| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_27 | 7574 = | 511 (0.950) | 515 (0.680) | 88/228 | 0.5 | 68.7% | coding (551/705 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) |
| ? | AssemblyC74_contig_37 | 11 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑425) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 744 total aligned reads displayed.
TCTTCATTTTTTTCTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAATTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_27/7718‑7574‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTCGTTA > AssemblyC74_contig_37/11‑143 CTTCATTTTTTTCTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTTGTTAAAACTGGATGTTCATAGTT > 2:3486246/1‑135 TTTTTTTCTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAATTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAA < 2:2959710/135‑1 TTTTTTTCTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAATTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAA > 2:2931330/1‑135 TTTTTTTCTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAATTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAA > 2:839436/1‑135 TTTTTTTCTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAAC > 2:2131716/1‑135 TTTTTTCTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAATTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAAC < 1:3403841/135‑1 TTTTTTCTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAATTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAAC < 1:2491907/135‑1 TTTTTTCTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAATTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAAC > 2:1591714/1‑135 TTTTTCTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAATTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACA > 1:1090118/1‑135 TTTTTCTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAATTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACA > 2:1912604/1‑135 TTTTTCTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAA > 1:2012983/1‑135 TTTTCTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAA < 1:814072/135‑1 CTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTA > 2:1195821/1‑135 AATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTT < 2:453437/135‑1 AATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTT < 2:2012983/135‑1 AATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTT < 1:995065/135‑1 AATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTT < 1:2177059/135‑1 TGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAA < 2:516199/135‑1 AATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTT > 2:270078/1‑117 ATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAT < 1:1005602/135‑1 TTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATT < 1:1134827/135‑1 TTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATT < 1:1235967/135‑1 AATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAATTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAAC > 1:3825342/1‑98 AATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAATTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTT < 1:923575/94‑1 AATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAA > 1:1696423/1‑135 AATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAA > 2:1270135/1‑135 AATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTACCATAATGATAGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAAAATATTAAACTAATAAAATTAA > 2:1484525/1‑135 AATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TATTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGAAGTACATATTATGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAATAA > 1:2427276/1‑135 ATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAA > 1:3479953/1‑135 ATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTAATAAAATTAAA > 2:3862612/1‑135 GGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTT < 1:445257/135‑1 GGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTT > 1:499088/1‑135 GTTCCGCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTTATAAGATAA‑TTTATTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTA < 2:2427276/135‑1 TTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAA > 1:2931106/1‑135 TTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAA > 1:315101/1‑135 TCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAATATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAA < 1:3037069/134‑1 TCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAATATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAA < 1:2843255/134‑1 TCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAA < 2:218748/134‑1 TCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAA < 2:2474810/134‑1 TCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAA < 1:2231807/134‑1 TCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAA < 1:2700535/134‑1 TCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAA < 1:2729132/134‑1 CCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAAT < 2:2103919/135‑1 CCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAAT < 1:1621512/135‑1 CTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAT < 1:3343246/118‑1 CTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAT > 2:3343246/1‑118 CTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTA > 1:2638051/1‑96 AATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAA > 1:3901215/1‑127 gTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTA < 2:6945/134‑1 TTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTA < 1:2077042/135‑1 TTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTA < 2:28871/135‑1 TTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTA < 2:3934458/135‑1 CGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTA < 2:1381136/129‑1 CGTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATAATTTAAATGGGTCCTATGACA > 2:79146/1‑134 GTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGT < 2:3370911/135‑1 GTCGATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGT < 1:584058/135‑1 ATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAG > 1:3243576/1‑135 ATGAACAGTTAATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAG > 2:896085/1‑135 ATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCA > 2:1853534/1‑135 ATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGT > 1:863763/1‑120 ATAAGATAA‑TTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTA > 1:409046/1‑113 ATAAGAT‑ACTTTTGTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAAGTAATTTTAAAACATATTATACTACTAAAATTATATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCA > 2:2302415/1‑135 aTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCA > 2:1633816/2‑135 aTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCA > 1:1329677/2‑135 aTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATG < 1:750935/106‑1 aTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTA > 1:1180686/2‑105 aTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAT > 2:3143600/2‑83 TTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATT > 2:3668782/1‑135 TTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATT > 1:1048019/1‑135 TTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTT < 1:1749129/135‑1 ATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATA < 1:1821588/79‑1 TGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAA < 1:1518248/135‑1 TGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAA < 1:3634686/135‑1 GGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATG < 1:2969998/135‑1 TAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATA > 2:3626920/1‑46 AAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATA > 2:1123858/1‑135 ACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAGCTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAA < 1:2119169/135‑1 ACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAA < 2:2780365/135‑1 ACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAA < 2:3051105/135‑1 TGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAA > 2:2593536/1‑67 TGGATGTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAA < 1:2593536/67‑1 GTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGC > 1:1395477/1‑135 GTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGC > 2:3791691/1‑135 GTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAA > 1:1883444/1‑95 GTTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAT > 2:628610/1‑50 TTCATAGTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGT < 1:3543775/78‑1 TTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACT > 1:3194982/1‑135 TTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGA < 1:657007/76‑1 TGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTA > 1:2777200/1‑134 TGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAA < 2:2651143/106‑1 AACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTC > 2:104116/1‑135 AACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTC > 1:1942053/1‑135 AACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAA < 2:3222712/129‑1 AACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAA > 2:3559521/1‑116 AACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATG < 2:925767/109‑1 AACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAAT > 2:2811604/1‑52 AACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATT < 2:1663468/39‑1 ACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATG < 2:1767807/61‑1 ACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCT > 2:1948727/1‑58 CAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATT > 1:2316519/1‑132 TCTTCATTTTTTTCTACTAATTGATTAATTGCTTTAAATATATTAATCATTGGTTCCCCTAAATTTTCTCGTCGATGAACAGTTAATAAGATAATTTTTTTTCCATAATGATTGGTTAAAACTGGATGTTCATAGTTTGAACAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_27/7718‑7574‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTCGTTA > AssemblyC74_contig_37/11‑143 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |