| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | AssemblyC74_contig_24 | 255 = | 452 (1.050) | 30 (0.430) +TGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCG |
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| ? | AssemblyC74_contig_24 | = 265 | 427 (0.990) | coding (265/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 607 total aligned reads displayed.
GCGACAGTACGGATACATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCACAAGCGATACACGTCATGCAAGTGTCTCCTTCTCAAAAACA > AssemblyC74_contig_24/121‑389 | gCGACAGTACGGATACATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGt > 2:2799764/1‑135 (MQ=255)caagtgacagcacggacacgtcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacat > 1:2624138‑M1/135‑135 (MQ=255) gACAGTACGGATACATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTc > 1:3181282/1‑134 (MQ=255) tACGGATACATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTc > 2:2698641/1‑135 (MQ=255) cGGATACATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCCCAAGTGATAGCTCAGATACATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCa < 2:3601900/134‑1 (MQ=255) cGGATACATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCa < 2:2996984/134‑1 (MQ=255) aggATACATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTTCAGATCCTACCTCTTCCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCt < 1:2909742/130‑1 (MQ=255) ggATACATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAg < 1:1316262/135‑1 (MQ=255) ggATACATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAg < 1:3506374/135‑1 (MQ=255) ggATACATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAg < 1:1554958/135‑1 (MQ=255) ggATACATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAg < 2:831998/135‑1 (MQ=255) ggATACATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGATCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAg < 1:125835/135‑1 (MQ=255) cggacacgtcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacaTCAGCTTCAAg > 2:34215‑M1/123‑133 (MQ=255) taTCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACa < 2:1869024/134‑1 (MQ=255) cATCTACCACAACACGTGATCGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACTGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACa < 2:3319796/135‑1 (MQ=255) cATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCATCTTCAAGTGACATTACAGATACTACCTCTACCACAAGTTATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACa < 2:1178716/135‑1 (MQ=255) cATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACa < 1:3036626/135‑1 (MQ=255) tCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAg > 1:1836874/1‑134 (MQ=255) cacaACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGa > 1:2283310/1‑135 (MQ=255) agcttcattctacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacaTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGa > 2:2945220‑M1/113‑135 (MQ=255) gcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacaTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGa < 2:894626‑M1/23‑1 (MQ=255) aacaaGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGACACCTTCAAGTGACAGTACAGATAc > 1:3676291/1‑135 (MQ=255) acaaGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACa < 2:1075205/135‑1 (MQ=255) acaaGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACa < 1:1904486/135‑1 (MQ=255) gTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATCCATc > 2:2140401/1‑133 (MQ=255) aGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTAcc < 2:2303154/135‑1 (MQ=255) aCGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACcaca > 2:1904486/1‑135 (MQ=255) ggACACTTCAGCTTCAAGTGACTGTACAGATTCTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATTGCACGGACACGTCAGCTTCTAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAg < 1:401544/135‑1 (MQ=25) 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agattatacCTCTTCCACAAGTGAAAGAACCGATTCATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAg < 2:228033/129‑1 (MQ=17) aGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAg > 1:792545/1‑135 (MQ=255) actacCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAg < 2:732711/131‑1 (MQ=255) actacCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAg < 2:3155152/131‑1 (MQ=255) actacCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAg < 1:3101117/131‑1 (MQ=255) ctacCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTc > 2:2406517/1‑112 (MQ=255) ctacCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTc < 1:2406517/112‑1 (MQ=255) acCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGGTTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAg > 2:1491785/1‑134 (MQ=255) ccTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCt > 2:178540/1‑65 (MQ=255) ccTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTa > 1:141109/1‑135 (MQ=255) ctctACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACt > 1:2074613/1‑121 (MQ=255) ctctACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACt < 2:2074613/121‑1 (MQ=255) tctACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAg < 1:2984876/125‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |