| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_27 | 7574 = | 511 (0.950) | 515 (0.680) | 88/228 | 0.5 | 68.7% | coding (551/705 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) |
| ? | AssemblyC74_contig_37 | 11 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑425) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 1120 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTCGTTAAT > AssemblyC74_contig_37/1‑145 | aaacaatcaaccccactgtgctaaaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttccttgataccTTTGAACAaaattaa > 1:710844‑M2/121‑135 (MQ=255) taattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaattaaatt > 2:621043‑M2/128‑135 (MQ=255) aattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAAttt < 2:464647‑M2/9‑1 (MQ=255) aattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAAttt < 1:1724835‑M2/9‑1 (MQ=255) cccactgtgctaaaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACat > 2:3911867‑M2/110‑135 (MQ=255) gctaaaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAac > 1:1608816‑M2/102‑134 (MQ=255) taaaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAactac > 1:656560‑M2/100‑135 (MQ=255) atatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAActacta > 2:1950151‑M2/108‑135 (MQ=255) aaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAAttt < 1:357385‑M2/19‑1 (MQ=255) aaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAActacta > 2:2331007‑M2/98‑135 (MQ=255) aaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAActacta > 2:3454603‑M2/98‑135 (MQ=255) aaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAActacta > 1:2129630‑M2/98‑135 (MQ=255) aaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAActacta > 1:2078028‑M2/98‑135 (MQ=255) aaaactaaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAActacta > 2:1272582‑M2/98‑135 (MQ=255) ttaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAtt < 1:26229‑M2/33‑1 (MQ=255) ttaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAtt < 1:2458802‑M2/33‑1 (MQ=255) taaatcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAtt < 2:3298558‑M2/43‑1 (MQ=255) aatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAtt > 2:16630‑M2/101‑133 (MQ=255) aatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAtt < 1:16630‑M2/33‑1 (MQ=255) aatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTaa > 1:798548‑M2/101‑135 (MQ=255) aatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTaa > 1:2795746‑M2/101‑135 (MQ=255) atcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTaaa > 1:1535972‑M2/90‑135 (MQ=255) atcgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTaaa > 2:3542405‑M2/90‑135 (MQ=255) cgattcccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAacta > 2:2234929‑M2/88‑122 (MQ=255) ggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACttt > 1:499088‑M2/94‑135 (MQ=255) cccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTa > 1:2396164‑M2/83‑135 (MQ=255) ttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAtt < 1:1908555‑M2/33‑1 (MQ=255) ttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTATaa > 2:3770765‑M2/92‑135 (MQ=255) ccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 1:441583‑M2/54‑1 (MQ=255) ccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 1:3004520‑M2/54‑1 (MQ=255) ccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 1:2189232‑M2/54‑1 (MQ=255) ccctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 1:1757848‑M2/54‑1 (MQ=255) tcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 2:1871156‑M2/44‑1 (MQ=255) tcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 1:2328557‑M2/44‑1 (MQ=255) ctttttcctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAAt > 2:172972‑M2/80‑135 (MQ=255) cccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAAt < 2:2103919‑M2/46‑1 (MQ=255) cccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAAt < 2:1222331‑M2/46‑1 (MQ=255) ccactaaattttctcttcgatgaacatttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaacATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAAt < 2:1372436‑M2/46‑1 (MQ=255) ctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAt < 1:3343246‑M2/32‑1 (MQ=255) ctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAt > 2:3343246‑M2/87‑118 (MQ=255) taaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa > 1:394457‑M2/86‑129 (MQ=255) cctatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTcc > 2:3857832‑M2/74‑135 (MQ=255) ttttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTa < 1:1270135‑M2/54‑1 (MQ=255) ttttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTa < 2:840777‑M2/54‑1 (MQ=255) ttttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTa < 2:2183698‑M2/54‑1 (MQ=255) ttttctcctcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTa < 2:3377312‑M2/54‑1 (MQ=255) tatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTa < 2:2953274‑M2/64‑1 (MQ=255) tatatcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTa < 1:3374572‑M2/64‑1 (MQ=255) tttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTAt > 2:1802176‑M2/81‑135 (MQ=255) tcaagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGAc > 2:2041635‑M2/68‑135 (MQ=255) caagatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACa > 1:942918‑M2/67‑135 (MQ=255) cgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTa > 1:1381136‑M2/76‑129 (MQ=255) gtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGt < 1:2681807‑M2/61‑1 (MQ=255) agatatccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGt < 2:2396164‑M2/71‑1 (MQ=255) atgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTag > 1:3243576‑M2/71‑135 (MQ=255) tccattttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTaga < 2:3599118‑M2/76‑1 (MQ=255) attttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTa > 2:1132624‑M2/57‑120 (MQ=255) attttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGaa > 1:3762803‑M2/57‑135 (MQ=255) attttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGaa > 1:2861339‑M2/57‑135 (MQ=255) attttttgataatctaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTa < 2:1448109‑M2/53‑1 (MQ=255) tttttgataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAAtt < 2:2618390‑M2/81‑1 (MQ=255) taataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 2:658404‑M2/44‑1 (MQ=255) ataagataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCa < 2:315101‑M2/76‑1 (MQ=255) ataatttaaaattatcttccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCaa < 1:1462408‑M2/87‑1 (MQ=255) ataatttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATgc > 1:1154405‑M2/55‑134 (MQ=255) atttttttccataatgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTaga > 1:3508940‑M2/52‑117 (MQ=255) tccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa > 2:1003616‑M2/32‑85 (MQ=255) tccaaatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTaa < 1:1003616‑M2/54‑1 (MQ=255) tgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCaa < 1:1091715‑M2/98‑1 (MQ=255) tgattggttaaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCaa < 2:1061999‑M2/98‑1 (MQ=255) aatatattcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCaa < 1:2240853‑M2/108‑1 (MQ=255) attcaccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATg < 2:421237‑M2/113‑1 (MQ=255) taaaactggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATgg > 1:1851009‑M2/30‑77 (MQ=255) caccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGt > 2:3652701‑M2/20‑90 (MQ=255) caccaacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGt < 1:3652701‑M2/71‑1 (MQ=255) actggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATaaa < 1:3447046‑M2/110‑1 (MQ=255) actggatgttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATaaa < 2:3051105‑M2/110‑1 (MQ=255) aacttcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATaaa < 1:1315285‑M2/120‑1 (MQ=255) tcctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTaa > 2:762031‑M2/12‑135 (MQ=255) cctttataccTTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTaa > 1:3100724‑M2/11‑134 (MQ=255) gttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATTGGTCCTATGACAGTCTAGAGAAATACTCAATGCAGCATTATTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGc > 2:1611589‑M2/19‑135 (MQ=255) gttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATaaa < 1:122448‑M2/110‑1 (MQ=255) gttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATaaa < 2:922216‑M2/110‑1 (MQ=255) gttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGc > 2:3218397‑M2/19‑135 (MQ=255) ttcatagtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAAtt > 2:1526785‑M2/18‑50 (MQ=255) agtttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCaa < 1:868404‑M2/98‑1 (MQ=255) ttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTa > 1:3884921‑M2/10‑135 (MQ=255) ttgaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTa > 1:2948230‑M2/10‑135 (MQ=255) gaacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTAtt > 2:2916413‑M2/8‑135 (MQ=255) aacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAAt > 2:2811604‑M2/7‑52 (MQ=255) aacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTAtt < 1:1047586‑M2/128‑1 (MQ=255) aacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTc > 2:2455843‑M2/7‑135 (MQ=255) aacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTc > 1:2741982‑M2/7‑135 (MQ=255) aacaaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATATTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTc > 2:2669922‑M2/7‑135 (MQ=255) aaaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTCGtt > 1:2516854‑M2/4‑135 (MQ=255) aaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTCGTTa < 2:2741982‑M2/133‑1 (MQ=255) aaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTCGTTa < 1:3192203‑M2/133‑1 (MQ=255) aaATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTCGTTa < 1:198013‑M2/133‑1 (MQ=255) attaaattTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTCGTTAAt < 2:2516854/135‑1 (MQ=255) attaaattTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTCGTTAAt < 1:598712/135‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTGAACAAAATTAAATTTAAAACATATTAAACTACTAAAATTAAATACTTTAAATGGGTCCTATGACAGTCTAGAGAATTACTCAATGCAGCATTTTTTCATTGCAAAAATGCTATAAAGTAATGCCATAAACTATTCGTTAAT > AssemblyC74_contig_37/1‑145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |