| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_34 | 2046 = | 132 (0.420) | 285 (0.710) +T |
57/246 | 1.3 | 81.3% | intergenic (‑223/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | PaaD‑like protein (DUF59) involved in Fe‑S cluster assembly/– |
| ? | AssemblyC74_contig_35 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/Co‑activator of prophage gene expression IbrA | |||||
Only 100 of 1952 total aligned reads displayed.
CCAGAAGCCAAAATTCTGTTCTTTTTATTAACTTTTGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_34/1912‑2107 | ttcaatatgcgtgatttccctaataagaaagtatacgtcatgatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgatat < 1:3642923‑M2/1‑1 (MQ=255)tgtgttcgatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattat < 1:1867460‑M2/1‑1 (MQ=255)tgtgttcgatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattat < 2:55304‑M2/1‑1 (MQ=255)ccAGAAGCCAAAAGTCTGTTCTTTTTATTAACTTTTGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCt < 2:1610849/135‑1 (MQ=255)atgaaaaggatttcagatgaaaatgtataggattctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctat > 1:1790268‑M1/135‑135 (MQ=255)atgaaaaggatttcagatgaaaatgtataggattctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctat > 2:2029443‑M1/135‑135 (MQ=255)atgaaaaggatttcagatgaaaatgtataggattctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctat > 2:3492262‑M1/135‑135 (MQ=255)aagatttatatcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttt > 2:383474‑M1/135‑135 (MQ=255) gtgttcgatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTg > 2:602169‑M2/134‑135 (MQ=255) tcgagctcaagaaagtttaaatcgctatactacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTgg < 2:2791251‑M1/3‑1 (MQ=255) caggatccacaatatgaaatttctaaagaatgcctagaaattctggaaaactccgtagatgcaaaaggtcgaaatattcatgtaacaaaattgcatgtgcctaagcctatacttattaacgaaaaagaaagtTgg > 2:1823300‑M2/133‑135 (MQ=255) aGAAGCCAAAATTCTGTTCTTTTTATTAACTTTTGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTgg > 2:2449562/1‑135 (MQ=255) aatatgcgtgatttccctaataagaaagtatacgtcatgatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGa > 1:406704‑M2/132‑135 (MQ=255) gagctcaagaaagtttaaatcgctatactacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGAt > 1:2107168‑M1/131‑135 (MQ=255) tatgcgtgatttccctaataagaaagtatacgtcatgatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATa < 2:3200625‑M2/6‑1 (MQ=255) agctcaagaaagtttaaatcgctatactacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATa > 2:3888766‑M1/130‑135 (MQ=255) cgatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATa < 1:2604342‑M2/6‑1 (MQ=255) tccacaatatgaaatttctaaagaatgcctagaaattctggaaaactccgtagatgcaaaaggtcgaaatattcatgtaacaaaattgcatgtgcctaagcctatacttattaacgaaaaagaaagtTGGATa > 2:849613‑M2/128‑133 (MQ=255) ggatttcagatgaaaatgtataggattctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAgg > 1:2178064‑M1/128‑135 (MQ=255) gatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATa > 2:1017455‑M2/128‑133 (MQ=255) gatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATa > 1:2722301‑M2/128‑133 (MQ=255) cacaatatgaaatttctaaagaatgcctagaaattctggaaaactccgtagatgcaaaaggtcgaaatattcatgtaacaaaattgcatgtgcctaagcctatacttattaacgaaaaagaaagtTGGATAGGCt < 1:3562320‑M2/10‑1 (MQ=255) tcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTa < 1:3380573‑M1/11‑1 (MQ=255) cctaataagaaagtatacgtcatgatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTg > 2:2254961‑M2/117‑118 (MQ=255) tcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTa > 1:2393486‑M2/115‑135 (MQ=255) gatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGa > 1:452571‑M1/113‑135 (MQ=255) tcgctatactacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaat < 2:2937330‑M1/1‑1 (MQ=255) ttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACa > 1:1455783‑M1/110‑134 (MQ=255) ggattctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGaaaa > 1:3228708‑M1/106‑135 (MQ=255) caaggttatgtatactggatgggagatagcagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGaaaa < 2:3118625‑M2/30‑1 (MQ=255) ttttGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:100272/135‑1 (MQ=255) ttttGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:3156095/135‑1 (MQ=255) tgcctagaaattctggaaaactccgtagatgcaaaaggtcgaaatattcatgtaacaaaattgcatgtgcctaagcctatacttattaacgaaaaagaaagtTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:930298‑M2/33‑1 (MQ=255) tgcctagaaattctggaaaactccgtagatgcaaaaggtcgaaatattcatgtaacaaaattgcatgtgcctaagcctatacttattaacgaaaaagaaagtTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:2532905‑M2/33‑1 (MQ=255) tgcctagaaattctggaaaactccgtagatgcaaaaggtcgaaatattcatgtaacaaaattgcatgtgcctaagcctatacttattaacgaaaaagaaagtTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:689789‑M2/33‑1 (MQ=255) tacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 1:108899‑M1/103‑135 (MQ=255) ggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:2636587‑M2/33‑1 (MQ=255) ggttatgtatactggatgggagatagaagacttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:1145855‑M2/33‑1 (MQ=255) ggttatgtagactggaagggagatagaagacttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:1929898‑M2/33‑1 (MQ=255) tctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 1:198184‑M1/102‑134 (MQ=255) tctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 1:3081786‑M1/102‑134 (MQ=255) tctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 2:18939‑M1/102‑134 (MQ=255) tctacgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:1406438‑M1/33‑1 (MQ=255) tacgtcatgatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaaggttggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAAATAGACAGAAAAAtt < 1:1383804‑M2/33‑1 (MQ=255) aagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 1:223426‑M1/101‑133 (MQ=255) aagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 2:3398724‑M1/101‑133 (MQ=255) aagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 1:2987606‑M1/101‑133 (MQ=255) agtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTaa > 2:1292778‑M1/100‑134 (MQ=255) tgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgt < 2:3060410‑M2/38‑1 (MQ=255) cgttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgt > 2:916837‑M1/98‑135 (MQ=255) gttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactctggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgtg < 1:3814199‑M1/39‑1 (MQ=255) gttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctat < 1:3445933‑M1/1‑1 (MQ=255) gttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgtg < 2:120777‑M1/39‑1 (MQ=255) gttgaaacgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgt < 2:1459978‑M1/38‑1 (MQ=255) cccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:1070605‑M1/33‑1 (MQ=255) ccatttgtgacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgt > 1:2050222‑M1/96‑133 (MQ=255) actagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgt > 2:470151‑M1/96‑133 (MQ=255) gTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgtgtg > 1:2798765/1‑135 (MQ=255) ctagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 1:1723858‑M1/95‑127 (MQ=255) ttctggaaaactccgtagatgcaaaaggtcgaaatattcatgtaacaaaattgcatgtgcctaagcctatacttattaacgaaaaagaaagtTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 2:211014‑M2/43‑1 (MQ=255) atgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 1:623430‑M2/43‑1 (MQ=255) agaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 2:2376093‑M1/93‑125 (MQ=255) agaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 2:3745961‑M1/43‑1 (MQ=255) tattatTCCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 2:1954531/134‑1 (MQ=255) gcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgatat > 1:2537907‑M2/91‑91 (MQ=255) aaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 2:3337386‑M1/43‑1 (MQ=255) gggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGAc < 2:28578‑M1/46‑1 (MQ=255) cgattagagtatattttttctaagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGAc < 2:133725‑M1/46‑1 (MQ=255) gaaaactccgtagatgcaaaaggtcgaaatattcatgtaacaaaattgcatgtgcctaagcctatacttattaacgaaaaagaaagtTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTa < 1:562224‑M2/48‑1 (MQ=255) ataCCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTa < 2:2320023/135‑1 (MQ=255) tgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTa < 2:2722263‑M2/48‑1 (MQ=255) gggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:399797‑M2/33‑1 (MQ=255) cgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTaga > 2:1730778‑M2/86‑135 (MQ=255) cAAAAAAAGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGAATACAAACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCAGTAGTCTGGATAGGCTACAAATAACAAGACATAAAAATTAAGGAGTGTAGACTAgaagaa > 2:3258547/1‑135 (MQ=255) aaaaaaTGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAgaagaa > 1:1310904/1‑134 (MQ=255) acgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACa < 1:3895712‑M1/58‑1 (MQ=255) cgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACt < 2:3627464‑M1/47‑1 (MQ=255) agagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 1:3688459‑M2/76‑108 (MQ=255) atgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATAc < 1:1647361‑M1/61‑1 (MQ=255) gaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGa > 1:1567438‑M2/72‑116 (MQ=255) taaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACataccagg > 1:231328‑M2/71‑132 (MQ=255) taagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:1670363‑M1/33‑1 (MQ=255) taagtttgaccatatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAAcataccagga < 1:1245161‑M1/66‑5 (MQ=255) aaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAtaccag < 1:2470199‑M2/64‑3 (MQ=255) gaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAaacataccaggagg > 1:3755876‑M2/68‑129 (MQ=255) tCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatt < 1:769225‑M1/135‑11 (MQ=255) catatagtagttgctttttctggaggaaaagactcaggtgttttactggaattagtctaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:3299230‑M1/33‑1 (MQ=255) gttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTa < 2:2983577‑M1/48‑1 (MQ=255) tgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:2919327‑M1/33‑1 (MQ=255) atctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgt < 1:8281‑M1/38‑1 (MQ=255) atctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTaga > 1:523339‑M1/43‑92 (MQ=255) ctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:713088‑M1/33‑1 (MQ=255) cTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGGGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatt > 2:3682223‑M1/1‑99 (MQ=255) aTGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 1:2847049/1‑66 (MQ=255) aTGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaacttt > 2:3545053‑M1/1‑95 (MQ=255) cttattaacgaaaaagaaagtTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACa < 1:1509328‑M2/58‑1 (MQ=255) aTCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattaaagcaacaa > 1:1178154‑M1/1‑72 (MQ=255) tatagttggatagGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaatcgtc < 2:154560‑M1/129‑68 (MQ=255) gTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaatcgtc < 2:763531‑M1/135‑68 (MQ=255) aatggATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaatcgtc > 2:2187510‑M1/3‑64 (MQ=255) | CCAGAAGCCAAAATTCTGTTCTTTTTATTAACTTTTGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_34/1912‑2107 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |