| New junction evidence | |||||||||||
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gcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGctttttcttt > 1:363124‑M2/4‑135 (MQ=255) gcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGcgttttcttt > 2:625287‑M2/4‑135 (MQ=255) gTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTc > 2:765246‑M2/2‑81 (MQ=255) gTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGctttttctttt < 1:2107726‑M2/133‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGCTTTTTCTTTTT > AssemblyC74_contig_55/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |