| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_45 | = 1002 | 0 (0.000) | 361 (0.340) | 94/248 | 0.1 | 100% | intergenic (‑96/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Integrase, catalytic region/– |
| ? | AssemblyC74_contig_55 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 2030 total aligned reads displayed.
CATTACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_45/868‑1002 | cATTACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCg < 2:1028063/135‑1 (MQ=255)cATTACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCg < 2:3583837/135‑1 (MQ=255) aaGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGttctta < 1:2390471‑M2/135‑7 (MQ=255) gCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaata > 1:3659435‑M2/1‑127 (MQ=255) gCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataa > 2:874398‑M2/1‑127 (MQ=255) gTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaa > 1:1008981‑M1/1‑123 (MQ=255) ggTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtataataatttaaaaa > 2:3247139‑M1/1‑119 (MQ=255) ggTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaatta > 2:1914623‑M1/1‑119 (MQ=255) ggTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagt < 1:2702040‑M2/135‑17 (MQ=255) tAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactga > 2:3456167‑M2/1‑115 (MQ=255) gATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGttcttataaagatatcgcaaaac < 1:2187138‑M2/135‑24 (MQ=255) gggTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGttcttataaagatatcgcaaaaca > 2:2884621‑M2/1‑109 (MQ=255) gggTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcct > 2:1308451‑M2/1‑109 (MQ=255) taAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatc > 1:3476334‑M1/1‑104 (MQ=255) taAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatc > 1:3225225‑M1/1‑104 (MQ=255) taAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttata < 1:3721197‑M2/135‑32 (MQ=255) taAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttata < 2:3357250‑M2/135‑32 (MQ=255) taAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttat > 1:2882480‑M2/1‑104 (MQ=255) aTTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtcta < 2:60406‑M2/134‑37 (MQ=255) aTTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaa < 1:645640‑M1/134‑37 (MQ=255) tATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatccgtagaatt > 2:2188962‑M1/1‑95 (MQ=255) tATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcct < 2:3314720‑M2/120‑26 (MQ=255) tATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcct > 1:3314720‑M2/1‑95 (MQ=255) tATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcactttt < 1:1836723‑M2/135‑41 (MQ=255) tATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcactttt > 1:733458‑M2/1‑95 (MQ=255) aTGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGttcttataaagatatcgcaaaacaacgataaaaagaataag < 1:2829481‑M2/135‑42 (MQ=255) aTGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcgg < 2:1704261‑M2/135‑42 (MQ=255) tGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatccgtagaatt > 1:897878‑M1/1‑93 (MQ=255) cACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGttcttataaagatatcgcaaaacaacgataaaaagaataagagat > 2:2632118‑M2/1‑89 (MQ=255) aCTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcggatgcag > 2:211761‑M2/1‑88 (MQ=255) aCTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcggatgcag > 1:3778646‑M2/1‑88 (MQ=255) aCTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcggatgca < 1:295778‑M2/134‑47 (MQ=255) ctcCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGTTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaa < 1:3151364‑M2/133‑49 (MQ=255) ctcCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaatt < 2:1982655‑M2/135‑51 (MQ=255) tcCTGGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAACCGGCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatccgtagaattttctagattgc < 2:3836245‑M1/135‑52 (MQ=255) ttGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcggatgcaggcagaga > 2:3696831‑M2/1‑81 (MQ=255) tGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcggatgcaggcagagat < 1:201226‑M2/135‑56 (MQ=255) tGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacatttt > 1:2547033‑M2/1‑76 (MQ=255) tttAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcggatgcaggcagagatatcagca < 2:2281904‑M2/135‑63 (MQ=255) ttAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatccgtagaattttctagattgcttacccatgta < 2:2427926‑M1/134‑63 (MQ=255) ttAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatccgtagaattttctagattgcttacccatgta < 1:124212‑M1/134‑63 (MQ=255) tAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatg < 2:3926899‑M2/135‑65 (MQ=255) tAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatg < 1:694911‑M2/135‑65 (MQ=255) gCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGttcttataa < 2:2359037‑M2/78‑10 (MQ=255) gCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaataactatgtgagataataaacatagaaaaa > 2:2828396‑M1/1‑69 (MQ=255) gCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaa < 2:1454601‑M2/135‑67 (MQ=255) cGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaataactatgtgagataataaacatagaaaaaa < 1:3390621‑M1/135‑68 (MQ=255) aTTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaa > 1:1142946‑M2/1‑63 (MQ=255) tACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatccgtagaattttct < 2:2767695‑M1/105‑45 (MQ=255) tACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcggatgcaggcagagatatcagcagtaatgtcactt > 2:1634842‑M2/1‑61 (MQ=255) tACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcggatgcaggcagagatatcagcagtaatgtcactt > 1:447993‑M2/1‑61 (MQ=255) tACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaataactatgtgagataataaacatagaaaaaagcttcag < 1:1767849‑M1/135‑75 (MQ=255) aCAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaa > 2:1374973‑M1/1‑60 (MQ=255) ttGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaataactatgtgagataataaacatagaaaaaagcttcagatactc < 1:1661133‑M1/135‑81 (MQ=255) ttGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaataactatgtgagataataaacatagaaaaaagcttcagatactc < 2:1164385‑M1/135‑81 (MQ=255) ttGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaataactatgtgagataataaacatagaaaaaagcttcagatactc < 1:1303944‑M1/135‑81 (MQ=255) ttGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaataactatgtgagataataaacatagaaaaaagcttcagatactc < 1:1414289‑M1/135‑81 (MQ=255) ttGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaataactatgtgagataataaacatagaaaaaagcttcagatactc < 1:1490854‑M1/135‑81 (MQ=255) tGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcggatgcaggcagagatatcagcagtaatgtcacttcgttgac > 1:3539119‑M2/1‑54 (MQ=255) gAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATGTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaataactatgtgagataataaacatagaaaaaagattcagatactcc > 1:1348168‑M1/1‑53 (MQ=255) aGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcat < 2:1542666‑M2/83‑32 (MQ=255) aGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaaggagaattttat > 1:3048350‑M2/1‑52 (MQ=255) aGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaaggagaattttat > 1:2467804‑M2/1‑52 (MQ=255) aGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacatttt > 2:3629984‑M2/1‑52 (MQ=255) gtgtAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGttcttataaagatatcgcaaaacaacgataaaaagaataagagataaaaacaaccctactacgtaaaaatttaatgctgaaagc < 1:2773825‑M2/135‑85 (MQ=255) gtgtAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaa < 2:3523744‑M2/120‑70 (MQ=255) aCATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcggatgcaggcagagatatcagcagtaatgtcacttcgttgaccgtggac > 1:1066614‑M2/1‑46 (MQ=255) aCATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaaggagaattttatgaaaaa > 1:3926899‑M2/1‑46 (MQ=255) cATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatccgtagaattttctagattgcttacccatgtaaaatcgttatagacagatttcagttgac > 1:822650‑M1/1‑45 (MQ=255) cATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcggatgcaggcagagatatcagcagtaatgtcacttcgttgaccgtggaccc > 1:1606265‑M2/1‑45 (MQ=255) cATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcggatgcaggcagagatatcagcagtaatgtcacttcgttgaccgtggaccc > 1:3847101‑M2/1‑45 (MQ=255) aTAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaaggagaattttatgaaaaaat > 2:796296‑M2/1‑44 (MQ=255) aaTGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatccgtagaattttctagattgcttacccatgtaaaatcgttatagacagatttcagttgacttct < 2:1841419‑M1/135‑95 (MQ=255) tGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaataactatgtgagataataaacatagaa > 2:1779123‑M1/1‑39 (MQ=255) tGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaaggagaattttatgaaaaaattaaga < 2:755088‑M2/135‑97 (MQ=255) ggCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatccgtagaattttctagattgcttacccatgtaaaatcgttatagacagatttcagttgacttctgcg < 2:3757205‑M1/135‑98 (MQ=255) gCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGttcttataaagatatcgcaaaacaacgataaaaagaataagagataaaaacaaccctactacgtaaaaatttaatgctgaaagcgattgataaaatgt < 2:1253155‑M2/135‑99 (MQ=255) gCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcggatgcaggcagagatatcagcagtaatgtcacttcgttgaccgtggacccaacgaata < 1:2254528‑M2/135‑99 (MQ=255) gCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcggatgcaggcagagatatcagcagtaatgtcactt < 2:2563112‑M2/111‑75 (MQ=255) gCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaataactatgtgagataataaacatagaaaaaagcttcagatactc > 2:710963‑M1/1‑37 (MQ=255) tttttATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaaggagaattttatgaaaaaattaagattaat > 1:1899865‑M2/1‑34 (MQ=255) ttttATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatccgtagaattttctagattgcttacccatgtaaaatcgttatagacagatttcagttgacttctgcgccatt < 2:432024‑M1/135‑103 (MQ=255) tttATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtctatgcgg > 1:545640‑M2/1‑32 (MQ=255) tttATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaataactatgtgagataataaacatagaaaaaagcttcagatactccctcaccctagagtctttcccca > 1:981897‑M1/1‑32 (MQ=255) tttATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaaggagaattttatgaaaaaattaagattaatt < 2:2034177‑M2/134‑103 (MQ=255) tATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatccgtagaattttctagattgcttacccatgtaaaatcgttat < 2:2698943‑M1/102‑73 (MQ=255) tATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaaggagaattttatgaaaaaattaagattaattggc < 1:1953909‑M2/135‑106 (MQ=255) tcGCTTAATTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaaggagaattttatgaaaaaattaagattaattggcttattag > 1:774665‑M2/1‑22 (MQ=255) aaTTATACAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaaggagaattttatgaaaaaattaagattaattggcttattaggcttgat > 2:942957‑M2/1‑16 (MQ=255) tataCAAACGGCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaaggagaattttatgaaaaaattaagattaattggcttattaggcttgatgtt > 2:1091830‑M2/1‑13 (MQ=255) taCAAACGGCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaataactatgtgagataataaacatagaaaaaagcttcagatactc < 2:2502306‑M1/91‑81 (MQ=255) aaCGGCGttcttataaagatatcgcaaaacaacgataaaaagaataagagataaaaacaaccctactacgtaaaaatttaatgctgaaagcgattgataaaatgtatgttttattatttttattataaaaaacgc > 2:296219‑M2/1‑7 (MQ=255) aaCGGCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatccgtagaattttctagattgcttacccatgtaaaatcgttatagacagatttcagttgactt > 2:3056949‑M1/1‑7 (MQ=255) gCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatccgtagaattttctagattgcttacccatgtaaaatcgttatagacagatttcagttgacttctgcgccattgtacagggataaaaagacgcatgctatctt > 2:666913‑M1/1‑3 (MQ=255) gCGtataataatttaaaaattcatcatctaaatccgtagaattttctagattgcttacccatgtaaaatcgttatagacagatttcagttgacttctgcgccattgtacagggataaaaaga > 1:2107539‑M1/1‑3 (MQ=255) gCGtactaatataacatcactgattcctgttcatgtct < 2:3150645‑M2/38‑36 (MQ=255) gCGtaatataaaaaattaagcaaataatagactaaaaaataactatgtgagataataaacatagaaaaaagcttcagatactccctcaccctagagtctttccccaaaaagataagtatctgaagctttttcttt > 2:51272‑M1/1‑3 (MQ=255) gCGatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaaggagaattttatgaaaaaattaagattaattggcttattaggcttgatgttgtttattgta < 1:2626164‑M2/135‑133 (MQ=255) gatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaaggagaattttatgaaaaaattaagattaattggcttattaggcttgatgttgtttattgtagg < 1:231133‑M2/135‑135 (MQ=255) gatcaataaaaataagtaatttcttcgttataatcacttttgtaacaaattaaacattttttatgaacaaaaggagaattttatgaaaaaattaagattaattggcttattaggcttg < 1:3599960‑M2/118‑118 (MQ=255) | CATTACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_45/868‑1002 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |