New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_31 | = 3396 | 0 (0.000) | 962 (0.550) | 133/248 | 0.1 | 100% | noncoding (118/118 nt) | rasttk_feature_creation_tool=RNA_reps_5S_rRNA | 5S rRNA # 5S ribosomal RNA ‑ 3 prime truncation |
? | AssemblyC74_contig_54 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑13) | –/rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE | –/tRNA‑Val‑TAC |
Only 100 of 964 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG > AssemblyC74_contig_54/1‑134 | aagataacaccacagtgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTaa < 1:2170968‑M2/4‑1 (MQ=255) acaccacagtgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATc < 2:2580901‑M2/10‑1 (MQ=255) caccacagtgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATcc < 1:2719001‑M2/11‑1 (MQ=255) caccacagtgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATcc < 2:1035521‑M2/11‑1 (MQ=255) accacagtgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCa < 2:593669‑M2/12‑1 (MQ=255) accacagtgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgacacgcTTAAGTTATCCa < 2:1948297‑M2/12‑1 (MQ=255) cacagtgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATg > 1:546325‑M2/122‑135 (MQ=255) acagtgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATgg < 1:1704031‑M2/15‑1 (MQ=255) tgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCAAGGAGGt > 2:1609762‑M2/117‑135 (MQ=255) tggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGttt < 2:417763‑M2/21‑1 (MQ=255) tggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGttt < 2:1155952‑M2/21‑1 (MQ=255) ggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCt > 1:3309215‑M2/111‑135 (MQ=255) gcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCt < 1:3167855‑M2/25‑1 (MQ=255) gcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCt < 2:119367‑M2/25‑1 (MQ=255) cgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAg < 2:890388‑M2/23‑1 (MQ=255) cgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTc > 2:2062396‑M2/109‑134 (MQ=255) cgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTc > 1:978910‑M2/109‑134 (MQ=255) atagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTc > 2:2939954‑M2/107‑132 (MQ=255) atagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTc > 2:3164104‑M2/107‑132 (MQ=255) agcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTg < 1:3502104‑M2/31‑1 (MQ=255) agcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTg < 1:2800785‑M2/31‑1 (MQ=255) gcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTgg > 2:3446836‑M2/104‑135 (MQ=255) gcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTgg > 1:2011289‑M2/104‑135 (MQ=255) gcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTgg > 1:1938825‑M2/104‑135 (MQ=255) gcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTgg > 1:2297900‑M2/104‑135 (MQ=255) gagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGga > 1:1000072‑M2/102‑135 (MQ=255) gaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATcc > 2:233185‑M2/100‑110 (MQ=255) ggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGagag < 1:2250261‑M2/37‑1 (MQ=255) ggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCa < 1:2593637‑M2/39‑1 (MQ=255) gatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGc > 2:3521844‑M2/96‑133 (MQ=255) acacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTg < 1:3808173‑M2/43‑1 (MQ=255) acacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccgtgtgagagtaggacgtcgccacgcTGAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCt > 2:3055651‑M2/93‑134 (MQ=255) taaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattggagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACa < 2:1088417‑M2/50‑1 (MQ=255) ccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTa < 1:1753002‑M2/22‑1 (MQ=255) ccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACaa < 2:3253012‑M2/51‑1 (MQ=255) ccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAg < 1:3088527‑M2/52‑1 (MQ=255) ccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGc > 2:1482023‑M2/83‑135 (MQ=255) ccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGc > 1:2644514‑M2/83‑135 (MQ=255) ccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGc > 1:1217622‑M2/83‑135 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggtcgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGt > 1:3559582‑M2/76‑135 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTaa < 1:61335‑M2/4‑1 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCa > 2:1702915‑M2/76‑102 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTg < 2:3886947‑M2/31‑1 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATc < 1:2963286‑M2/41‑1 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCag < 1:1535949‑M2/55‑1 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCag > 2:1535949‑M2/76‑130 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAggg < 2:566245‑M2/59‑1 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGt > 2:2276634‑M2/76‑135 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGt > 2:2818007‑M2/76‑135 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGt > 1:3398529‑M2/76‑135 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGt > 1:1413131‑M2/76‑135 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGt < 1:1616255‑M2/60‑1 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGt < 1:2418074‑M2/60‑1 (MQ=255) acagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGc < 2:362132‑M2/64‑1 (MQ=255) ttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTa < 1:210847‑M2/22‑1 (MQ=255) agcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATcc > 1:1262979‑M2/62‑135 (MQ=255) gcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATccc < 1:3661218‑M2/75‑1 (MQ=255) gcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATccc < 2:1879106‑M2/75‑1 (MQ=255) tcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGtt < 1:3936665‑M2/78‑1 (MQ=255) tagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTa < 2:222358‑M2/79‑1 (MQ=255) tagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAAc < 2:2011289‑M2/81‑1 (MQ=255) gtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATccc > 1:3729091‑M2/44‑118 (MQ=255) gtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGa > 2:1221934‑M2/44‑134 (MQ=255) gtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGa > 1:1129296‑M2/44‑134 (MQ=255) gggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGAACCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAg > 1:3107648‑M2/36‑134 (MQ=255) ggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCa < 2:3681752‑M2/86‑1 (MQ=255) ttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTc < 1:276728‑M2/26‑1 (MQ=255) ttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTc > 2:276491‑M2/33‑58 (MQ=255) ccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTa < 1:3040380‑M2/79‑1 (MQ=255) ccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGtt > 1:1040208‑M2/30‑135 (MQ=255) ccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGtt > 2:1365090‑M2/30‑135 (MQ=255) ccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGtt > 1:450852‑M2/30‑135 (MQ=255) ccccttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGtt > 1:701312‑M2/30‑135 (MQ=255) cttgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGt > 2:504263‑M2/27‑135 (MQ=255) tgtgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTag > 1:1488424‑M2/25‑135 (MQ=255) tgagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTGGCTCAGTTGGTagag > 1:2376373‑M2/23‑135 (MQ=255) gagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCa > 2:2128659‑M2/22‑60 (MQ=255) gagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAg < 1:3472128‑M2/52‑1 (MQ=255) gagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGtt > 1:739839‑M2/22‑118 (MQ=255) gagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGtt < 2:739839‑M2/97‑1 (MQ=255) gagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc > 1:893160‑M2/22‑135 (MQ=255) gagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc > 2:2639944‑M2/22‑135 (MQ=255) gagagtaggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc > 2:702384‑M2/22‑135 (MQ=255) aggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCt > 1:187205‑M2/16‑133 (MQ=255) aggacgtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCt > 2:3100358‑M2/16‑133 (MQ=255) gtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGtt < 2:3479461‑M2/78‑1 (MQ=255) gtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACtttt > 2:3343830‑M2/11‑135 (MQ=255) gtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACtttt < 1:2535561‑M2/125‑1 (MQ=255) gtcgccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACtttt > 2:2457798‑M2/11‑135 (MQ=255) gccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAAt < 2:3309215‑M2/128‑1 (MQ=255) gccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAAt < 1:1166907‑M2/128‑1 (MQ=255) ccacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATc < 1:1310412‑M2/129‑1 (MQ=255) cacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCa > 1:3590751‑M2/6‑135 (MQ=255) cacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCa > 2:3807590‑M2/6‑135 (MQ=255) cacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCa > 2:3753451‑M2/6‑135 (MQ=255) cacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCa > 1:3255600‑M2/6‑135 (MQ=255) cacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCa > 2:1286285‑M2/6‑135 (MQ=255) cacgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCa > 2:1767865‑M2/6‑135 (MQ=255) cgcTTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAAt < 2:2712359‑M2/128‑1 (MQ=255) ttAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGATCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAgg > 1:809106/1‑134 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAGTTATCCATGGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATATGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG > AssemblyC74_contig_54/1‑134 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |