| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_34 | 2046 = | 132 (0.420) | 285 (0.710) +T |
57/246 | 1.3 | 81.3% | intergenic (‑223/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | PaaD‑like protein (DUF59) involved in Fe‑S cluster assembly/– |
| ? | AssemblyC74_contig_35 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/Co‑activator of prophage gene expression IbrA | |||||
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_34/2107‑2046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTCATA > AssemblyC74_contig_35/1‑134 | tcctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTA < 2:3888221/131‑1tcctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTA < 1:2800660/131‑1tcctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTA < 1:1584820/131‑1tcctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTA < 1:194948/131‑1 cctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAG > 2:72616/4‑135 ctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGA > 1:3906682/3‑135 ctGGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCA < 1:2663670/101‑1 ATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAA < 2:3062868/134‑1 TTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATAT < 1:2871797/135‑1 TAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAA < 1:1266332/123‑1 GTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTTATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCG < 1:13379/135‑1 GTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCG < 1:2474726/135‑1 GTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCG < 2:466549/135‑1 GTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCG < 2:133725/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTT > 1:3054355/1‑135 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTT < 1:1096216/134‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTT < 1:1429691/134‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAA < 1:3252632/118‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCA < 1:1029854/135‑1 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 1:476138/135‑1 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 2:1083894/135‑1 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 2:1620957/135‑1 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 2:2124950/135‑1 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 2:3679043/135‑1 CACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC < 1:72616/135‑1 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCACCTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATAAACTCTAATCGTTTCAACG > 1:66570/1‑135 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACG > 1:2010112/1‑135 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACG < 1:120076/135‑1 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTT < 2:3109322/129‑1 CCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAAGT > 2:1161994/1‑135 TTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAA < 1:1652065/110‑1 TAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA < 2:275875/135‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCATTAAAACACCTGAGACTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAATAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:1879991/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCCAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTCGA > 1:3450973/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCATCGTAGA > 1:2065931/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:198184/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:984367/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:1557956/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:783793/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA < 2:1406438/134‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:1449531/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:2792210/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:2032753/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:3081786/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:829275/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:2820025/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:2208582/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:2941258/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:524590/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:414732/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:2151836/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:3289074/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 1:1475004/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:3274776/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTA < 2:2877091/132‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGT < 2:222739/131‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGT > 1:222739/1‑131 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC > 1:317665/1‑129 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC > 1:3675947/1‑129 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAA < 2:2077639/108‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAA < 1:2315204/107‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAA > 2:2315204/1‑107 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTA < 2:1670363/102‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTA < 1:218041/102‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACT < 1:559469/87‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAA < 1:2742512/77‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAA > 1:1306492/1‑77 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAA < 2:131515/77‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTACTCCAGAAAAAGCAACAACTATATGGTCAAACTAAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGAAGA > 1:3205671/1‑134 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCA > 2:906993/1‑46 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCA < 1:906993/46‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAAT > 2:2906681/1‑42 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACT > 1:3425537/1‑39 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCATATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGA > 2:2579699/1‑134 AATTTGTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTA > 1:1256451/1‑49 AATTTGTCTGTATAGTTAATGGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTTATTATTTTCCTCCAGAAAAAGAAACTACTATATGGGAAAACTTAGAAAAAATATACTATAATCTTTTCAAAGAAGA > 2:2709964/1‑134 AATTTCTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTA < 2:1256451/49‑1 TCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTT < 2:3180538/114‑1 TCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAG < 2:3797220/69‑1 TCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAG > 1:3797220/1‑69 TCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAG > 1:2578336/1‑37 TAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATT < 2:1834027/134‑1 TAGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATT < 2:3920331/134‑1 AGTTAATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCGATAGAGTTT > 2:1767965/1‑135 ATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCT < 2:645459/135‑1 ATTGTAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTAAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCT < 2:3421782/135‑1 TTGTAGCCTATCAATAGATTAATTCCTGTTAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAATAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATAGTTTTTCATCTG < 2:3602042/135‑1 TAGCCTATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAA < 1:3495163/135‑1 TATCCATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTT > 1:3361831/1‑135 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTCAT > 2:2485150/1‑135 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTCAT > 2:3492262/1‑135 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTCAT > 2:2172110/1‑135 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTCAT > 1:1790268/1‑135 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTCAT > 1:440625/1‑135 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTCAT > 2:2029443/1‑135 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTCAT < 2:2004821/135‑1 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAAC > 2:3445933/1‑97 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTT > 1:2989788/1‑92 ATAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTT < 2:2989788/92‑1 TAGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTCATA < 1:1715868/135‑1 | ‑‑‑‑GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_34/2107‑2046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGACTAATTCCAGTAAAACACCTGAGTCTTTTCCTCCAGAAAAAGCAACTACTATATGGTCAAACTTAGAAAAAATATACTCTAATCGTTTCAACGTAGAATCCTATACATTTTCATCTGAAATCCTTTTCATA > AssemblyC74_contig_35/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |