| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_31 | = 3396 | 0 (0.000) | 962 (0.550) | 133/248 | 0.1 | 100% | noncoding (118/118 nt) | rasttk_feature_creation_tool=RNA_reps_5S_rRNA | 5S rRNA # 5S ribosomal RNA ‑ 3 prime truncation |
| ? | AssemblyC74_contig_54 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑13) | –/rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE | –/tRNA‑Val‑TAC | |||||
Only 100 of 962 total aligned reads displayed.
TAAAAGATAACACCACAGTGTGGTGGCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_31/3263‑3396‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAG > AssemblyC74_contig_54/1‑131 ACACCACAGTGTGGTGGCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATC < 2:2580903/135‑1 CACCACAGTGTGGTGGCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCC < 1:2719001/135‑1 ACCACAGTGTGGTGGCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCA < 2:593669/135‑1 CACAGTGTGGTGGCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATG > 1:546325/1‑135 CAGTGTGGTGGCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGA > 1:2378613/1‑135 TGTGGTGGCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCAAGGAGGT > 2:1609762/1‑135 TGGTGGCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTT < 2:417763/135‑1 GGTGGCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAG > 1:2768753/1‑130 GGTGGCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCC < 2:3166938/124‑1 GTGGCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTA < 1:895316/134‑1 TGGCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAG > 1:2014715/1‑134 GCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTC > 2:1035879/1‑135 GCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCT < 1:3167855/134‑1 CGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTC > 2:1884495/1‑134 CGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAG < 2:890388/131‑1 AGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTG < 1:3502104/135‑1 AGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTG < 1:2800785/135‑1 GCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGG > 2:1194231/1‑135 GCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGG > 1:2297900/1‑135 GCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGG > 2:3446836/1‑135 GCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGG > 1:1938825/1‑135 GAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGA > 1:1000072/1‑135 GAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGA > 1:813133/1‑135 GAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGA > 1:2256892/1‑135 GGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAG < 2:1776090/133‑1 GGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAG < 2:3344321/133‑1 GATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGC > 2:3521844/1‑133 ACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCGTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTGAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCT > 2:3055651/1‑134 CCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGC > 1:2644514/1‑135 CCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGC > 1:1217622/1‑135 CCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGC > 2:2276672/1‑135 CCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAG < 1:3088527/134‑1 CCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAA < 2:3253012/133‑1 CCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAA > 2:1299245/1‑133 CCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTA < 1:1753002/104‑1 CCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGAGTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGC > 1:2964637/1‑135 GAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGTCGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGT > 1:3559582/1‑135 GAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGT > 1:3398529/1‑135 GAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGT > 2:3688192/1‑135 GAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGT > 2:2818007/1‑135 GAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGT > 2:2129573/1‑135 GAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGT < 2:1544232/135‑1 GAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGT > 2:1157165/1‑135 GAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGT > 1:1413131/1‑135 GAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGT < 1:1616255/135‑1 GAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGG < 2:566245/134‑1 GAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAG < 1:1535949/130‑1 GAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCA < 1:1702915/102‑1 GAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTA > 2:2073039/1‑97 GAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAA < 1:61335/79‑1 ACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGC < 2:362132/135‑1 GTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTT < 2:1093944/133‑1 GTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTT < 2:1955492/133‑1 TTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTA < 1:210847/86‑1 AGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCC > 1:1262979/1‑135 GCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCC < 1:3661218/135‑1 CTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCG > 1:2423417/1‑135 TTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGT > 2:1223567/1‑135 TCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTT < 1:3936665/135‑1 TAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAAC < 2:2011289/135‑1 TAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTA < 2:222358/133‑1 GTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGA > 1:1129296/1‑134 GTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCC > 1:3729091/1‑118 AGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTT < 1:2171551/134‑1 GGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAG > 1:3107798/1‑134 GGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCT > 2:3914425/1‑135 GTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGC < 1:3309326/133‑1 TTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTC > 2:276728/1‑58 CCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTT > 2:1365090/1‑135 CCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTT > 1:450852/1‑135 CCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTT > 1:701312/1‑135 CCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTT > 1:1040208/1‑135 CCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTA < 1:3040380/108‑1 CTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGT > 2:504263/1‑135 GAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGC > 2:2639944/1‑135 GAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGC > 2:702384/1‑135 GAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGC > 2:2940267/1‑135 GAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGC > 1:3817142/1‑135 GAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTT < 2:739839/118‑1 GAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTT > 1:739839/1‑118 GAGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAG < 1:3472128/73‑1 AGAGTAGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCA < 1:985245/135‑1 AGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCATTTGGTATAGCATCT > 1:2598425/1‑133 AGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCT > 2:3100358/1‑133 AGGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCT > 1:187205/1‑133 GGACGTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGA < 1:1482023/134‑1 GTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTT > 2:2353934/1‑135 GTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTT > 2:2457798/1‑135 GTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTT < 1:2535561/135‑1 GTCGCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTT < 2:3479461/88‑1 GCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAAT < 2:3309215/135‑1 GCCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAAT < 1:1166907/135‑1 CCACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATC < 1:1310412/135‑1 CACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCA > 1:359652/1‑135 CACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCA > 1:3255600/1‑135 CACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCA > 2:3753451/1‑135 CACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCA > 2:3807590/1‑135 CACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCG > 2:1706126/1‑75 ACGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCA < 2:1488424/134‑1 CGCTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAAT < 2:2712359/131‑1 TAAAAGATAACACCACAGTGTGGTGGCGATAGCGAGAAGGATACACCTGTAACCATGCCGAACACAGAAGTTAAGCTTCTTAGCGCCGATTGTAGTGAGGGGTTGCCCCTTGTGAGAGTAGGACGTCGCCACGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_31/3263‑3396‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAG > AssemblyC74_contig_54/1‑131 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |