| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_27 | = 7728 | 0 (0.000) | 430 (0.560) | 85/248 | 1.0 | 100% | coding (705/705 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) |
| ? | AssemblyC74_contig_41 | = 1330 | 0 (0.000) | coding (1/411 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) | |||||
Only 100 of 935 total aligned reads displayed.
AATTAAAAAACTACGACTTGCTATATTATGAAAATCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_41/1196‑1330 | cTATATTATGAAAATCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttt > 2:3236875‑M2/1‑115 (MQ=255) atatTATGAAAATCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcattttt < 1:2103734‑M2/134‑22 (MQ=255) tattatGAAAATCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcattttttt > 2:2826443‑M2/1‑112 (MQ=255) tattatGAAAATCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcattttt < 2:2027122‑M2/133‑22 (MQ=255) atGAAAATCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctac > 1:337733‑M2/1‑108 (MQ=255) gAAAATCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctacta < 1:464702‑M2/135‑30 (MQ=255) aaaTCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaat < 1:1791399‑M2/135‑32 (MQ=255) aaaTCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaat < 2:2301777‑M2/135‑32 (MQ=255) cTACAACATCTTAAGGTTCAATTATATTCAATAGATCAGATCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTACGTACTATAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgagacaatatcttcatttttttctactaattgat > 2:2201437‑M2/1‑100 (MQ=255) cTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgat > 2:3079107‑M2/1‑100 (MQ=255) cTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgat > 1:71521‑M2/1‑100 (MQ=255) cTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgat > 1:1163814‑M2/1‑100 (MQ=255) cTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctt > 1:1000217‑M2/1‑91 (MQ=255) cTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctt > 2:1610177‑M2/1‑91 (MQ=255) cTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctt > 2:1407837‑M2/1‑91 (MQ=255) cTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctt > 2:1856047‑M2/1‑91 (MQ=255) aaGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaa < 1:2907874‑M2/135‑48 (MQ=255) aaGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaa < 1:933764‑M2/135‑48 (MQ=255) aaGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctac < 1:1304083‑M2/115‑28 (MQ=255) ggTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaat < 2:249262‑M2/135‑50 (MQ=255) ggTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctt < 2:3317659‑M2/130‑45 (MQ=255) tCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaata > 2:2928980‑M2/1‑83 (MQ=255) cAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatata > 1:2685959‑M2/1‑82 (MQ=255) cAATGATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatata > 1:2632470‑M2/1‑82 (MQ=255) ttATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatatta < 1:878483‑M2/134‑56 (MQ=255) ttATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatatta < 2:2745183‑M2/134‑56 (MQ=255) ttATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatatta < 1:3828065‑M2/134‑56 (MQ=255) ttATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatatta < 1:3267293‑M2/134‑56 (MQ=255) ttATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatatta < 1:1632260‑M2/134‑56 (MQ=255) ttATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatatta < 1:842472‑M2/134‑56 (MQ=255) ttATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatatta < 2:414366‑M2/134‑56 (MQ=255) ttATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatatta < 1:14522‑M2/134‑56 (MQ=255) cAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattgg < 1:1744205‑M2/135‑64 (MQ=255) aaTCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattgg < 2:3150203‑M2/134‑64 (MQ=255) aaTCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcg > 1:377943‑M2/1‑71 (MQ=255) cGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttc < 1:1981771‑M2/134‑67 (MQ=255) cGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaa < 1:2534777‑M2/135‑73 (MQ=255) cGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaa < 2:1478084‑M2/135‑73 (MQ=255) cGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaa < 1:2179310‑M2/135‑73 (MQ=255) cGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaa < 1:1538096‑M2/135‑73 (MQ=255) cGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaatt > 2:855500‑M2/1‑63 (MQ=255) cGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaa < 2:1948620‑M2/135‑73 (MQ=255) cGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaa < 2:3289213‑M2/135‑73 (MQ=255) aGCGACATAAATGTTTCGTAGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcattttattctactaattgattaagtgctttaaatatattaatcattggttaccctaaat < 1:3306400‑M2/135‑75 (MQ=255) gACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaatt < 2:1217532‑M2/133‑76 (MQ=255) gACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctt < 1:1091048‑M2/102‑45 (MQ=255) aCATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattt > 2:1290893‑M2/1‑57 (MQ=255) aCATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattt > 2:3004517‑M2/1‑57 (MQ=255) aCATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattt > 2:1905975‑M2/1‑57 (MQ=255) aCATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattt > 2:2697918‑M2/1‑57 (MQ=255) aCATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattt > 1:407314‑M2/1‑57 (MQ=255) aCATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattt > 2:2103734‑M2/1‑57 (MQ=255) aTAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttct > 1:2294274‑M2/1‑55 (MQ=255) aaTGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttc < 1:1933630‑M2/130‑79 (MQ=255) aaTGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcatt > 2:3811278‑M2/1‑52 (MQ=255) aTGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcg > 2:899231‑M2/1‑51 (MQ=255) aTGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcg > 1:2229211‑M2/1‑51 (MQ=255) gTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgat > 1:3073448‑M2/1‑49 (MQ=255) gTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgat > 2:225230‑M2/1‑49 (MQ=255) tttCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatg > 1:604758‑M2/1‑48 (MQ=255) ttGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacag < 2:1134827‑M2/135‑93 (MQ=255) ttGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacag < 1:2825986‑M2/135‑93 (MQ=255) ttGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacag < 2:3767379‑M2/135‑93 (MQ=255) ttGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacag < 2:2867621‑M2/135‑93 (MQ=255) ttGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttaccctaaattttctcgtcgat > 2:2370080‑M2/1‑43 (MQ=255) ttGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacag < 2:135689‑M2/135‑93 (MQ=255) ttGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcg < 2:45743‑M2/127‑85 (MQ=255) ttGCTAAATTCCGTACGTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacag < 2:1192653‑M2/135‑93 (MQ=255) aCTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaata < 2:3689968‑M2/39‑11 (MQ=255) tttAGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttt < 2:1697000‑M2/135‑109 (MQ=255) tttAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttt < 1:2582989‑M2/135‑109 (MQ=255) tttAGGATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttt > 2:2622610‑M2/1‑27 (MQ=255) aGGATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataattttttt > 2:344920‑M2/1‑24 (MQ=255) gATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttcc < 1:2857817‑M2/135‑114 (MQ=255) gATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttcc < 1:2976039‑M2/135‑114 (MQ=255) gATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttcc < 1:3702807‑M2/135‑114 (MQ=255) gATTTTTATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctt < 1:1852044‑M2/66‑45 (MQ=255) gATTTTTATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatata > 1:1035416‑M2/1‑22 (MQ=255) tttATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataa > 2:2425010‑M2/1‑18 (MQ=255) tttATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataa > 2:2583775‑M2/1‑18 (MQ=255) tttATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataa > 2:3494374‑M2/1‑18 (MQ=255) tttATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataa > 2:72411‑M2/1‑18 (MQ=255) tttATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataa > 1:3599782‑M2/1‑18 (MQ=255) tttATGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataa > 2:1752304‑M2/1‑18 (MQ=255) tttAAGAATGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctgtaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataa > 2:1021783‑M2/1‑18 (MQ=255) ttattaATGGTAAATACaacgacaatatattcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataattttttttccataa > 2:1058537‑M2/1‑17 (MQ=255) ttATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataattttttttccataa > 1:352346‑M2/1‑17 (MQ=255) ttATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataattttttttccataa > 1:3140097‑M2/1‑17 (MQ=255) ttATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataattttttttccataa > 1:2739900‑M2/1‑17 (MQ=255) ttATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataattttttttccataa > 1:2344918‑M2/1‑17 (MQ=255) ttATGAATGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataattttttttccataa > 2:518245‑M2/1‑17 (MQ=255) tGAATTGTAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctataaatatattaataattggttcccctaaattttctcgtcgatgaaaattaaataatataaattatttccataatgat < 2:677175‑M2/135‑122 (MQ=255) aaTGGGAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattg > 2:3576104‑M2/1‑12 (MQ=255) tGGGAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataattttttttccataatgattg > 1:2402666‑M2/1‑10 (MQ=255) gggAAATACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgat < 1:749488‑M2/95‑87 (MQ=255) gAAATACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataattttttttccataatgattg < 1:3455520‑M2/131‑125 (MQ=255) aaTACaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataattttttttccataatgattggttaa > 2:3358893‑M2/1‑5 (MQ=255) aTACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaa > 1:1390350‑M2/1‑4 (MQ=255) tACcgcgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataatttttttccataatgattggttaaaact > 2:77783‑M2/1‑3 (MQ=255) aCaacgacaatatcttcatttttttctactaattgattaattgctttaaatatattaatcattggttcccctaaattttctcgtcgatgaacagttaataagataattttttttccataatgattggttaaaact > 1:1221746‑M2/1‑2 (MQ=255) | AATTAAAAAACTACGACTTGCTATATTATGAAAATCTACAACATCTAAAGGTTCAATTATCTTCAATCGATCCGAGCGACATAAATGTTTCGTTGCTAAATTCCGTACTTTAGGATTTTTATGAATGGGAAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_41/1196‑1330 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |