| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_24 | 255 = | 452 (1.050) | 30 (0.430) +TGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCG |
14/42 | 0.5 | 29.6% | coding (255/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_24 | = 265 | 427 (0.990) | coding (265/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GCTATCACTTGTGGTAGAGGATGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_24/302‑255‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTAGTGGTAGATGAATCTGAGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTTGTGGT < AssemblyC74_contig_24/265‑141 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATC > 2:2488804/1‑39 aCTGTACTGTCTCTTGAAGCTGATTTGTACGTTCTATCAATTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTTTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGC < 2:188963/133‑1 TCTGTACTGTCACTTGAATCTGATGTGTCCGAGCTATCACGTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCAGATGTATCCGGGCTATCACGTGTGGGAGAGGTAGTTTCTGTACTGTCGCGTGTAGCg > 1:1346392/1‑134 TCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTAGAATGAAGCT > 2:2945220/1‑135 CTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTG > 2:889505/1‑135 CTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCT > 2:118153/1‑134 TACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTCTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACG < 1:3646717/135‑1 ACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTG < 1:106627/40‑1 ACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTG > 2:106627/1‑40 ACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTG < 1:1333399/40‑1 CTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGT > 1:2030859/1‑134 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTG > 2:1371918/1‑134 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTG > 1:629720/1‑134 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTT > 1:1034957/1‑65 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTT < 2:1034957/65‑1 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTA > 1:3832825/1‑50 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTA < 2:3832825/50‑1 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAG < 1:1593925/48‑1 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGT < 2:315676/46‑1 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGT > 1:315676/1‑46 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA < 1:2234922/43‑1 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA > 2:1702724/1‑43 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA > 2:2234922/1‑43 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTA > 2:3642643/1‑41 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTA < 1:3642643/41‑1 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTG < 1:46375/38‑1 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGT < 1:491391/37‑1 GTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTC < 2:700848/135‑1 CACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTG < 1:3626289/35‑1 ACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGT < 1:2845623/135‑1 ACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTC > 2:3261224/1‑57 ACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAG > 2:57767/1‑44 ACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAG < 1:57767/44‑1 ACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGT > 2:124121/1‑42 ACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA > 2:2989933/1‑39 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTATTATCTGTACTGTCGCTTG > 1:2183874/1‑61 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTTTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCG > 2:2895462/1‑133 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGgg > 1:589647/1‑133 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCG > 2:2895380/1‑133 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCG > 2:34215/1‑133 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGC < 1:3200749/122‑1 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGC > 2:3200749/1‑122 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCAATTGTGGTAGAGGTAGGATGTGTACTGTCGGTTGAAGCTGAAGTGTggg > 2:2292811/1‑130 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTG < 2:2183874/61‑1 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTG < 2:2183790/61‑1 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTG > 1:2183790/1‑61 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTG < 2:549267/61‑1 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAG > 2:3061316/1‑43 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAG < 1:1234731/43‑1 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAG < 1:3061316/43‑1 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGT < 1:3758205/41‑1 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA > 2:3283824/1‑38 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA < 1:3712598/38‑1 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA > 2:3712598/1‑38 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA < 1:3283824/38‑1 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA > 2:2319038/1‑38 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA < 1:2956709/38‑1 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA < 1:2661821/38‑1 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTA < 2:2161293/36‑1 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTA > 1:2161293/1‑36 TTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTC > 2:3905227/1‑55 AAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTgt < 2:2030859/135‑3 AGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTG > 2:1587211/1‑56 AGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTG > 2:349659/1‑56 AGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTG < 1:1587211/56‑1 AGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTG < 1:2046425/56‑1 AGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTG < 1:349659/56‑1 AGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTC < 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GTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTg < 1:2945220/135‑2 GTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTg < 2:3455647/135‑2 GTGTCCGTGATTTCTCTTTTTGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCTCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTg < 1:1175271/135‑2 GTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGGTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTTGAGGTAGTATCTGTACTGTCTGTTGAAGCTGACGGGTCCGTGCTGTGACTTGTGGT > 2:234491/1‑135 CGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTCTCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGAAGTATCCGTGCTATCACGTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga < 2:2293493/135‑4 CGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTtga < 1:118153/135‑4 CGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga < 1:889505/135‑4 GTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTagag > 1:1119803/1‑131 GTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTagag > 2:3528802/1‑131 ACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTGT > 2:1125719/1‑104 GGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGC < 1:1384863/104‑1 CTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTGTCCG > 2:1690208/1‑87 TGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTg < 2:1454935/95‑2 TGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga > 2:2780436/1‑97 TGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga < 1:2780436/100‑4 CTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTg < 2:3648795/90‑2 CTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGT > 2:3507056/1‑77 CTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTG < 1:2010408/72‑1 TGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGC > 2:2709264/1‑63 TGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGC < 1:2709264/63‑1 GAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTg > 1:1570593/1‑86 GAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTg < 2:1570593/87‑2 GTATCTGTACTGTCTCTTGAAGCTTACTTGTCAGTGCTATCACTTGTAGAGGTAGTTGAATCTGAGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATATGTACTGTCACTTGTAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTT < 2:1884940/135‑1 TGTACTGTCTCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTAGTGGTAGATGAATCTGAGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTTGTGGT < 1:702050/135‑1 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GCTATCACTTGTGGTAGAGGATGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_24/302‑255‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTAGTGGTAGATGAATCTGAGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTTGTGGT < AssemblyC74_contig_24/265‑141 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |