| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_44 | = 1136 | 0 (0.000) | 613 (0.590) | 97/248 | 0.2 | 100% | coding (1/1134 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_48 | = 844 | 0 (0.000) | coding (843/843 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Chitinase (EC 3.2.1.14) | |||||
Only 100 of 613 total aligned reads displayed.
TTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_44/1003‑1136‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTGGTAATTTC < AssemblyC74_contig_48/844‑712 TTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCA < 2:2645623/135‑1 TGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAG < 2:179199/135‑1 ACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCG < 1:3299484/128‑1 CTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATA < 1:3864950/135‑1 CTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATA < 2:1140701/135‑1 CTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATA < 2:2786458/135‑1 ATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATAT > 1:3593731/1‑134 CATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACA > 1:3367288/1‑135 CATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATAACA > 2:1234111/1‑135 TTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTT > 1:1431810/1‑135 CGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTG < 2:3770919/135‑1 CACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAA > 1:150114/1‑135 CAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACA > 2:3636284/1‑135 CAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACA > 1:55188/1‑135 CAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACA > 1:693167/1‑135 CAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCG > 1:1555748/1‑111 CAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATATAACGTAGTTAAATTACTACAACCCATGAAAATAATGATCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATAAAGCGTATAAATATCACAGTTTTGGAACA > 2:1331926/1‑135 GTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATT < 2:3898199/134‑1 GTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATT < 1:211954/134‑1 ATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAG > 1:1910207/1‑135 TCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGA > 2:1577852/1‑135 TCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGA > 1:1956215/1‑135 TCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGA > 1:232147/1‑135 TCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCG < 2:1899120/100‑1 CCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGAT < 2:1431810/135‑1 CCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGAT < 1:3453793/135‑1 CAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTG > 1:2591506/1‑135 CAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTG > 1:3805750/1‑135 CAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTG > 2:2577901/1‑135 CAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTG > 2:812427/1‑135 AAATTTAACGTAGTTATATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGTTTGTTTTA < 2:1278146/135‑1 AAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTA > 1:2381028/1‑135 AAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTA < 1:2084406/135‑1 AAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTA < 2:3202304/135‑1 AAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTA < 2:354448/135‑1 AATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTG < 1:887542/129‑1 AATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTG > 2:887542/1‑129 AATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATT < 1:1605728/115‑1 GTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCC < 2:1492938/135‑1 GTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCC < 1:1400038/135‑1 AGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCC > 2:1378388/1‑134 TACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTA < 2:1683257/135‑1 ACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATC < 2:2381028/135‑1 ACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATC < 2:2111878/135‑1 ACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATC < 2:1729005/135‑1 CAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATC > 1:1208150/1‑134 CCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACA > 1:3065831/1‑134 ACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCC > 2:2528942/1‑110 CATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCCCAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGGTGTGTTAGATACATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTA > 2:415703/1‑134 TGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGT < 2:3473719/135‑1 TGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGT < 2:1956215/135‑1 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAATATTGGTTGTTTTAGATAAATCACAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATACGTT > 2:3301841/1‑135 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTT < 1:1778883/135‑1 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTT > 1:3485418/1‑135 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTT > 2:2310915/1‑135 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTT > 2:1615271/1‑135 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTT > 2:3011621/1‑135 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTT > 2:3671421/1‑135 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTT > 1:2270803/1‑135 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTT > 1:1104354/1‑135 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTT > 1:958530/1‑135 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATC > 2:605319/1‑117 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATC > 1:635347/1‑117 GCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGT > 1:3657044/1‑111 TTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCC > 2:3383387/1‑135 TCGTGACACTATACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGTTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCT > 2:642817/1‑135 TCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTG > 1:2744989/1‑81 CGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTT > 1:1845116/1‑135 CGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTT > 1:1293988/1‑135 GACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCC < 1:812427/135‑1 ACATGTCCCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCG > 2:2715555/1‑135 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGA < 2:75326/135‑1 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGA > 2:3259475/1‑135 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGG > 2:2925080/1‑133 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCG > 2:3127407/1‑128 CCAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAG > 2:2452063/1‑83 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATGTCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 1:441310/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 1:1326487/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 1:1249000/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 1:1002469/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 1:2643196/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 1:2544625/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 1:2512695/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAA > 2:207473/1‑135 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGT < 1:3218129/106‑1 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATC < 2:3431190/89‑1 CAACTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGT > 1:2023151/1‑83 CTACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTT < 1:289179/135‑1 TACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGT < 1:2980809/102‑1 ACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTGG > 1:1807928/1‑135 ACTTAAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTGG > 1:1649762/1‑135 AAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTGGTAAT > 2:3806846/1‑135 AAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTATAATCAGTTAAAAACATTAAAAATAACCGCAAGGGAATTTGGTAAT > 2:1065751/1‑135 AAATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAAT < 2:286196/79‑1 AATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTGGTAAT > 2:1988780/1‑134 AATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTA < 2:518797/56‑1 ATCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTGGTAATT > 2:3052389/1‑134 TCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTGGTAATTTC > 2:2242407/1‑135 TCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTGGTAATTTC > 1:1722829/1‑135 TCAAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTA > 1:2801365/1‑73 TTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_44/1003‑1136‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAGCGTATCAATATCACAGTTTTGGAACATATTTGAAAGATTGGTTGTTTTAGATAAATCCCAACCAGTTAAATCAACATACTTTAATCCGTTAAAATCCTTAAACATTCCCGCCAGGGAATTTGGTAATTTC < AssemblyC74_contig_48/844‑712 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |