| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_33 | 1 = | 0 (0.000) | 265 (0.530) | 86/248 | 0.5 | 100% | coding (1/972 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_8 | = 115683 | 0 (0.000) | coding (1791/1791 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Phage capsid and scaffold | |||||
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
AAAGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_33/134‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCTAATAAAAC < AssemblyC74_contig_8/115683‑115552 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCC < 1:1888471/135‑1 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 1:1135307/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 2:263136/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 1:3589242/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 2:3597239/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 1:2175357/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 1:2112568/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 1:3932249/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 2:3778031/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 1:53249/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 1:708641/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 2:939919/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 2:1512275/1‑134 GTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCA < 2:1839257/135‑1 GTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCA < 2:3478760/135‑1 GTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCA < 1:3720607/135‑1 TCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGT < 2:79493/135‑1 TCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC < 2:1761356/128‑1 TTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATT < 1:80743/135‑1 TTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATT < 2:3467679/135‑1 TCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCT < 2:2226050/135‑1 TCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCT < 1:3136422/135‑1 CTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTC < 1:430427/135‑1 TTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCC < 1:990470/135‑1 TTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCC < 2:864704/135‑1 TTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTC > 2:1233392/1‑134 TTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACC < 2:2794907/135‑1 TGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTC < 2:3587777/130‑1 AATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCC < 2:689636/135‑1 AATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCC < 1:662948/135‑1 TGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTG < 2:2727117/135‑1 TGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTG < 2:3250496/135‑1 TGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCT < 1:2867670/134‑1 TGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCT < 2:3669417/134‑1 CCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGG < 2:506883/135‑1 CCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATG < 1:3770997/134‑1 CCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGA < 2:2433630/135‑1 CCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTAGTTAATACGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGGTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGt < 2:3029948/135‑2 AATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACC > 1:1048436/1‑134 TATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACC < 2:133935/135‑1 TATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACC < 1:1745974/135‑1 ACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTT > 1:16989/1‑134 CATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGT < 1:1490298/135‑1 ATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTC > 2:95904/1‑135 ATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTC > 1:3402763/1‑135 ATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTC > 1:82683/1‑135 ATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACC < 1:3249161/97‑1 GATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGA > 1:1303983/1‑135 GATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGA > 1:2458484/1‑135 GATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGA > 1:2634534/1‑117 GATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCC > 1:2837715/1‑110 TTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCT < 2:82657/100‑1 TCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATT < 2:908186/134‑1 TCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATT < 2:2191420/134‑1 TCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATT < 2:2325217/134‑1 TAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTT > 1:305417/1‑135 TAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTT > 1:611954/1‑135 TAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTT > 1:2503895/1‑135 TAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGG < 1:2414945/124‑1 TAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGG > 2:2414945/1‑124 TCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCC > 1:2931691/1‑135 CCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCT < 1:1477824/135‑1 TTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGA < 2:142953/99‑1 AAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGT < 2:2849785/135‑1 AATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTT < 2:2458484/135‑1 AATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTT < 2:2491080/135‑1 AATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTT < 2:3907503/135‑1 AATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTT < 1:1530869/135‑1 ATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTT > 1:568687/1‑134 TATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTC < 2:3363851/135‑1 ATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCGGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCC > 2:631253/1‑135 ATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCC < 2:16989/135‑1 ATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTC < 1:1807633/111‑1 ATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTC > 2:1807633/1‑111 TCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCT < 2:1303983/135‑1 TCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCT < 2:252506/135‑1 TCGTAAATTCTACAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAAGTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCT < 2:2080268/135‑1 AAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCC > 2:733283/1‑73 TTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTAC > 2:407116/1‑133 GCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTC > 2:2457375/1‑134 CTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAA < 2:2931691/135‑1 GCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTG > 2:1529036/1‑52 ATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGC > 1:387060/1‑135 TCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCT > 2:3233376/1‑135 TTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTAC > 2:3708599/1‑135 TTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCAT < 2:1609144/135‑1 AATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTT < 2:440119/75‑1 TCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCT < 2:1486805/135‑1 TCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCT < 1:1425233/135‑1 TCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCT < 2:601517/135‑1 TCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCT < 1:1668878/135‑1 TCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCT < 1:852876/135‑1 TCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCT < 1:1406346/135‑1 ACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCTAA > 2:3826423/1‑135 ACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCTAA < 1:3496854/135‑1 AGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCTAATAA > 1:940976/1‑135 AGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCTAATAA > 2:1921276/1‑135 AGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCTAATAA > 2:3151766/1‑135 AGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAA < 2:182629/108‑1 AGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAA > 1:182629/1‑108 AAAGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_33/134‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCTAATAAAAC < AssemblyC74_contig_8/115683‑115552 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |