑135 (MQ=255) ttggacattggtcttatcgccggtatagttcgtcagcttgtatcttcctaattgatcatcccactctcctgtccaatcgccttcagttgtatcaaataatttttgcgcttgtgcaattaaatccgATAATTCttt < 1:2082331‑M2/10‑1 (MQ=255) cAAAGCCGCACTTCCATACGTCAGTGTTCCCGTAATCCATTCACTATTTCCTACCACATAAGGATTTACTTTCGTGATGGCATCACGTTGATTTAACAACTCTTGGGCTTTCGCTACTAGCTCCAATAATTCttt < 1:982677/135‑1 (MQ=255) cAAAGCCGCACTTCCATACGTCAGTGTTCCCGTAATCCATTCACTATTTCCTACCACATAAGGATTTACTTTCGTGATGGCATCACGTTGATTTAACAACTCTTGGGCTTTCGCTACTAGCTCCAATAATTCttt < 2:472143/135‑1 (MQ=255) 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ctactaGCTCCAATAATTCTTTTTTCTCGGATAGACTATCTGGTAATTTGTCCACTTCTTTTTTAGCATCATTGATCTTATCTTGCGTTATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTAt < 1:2580574/135‑1 (MQ=255) ctactaGCTCCAATAATTCTTTTTTCTCGGATAGACTATCTGGTAATTTGTCCACTTCTTTTTTAGCATCATTGATATTATCTTGCGTTATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTAt < 2:52252/135‑1 (MQ=255) aaatCCGATAATTCTTTTTTTGCGGTTAAACTATCTGGTAATTTGTCCACTGTTTTCTTAGCATCATCAATCTTATCTTGCGTTATTCCATCATTCAAAACGGTATGCGCATCATCTTTAAACAACGTAtt > 1:1908266/4‑131 (MQ=255) aaatCCAATAATTCTTTTTTTGCGGTTAAACTATCTGGTAATTTGTCCACTGTTTTCTTAGCATCATCAATCTTATCTTGCGTTATTCCATCATTCAAAACGGTATGCGCATCATCTTTAAACAACGTAtt > 1:371029/4‑131 (MQ=255) gataatTCTTTTTTTGCGGTTAAACTATCTGGTAATTTGTCCACTGTTTTCTTAGCATCATCAATCTTATCTTGCGTTATTCCATCATTCAAAACGGTATGCGCATCATCTTTAAACAACGTATTCACTGTGtt > 1:2817902/2‑134 (MQ=255) ataatTCTTTTTTCTCGGATAGACTATCTGGTAATTTGTCCACTTCTTTTTTAGCATCATTGATCTTATCTTGCGTTATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTa < 2:2085112/135‑1 (MQ=255) | ACCCCAATCAAAGCCGCACTTCCATACGTCAGTGTTCCCGTAATCCATTCACTATTTCCTACCACATAAGGATTTACTTTCGTGATGGCATCACGTTGATTTAACAACTCTTGGGCTTTCGCTACTAGCTCCAATAATTCTTTTTTCTCGGATAGACTATCTGGTAATTTGTCCACTTCTTTTTTAGCATCATTGATCTTATCTTGCGTTATTCCATCATTCAAAACAGTATGTGTATCATCTTTAAATAATGTATTGACTGTATTTAC > AssemblyC74_contig_44/484‑752 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |