New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_27 | = 7728 | 0 (0.000) | 430 (0.560) | 85/248 | 1.0 | 100% | coding (705/705 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) |
? | AssemblyC74_contig_41 | = 1330 | 0 (0.000) | coding (1/411 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) |
Only 100 of 430 total aligned reads displayed.
CAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_27/7595‑7728 | gTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgta > 1:1766962‑M1/1‑132 (MQ=255) gTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgta > 1:1721744‑M1/1‑132 (MQ=255) gTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgta > 1:135689‑M1/1‑132 (MQ=255) ttttAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtat > 2:2282752‑M1/1‑131 (MQ=255) ttttAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtat > 1:1606961‑M1/1‑131 (MQ=255) ttAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatt > 2:3164138‑M1/1‑129 (MQ=255) cAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttccca > 1:3289233‑M1/1‑124 (MQ=255) cAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttccca > 1:2402666‑M1/1‑124 (MQ=255) cAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttccca > 2:757385‑M1/1‑124 (MQ=255) cAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttc < 1:3455520‑M1/131‑8 (MQ=255) tCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattca < 1:179587‑M1/135‑15 (MQ=255) tCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattca < 1:757385‑M1/135‑15 (MQ=255) ttATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataa > 1:3613124‑M1/1‑118 (MQ=255) ttATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataa > 1:3286735‑M1/1‑118 (MQ=255) ttATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataa > 1:2739900‑M1/1‑118 (MQ=255) ttATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataa > 2:2730746‑M1/1‑118 (MQ=255) ttATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataa > 1:1063496‑M1/1‑118 (MQ=255) ttATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataa > 2:1452138‑M1/1‑118 (MQ=255) ttATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataa > 1:2350309‑M1/1‑118 (MQ=255) ttATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattca < 1:8393‑M1/132‑15 (MQ=255) ttATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattca > 2:8427‑M1/1‑118 (MQ=255) ttATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGATCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATAAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTttatttcccattcataa > 1:3122464‑M1/1‑118 (MQ=255) gAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatc < 2:1606961‑M1/135‑23 (MQ=255) gAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatc < 2:1036201‑M1/135‑23 (MQ=255) aaaaaaaaTTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcc > 2:2817644‑M1/1‑112 (MQ=255) aaaaTTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaa < 1:2582989‑M1/135‑28 (MQ=255) aaaaTTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaa < 2:1155376‑M1/135‑28 (MQ=255) aaaaTTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaa > 2:2622610‑M1/1‑108 (MQ=255) aaaaTTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaa < 2:3774335‑M1/135‑28 (MQ=255) aaaaTTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaa < 1:3322543‑M1/135‑28 (MQ=255) aaaTTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccatacataaaaatcctaaag > 2:3824199‑M1/1‑107 (MQ=255) ttaACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaattta < 1:2794388‑M1/135‑40 (MQ=255) aCTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagc > 2:3505039‑M1/1‑93 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 2:1382448‑M1/135‑44 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 2:937237‑M1/135‑44 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 1:3164138‑M1/135‑44 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 1:2962317‑M1/135‑44 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 2:3005687‑M1/135‑44 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 2:3573431‑M1/135‑44 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 2:3613124‑M1/135‑44 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 2:418364‑M1/135‑44 (MQ=255) cTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa < 1:1111795‑M1/135‑44 (MQ=255) aTCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaac > 2:1658499‑M1/1‑86 (MQ=255) aTCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaac > 2:1903626‑M1/1‑86 (MQ=255) aTCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaac > 1:375006‑M1/1‑86 (MQ=255) aTCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaac > 1:862644‑M1/1‑86 (MQ=255) cgacgaGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacat > 1:1040453‑M1/1‑84 (MQ=255) cgacgaGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacat > 1:586670‑M1/1‑84 (MQ=255) cgacgaGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaa > 1:45743‑M1/1‑84 (MQ=255) gacgaGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatt > 2:1195927‑M1/1‑83 (MQ=255) acgaGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacattt < 2:2353506‑M1/135‑54 (MQ=255) aaaTTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgt > 1:1524239‑M1/1‑76 (MQ=255) aaaTTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgt > 2:449637‑M1/1‑76 (MQ=255) aaaTTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATAAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCTTTgtatttaccattcataaaaatactaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgt > 2:2554956‑M1/1‑76 (MQ=255) aaTTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtc < 2:634918‑M1/133‑59 (MQ=255) tttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctc < 2:3403841‑M1/135‑63 (MQ=255) ttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctacagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 1:1936258‑M1/135‑64 (MQ=255) ttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 1:2237402‑M1/135‑64 (MQ=255) ttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 2:3289213‑M1/135‑64 (MQ=255) ttAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg < 1:2662194‑M1/135‑64 (MQ=255) ggAACAAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAACATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatactaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcg < 2:2688375‑M1/135‑69 (MQ=255) gAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcg < 2:2376104‑M1/134‑69 (MQ=255) ccAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattg < 1:3494146‑M1/135‑73 (MQ=255) ccAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattg < 2:2898741‑M1/135‑73 (MQ=255) aaTGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaa > 1:2301777‑M1/1‑61 (MQ=255) ttAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataa < 2:1763968‑M1/135‑80 (MQ=255) tAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataat < 2:1063496‑M1/135‑81 (MQ=255) tAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataa < 2:3117636‑M1/134‑80 (MQ=255) tAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataa < 1:2929753‑M1/134‑80 (MQ=255) tAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataa < 2:331408‑M1/134‑80 (MQ=255) tAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataa < 1:14522‑M1/134‑80 (MQ=255) tAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataa < 2:1253837‑M1/134‑80 (MQ=255) tatatTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcg > 2:2196608‑M1/1‑52 (MQ=255) atTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacc < 2:249262‑M1/135‑87 (MQ=255) atTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacc > 1:1829074‑M1/1‑49 (MQ=255) atTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacc > 1:1192251‑M1/1‑49 (MQ=255) atTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagt > 1:302976‑M1/1‑49 (MQ=255) atTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatactaaagaactgtatttagcaacgaaacaattatgtctatccgatagattgaagataattgaacc > 1:43243‑M1/1‑49 (MQ=255) ttAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctt < 1:933764‑M1/135‑89 (MQ=255) tAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaaccttt < 1:2148689‑M1/135‑90 (MQ=255) aaGCAATTAATCAATTAGTGGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttag > 2:208560‑M1/1‑44 (MQ=255) aaGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaagcatttatgtcgctcggatcgattgaagataa > 1:2529718‑M1/1‑44 (MQ=255) aaGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttag > 2:1856047‑M1/1‑44 (MQ=255) aaGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttag < 2:3038706‑M1/135‑92 (MQ=255) aGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttaga > 1:998395‑M1/1‑43 (MQ=255) ttttatcaaTTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtaaggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgtt < 2:3283064‑M1/131‑97 (MQ=255) aTTAATCCATTAGTAGAAAAAAATGAAGATAGTGTCGTTgtatttcccagtcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatg < 2:1215235‑M1/133‑95 (MQ=255) aTTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctt < 1:125467‑M1/127‑89 (MQ=255) aaTCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgta < 2:510959‑M1/135‑100 (MQ=255) aTCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtag > 2:2452520‑M1/1‑35 (MQ=255) cAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagat < 1:679466‑M1/135‑103 (MQ=255) aTTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattt < 1:2877297‑M1/135‑105 (MQ=255) aTTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattt < 2:1963717‑M1/135‑105 (MQ=255) tagtagAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattttc < 1:1024284‑M1/135‑107 (MQ=255) gtagAAAAAAATGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctt > 2:1304083‑M1/1‑27 (MQ=255) aaaaaTGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattttcataata < 2:3333354‑M1/133‑113 (MQ=255) aaaaaTGAAGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattttcataata < 1:1989915‑M1/133‑113 (MQ=255) aGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattttcataatat > 1:3697403‑M1/1‑13 (MQ=255) aGATATTGTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacggaatttagcaacgaaacatttatgtcgctcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagat > 2:2957557‑M1/1‑13 (MQ=255) gTCGTTgtatttcccattcataaaaatcctaaagtacgggatttagcaacgaaaaatttatgtcgatcggatcgattgaagataattgaacctttagatgttgtagattttcataatatagcaagtcgtagtttt > 2:800331‑M1/1‑6 (MQ=255) | CAGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_27/7595‑7728 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |