| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_34 | 2046 = | 132 (0.420) | 301 (0.820) +T |
51/246 | 1.9 | 82.1% | intergenic (‑223/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | PaaD‑like protein (DUF59) involved in Fe‑S cluster assembly/– |
| ? | AssemblyC74_contig_56 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Co‑activator of prophage gene expression IbrA | |||||
Only 100 of 307 total aligned reads displayed.
GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_34/2107‑2046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAATT > AssemblyC74_contig_56/1‑134 | GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAAC > 2:239728/1‑134GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATG > 2:669457/1‑100 GTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACAT < 1:1356356/135‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGT < 2:3535539/135‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 2:2649415/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 1:3799062/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 1:983899/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 2:1037359/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 2:169020/134‑1 TGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 1:2041211/134‑1 CTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATT < 1:1422396/135‑1 TAGTCTACACTCCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGA < 2:396262/66‑1 TAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTA < 2:3492947/135‑1 TAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAAC > 1:2983577/1‑106 AGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 2:3627464/123‑1 ttgtCACCTTAATTTTTCTGTCTTGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCGATAGCTATAACGAATAGATCCAATCATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:1842970/131‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT > 2:1798147/1‑135 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:905935/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:391070/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:939216/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:1292674/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT > 2:1623777/1‑135 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:2350703/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:1559571/135‑1 TACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATT > 1:383273/1‑132 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 2:230130/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 1:2535628/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 1:2866589/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 2:2785975/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 1:331817/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAAGTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 2:2983153/135‑1 CACACCTTAATTTTTCTGTATAGATAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG < 2:3782377/135‑1 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGT > 1:1286147/1‑133 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGT > 2:767406/1‑133 ACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:962074/130‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:1009159/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:2206296/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:2623163/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:1925162/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:1898959/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:2081410/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:3156778/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:3260137/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:1525198/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:1456756/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:3351898/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:108899/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:432431/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:3567770/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:806485/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:562119/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 1:1344718/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAA > 2:1433072/1‑130 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG > 1:1723858/1‑127 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG > 2:2910907/1‑127 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT > 1:3253912/1‑125 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT > 1:3676127/1‑125 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:407041/125‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCAAAGTATTATTTCTAGTAACTGTA > 2:1232438/1‑135 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG > 2:1998560/1‑109 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGAT < 2:3093324/99‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTAT > 1:85622/1‑70 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTAT < 2:85622/70‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAA < 2:3863424/63‑1 AATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAA > 1:3863424/1‑63 TTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTA > 1:1493628/1‑135 TTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTAT < 1:624422/67‑1 TGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG > 2:3404587/1‑119 TCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAAGTGTAGTATAGCGAT > 2:3233443/1‑135 TCTAGTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCT < 1:2639289/76‑1 GTTAATTGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAA < 1:2781528/135‑1 TGTAGCCTATCCATTCCACTCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTC < 1:3156778/135‑1 TGTAGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTC < 1:400176/135‑1 AGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTG > 1:1198554/1‑135 AGCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT > 1:510655/1‑102 GCCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGA < 2:2081410/135‑1 CCTATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCTATTTAAACTTTCTTG > 2:3029558/1‑133 TATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCT > 2:1349474/1‑135 TATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCT > 2:3888766/1‑135 TATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTC < 2:3332694/128‑1 TATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAG > 2:2953293/1‑100 TATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGA < 2:1773820/66‑1 TATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGA > 1:1773935/1‑66 ATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTC > 1:3382146/1‑135 ATCCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 2:114736/97‑1 ATCCATTCCAATCATAAAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACTAATAGATCCAAACATCGACACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATATCGATTTAAACTTTCTTGAGCTC > 1:3700009/1‑135 CCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 2:3712336/135‑1 CCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 1:1625542/135‑1 CCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 2:384202/135‑1 CCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 2:514681/135‑1 CCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 1:561729/135‑1 CCATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGA < 1:1910573/135‑1 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 1:2198240/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 1:1753764/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 2:1569277/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAA > 1:2815734/1‑134 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCT < 1:2395992/93‑1 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG > 1:2293545/1‑77 ATTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCG < 2:2293517/77‑1 TTCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAATT < 1:2931786/135‑1 | GGTATGTTTTCTTCTAGTCTACACACCTTAATTTTTCTGTCTAGTTAATTGTAGCCTATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_34/2107‑2046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCAATCATATAGGGGATAAAAGTTAAAAATATTATGATAAACTCTATAGCTATAACGAATAGATCCAAACATCGTCACAGTATTATTTCTAGTAACTGTAGTATAGCGATTTAAACTTTCTTGAGCTCGAATT > AssemblyC74_contig_56/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |