| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_32 | 1 = | 0 (0.000) | 306 (0.740) +C |
62/246 | 1.2 | 100% | intergenic (–/+1197) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/Programmed cell death toxin MazF |
| ? | AssemblyC74_contig_40 | = 62 | NA (NA) | intergenic (–/+119) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Cold shock protein of CSP family | |||||
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
GTGCATATTTTATGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_32/134‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAACTTCTAA‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_40/62‑1 | GTGCATATTTTATGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATC > 2:2432079/1‑135GTGCATATTTTATGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATC > 1:2546947/1‑135GTGCATATTTTATGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATC > 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ATTTTATGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTAT > 1:1204607/1‑135 TTTTATGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATT < 1:3145779/135‑1 TTTTATGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATT < 1:701814/135‑1 TATGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGTAATGAAGTATAAATGGTAATGAAGAAAATTTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGT > 2:2657149/1‑135 TATGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGT > 1:3006347/1‑135 TATGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGT > 1:2309653/1‑135 TATGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGT > 1:1294529/1‑135 TATGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGT > 1:2600207/1‑135 TATGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATT > 2:3666425/1‑132 TGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTGATCTATTATTTGTCA > 2:275031/1‑135 GTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAA > 1:2047383/1‑135 TAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAA > 2:163225/1‑135 TAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAA > 2:1822674/1‑135 TAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAA > 1:3870041/1‑135 TAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAA > 2:3593399/1‑135 TAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAA > 1:1613273/1‑135 TAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAA > 1:1462720/1‑135 TAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAA > 2:868855/1‑135 TAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGCAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAA > 2:3087780/1‑135 TAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTAAGCTCATTATTAGGAATGAAGTCTCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGATTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAA > 2:3448519/1‑135 AAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTAAAAg > 2:817100/1‑134 AAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT < 2:485051/135‑1 AAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT < 2:1084518/135‑1 AAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT < 1:753350/135‑1 AAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT < 1:1135890/135‑1 AAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT < 1:3593399/135‑1 AAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT < 1:2432079/135‑1 AAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT < 1:3489220/135‑1 AAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT < 1:1240564/135‑1 GCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAG > 1:818583/1‑135 CTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAATTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTTTAAAATTATGC > 2:1227252/1‑135 ATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGA < 2:3919880/135‑1 TAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGAC > 1:1638684/1‑135 CTACAAAGTATAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAATAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAA < 1:2857550/135‑1 AGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT > 1:906016/1‑117 AGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAATATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAATCTAGACAAAACTGTCCATTTACG > 2:3124837/1‑135 AGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACG > 1:2217709/1‑135 AGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACG > 2:2867576/1‑135 AGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACG > 1:481045/1‑135 ATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACT > 1:2511878/1‑135 ATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAAATATTTTAATCTATTATTTGTAAAATTAAGAGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACT > 1:3087221/1‑135 GCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTCAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCA > 2:3235358/1‑135 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CTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAA < 1:3817977/135‑1 TCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAATCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAA > 1:1878405/1‑135 TCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT < 2:2805786/100‑1 CATTATTAGGAATTAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAA < 2:1394219/134‑1 CATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAA < 2:3256069/134‑1 CATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAA < 2:3034918/134‑1 CATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAA < 2:745225/134‑1 ATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACTTAACTCAAAAA > 2:1846964/1‑135 ATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAA > 1:92202/1‑135 ATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAA < 1:3222697/135‑1 ATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAA < 2:2391836/135‑1 ATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAAC > 2:2202763/1‑135 ATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAAC > 1:1024830/1‑135 ATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAAC > 2:3527849/1‑135 ATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAA < 1:3672152/132‑1 ATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT > 1:2975771/1‑95 ATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT < 1:439716/95‑1 ATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT > 1:3454910/1‑95 ATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT < 2:2975771/95‑1 TTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAA < 2:3732161/129‑1 TAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAACTT < 1:3732977/135‑1 AGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAACTTC < 2:1024830/135‑1 GAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAA < 1:2338337/125‑1 GAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAA > 2:2338337/1‑125 AATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAACTTCTAA > 2:1980873/1‑135 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GTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAACTTCTAAtggtgt > 2:3815667/1‑129 GTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAA < 2:3760562/118‑1 TGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT < 2:597542/76‑1 TGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATT > 1:597542/1‑76 TCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAA < 2:3181780/85‑1 GAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAACTTCTAAtggt > 2:3403041/1‑115 GAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAA < 2:680062/104‑1 GAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAA > 2:2581941/1‑104 GAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAA > 1:680062/1‑104 AAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAACTTC > 1:2126017/1‑108 GTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAACTTCTAAtggt > 2:913162/1‑106 GTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAATCTATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAACTTC < 2:2942571/103‑1 | GTGCATATTTTATGTAAAAGCTTTATAACTACAAAGTAAAGTAGATTATGCTCATTATTAGGAATGAAGTATCAATGGTTCTGAAGAAAATGTTTAAAGAAGTTTTTATTGATTAAAATAATAATTATTTTAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_32/134‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAACTTCTAA‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_40/62‑1 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |