| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_32 | 1 = | 0 (0.000) | 306 (0.740) +C |
62/246 | 1.2 | 100% | intergenic (–/+1197) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/Programmed cell death toxin MazF |
| ? | AssemblyC74_contig_40 | = 62 | NA (NA) | intergenic (–/+119) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Cold shock protein of CSP family | |||||
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATAAAATATGCAC > AssemblyC74_contig_32/1‑134 | acaccattagaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATAc > 2:3815667‑M1/70‑135 (MQ=255) accattagaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAAc > 2:913162‑M1/68‑110 (MQ=255) accattagaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTttcttc > 2:3403041‑M1/68‑119 (MQ=255) accattagaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACtt > 1:3368516‑M1/68‑135 (MQ=255) accattagaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACtt > 2:1587375‑M1/68‑135 (MQ=255) cattagaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCa < 1:3573535‑M1/70‑1 (MQ=255) ttagaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCAtt > 2:1980873‑M1/64‑135 (MQ=255) tagaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATAAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCAt < 1:275031‑M1/71‑1 (MQ=255) gaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAAc < 2:2942571‑M1/43‑1 (MQ=255) gaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACAtttt > 1:2126017‑M1/61‑108 (MQ=255) gaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACtt < 2:2537451‑M1/68‑1 (MQ=255) gaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCt < 2:1024830‑M1/75‑1 (MQ=255) aagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCta < 1:3732977‑M1/76‑1 (MQ=255) gtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCtaat > 1:1024830‑M1/58‑135 (MQ=255) gtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCtaat > 2:3527849‑M1/58‑135 (MQ=255) gtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCtaat > 2:2202763‑M1/58‑135 (MQ=255) tttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACtt < 2:2996748‑M1/68‑1 (MQ=255) tttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCtaat < 1:3672152‑M1/78‑1 (MQ=255) tttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTaataat > 1:92202‑M1/55‑135 (MQ=255) tttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTaataat < 2:2391836‑M1/81‑1 (MQ=255) tttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTaataat < 1:3222697‑M1/81‑1 (MQ=255) tttttgagttaagtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTaataat > 2:1846964‑M1/55‑135 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTttcttc > 2:2581941‑M1/53‑104 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTttcttc > 1:680062‑M1/53‑104 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTttcttc < 2:680062‑M1/52‑1 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATAc < 2:3760562‑M1/66‑1 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTc > 2:2338337‑M1/53‑125 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTc < 1:2338337‑M1/73‑1 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCtaa < 2:3732161‑M1/77‑1 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATg < 2:745225‑M1/82‑1 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATg < 2:3256069‑M1/82‑1 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATg < 2:3034918‑M1/82‑1 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTAATTCCTAATAATg < 2:1394219‑M1/82‑1 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgattaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGa > 1:1878405‑M1/53‑135 (MQ=255) ttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAg < 1:3817977‑M1/84‑1 (MQ=255) tgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGc > 2:2489687‑M1/51‑135 (MQ=255) tgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGc < 2:3876867‑M1/85‑1 (MQ=255) tgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTGAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGc > 2:3235358‑M1/51‑135 (MQ=255) tgagttacgtaaatggaaagtattgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGc > 2:1729554‑M1/51‑135 (MQ=255) agttacgtaaatggaaagttttgtctctcttaattttacaaataatagATTAAAATATTTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCAt > 1:3087221‑M1/49‑135 (MQ=255) agttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCAt > 1:2511878‑M1/49‑135 (MQ=255) cgtaaatggacagttttgtctagattaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATATTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCt > 2:3124837‑M1/44‑135 (MQ=255) cgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCt > 1:2217709‑M1/44‑135 (MQ=255) cgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCt > 2:2867576‑M1/44‑135 (MQ=255) cgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCt > 1:481045‑M1/44‑135 (MQ=255) aaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGc < 1:2799136‑M1/85‑1 (MQ=255) aaacggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGc < 1:2806723‑M1/85‑1 (MQ=255) ttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGa < 2:3181780‑M1/55‑1 (MQ=255) tttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTATTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTATACTTTGTAg < 1:2857550‑M1/106‑1 (MQ=255) gtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTta > 1:1638684‑M1/27‑135 (MQ=255) tctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTtat < 2:3919880‑M1/110‑1 (MQ=255) gcataattttaaaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAAATTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAg > 2:1227252‑M1/22‑135 (MQ=255) cttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGc > 1:818583‑M1/21‑135 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCa > 1:597542‑M1/18‑76 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCa < 2:597542‑M1/59‑1 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCtaat > 1:2975771‑M1/18‑95 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCtaat < 1:439716‑M1/78‑1 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCtaat < 2:2975771‑M1/78‑1 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCtaat > 1:3454910‑M1/18‑95 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGa < 2:2805786‑M1/83‑1 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGc < 2:3331453‑M1/85‑1 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCtactttact > 1:906016‑M1/18‑117 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCttt < 2:485051‑M1/118‑1 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCttt < 2:1084518‑M1/118‑1 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCttt < 1:1135890‑M1/118‑1 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCttt < 1:2432079‑M1/118‑1 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCttt < 1:3489220‑M1/118‑1 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCttt < 1:3593399‑M1/118‑1 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCttt < 1:753350‑M1/118‑1 (MQ=255) aatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCttt < 1:1240564‑M1/118‑1 (MQ=255) cttttacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCtttt > 2:817100‑M1/17‑135 (MQ=255) tttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAATCTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGAGACTTCATTCCTAATAATGAGCTTAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTa > 2:3448519‑M1/16‑135 (MQ=255) tttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTGCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTa > 2:3087780‑M1/16‑135 (MQ=255) tttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTa > 1:1462720‑M1/16‑135 (MQ=255) tttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTa > 1:3870041‑M1/16‑135 (MQ=255) tttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTa > 2:163225‑M1/16‑135 (MQ=255) tttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTa > 2:1822674‑M1/16‑135 (MQ=255) tttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTa > 1:1613273‑M1/16‑135 (MQ=255) tttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTa > 2:3593399‑M1/16‑135 (MQ=255) tttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTa > 2:868855‑M1/16‑135 (MQ=255) ttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTAc > 1:2047383‑M1/15‑135 (MQ=255) tgacaaataatagATCAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACa > 2:275031‑M1/14‑135 (MQ=255) acaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATa > 1:1294529‑M1/12‑135 (MQ=255) acaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATa > 1:2309653‑M1/12‑135 (MQ=255) acaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATa > 1:2600207‑M1/12‑135 (MQ=255) acaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATa > 1:3006347‑M1/12‑135 (MQ=255) acaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAAAATTTTCTTCATTACCATTTATACTTCATTACTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATa > 2:2657149‑M1/12‑135 (MQ=255) aataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATaaaa < 1:3145779‑M1/127‑1 (MQ=255) aataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATaaaa < 1:701814‑M1/127‑1 (MQ=255) aataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATa > 2:3666425‑M1/9‑132 (MQ=255) ataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATAAAat > 2:2290383‑M1/8‑135 (MQ=255) ataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATAAAat > 1:536760‑M1/8‑135 (MQ=255) ataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATAAAat > 1:1204607‑M1/8‑135 (MQ=255) ataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATAAAat > 2:2063990‑M1/8‑135 (MQ=255) aatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATAAAatat > 2:1261948‑M1/6‑135 (MQ=255) agATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATAAAATATGca < 1:1751259‑M1/133‑1 (MQ=255) gATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATAAAATATGcac > 1:2546947‑M1/2‑135 (MQ=255) gATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATAAAATATGcac > 1:19758‑M1/2‑135 (MQ=255) gATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATAAAATATGcac > 1:3319858‑M1/2‑135 (MQ=255) gATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATAAAATATGcac > 2:2432079‑M1/2‑135 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATAAAATATGCAC > AssemblyC74_contig_32/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |