| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_47 | = 786 | NA (NA) | 252 (0.290) +AAATGTTACGAATATGAC |
50/212 | 0.0 | 41.4% | noncoding (29/29 nt) | direct | CRISPR repeat with sequence agtgtagatgtaagtaattgggatacgtc |
| ? | AssemblyC74_contig_61 | = 81 | 418 (0.290) | coding (342/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 1323 total aligned reads displayed.
GCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_47/652‑882 | tatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTc > 2:2908106‑M2/92‑135 (MQ=255) gTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGaa < 1:1132598/135‑1 (MQ=255) gTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGaa < 1:319801/135‑1 (MQ=255) tatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGtt < 2:3652957‑M2/51‑1 (MQ=255) tggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAc < 1:1188781‑M2/53‑1 (MQ=255) tggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCCAACGTTAc < 2:2168662‑M2/53‑1 (MQ=255) ggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAc > 2:1881478‑M2/82‑134 (MQ=255) ggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCCAACGTTacg < 1:2801627‑M2/54‑2 (MQ=255) ctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCCAACGttacgtt > 1:3578785‑M2/80‑132 (MQ=255) tgtTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACt < 2:3504044/135‑1 (MQ=255) cgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGt < 2:76475‑M2/70‑1 (MQ=255) cgtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatcttacgaatatgacttctatgttttatgtcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGAAGTAAGTAATTGGGATACGTCGAATGTTACTTATATGAATGATATGttt < 1:1674605‑M2/72‑1 (MQ=255) agtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGttt > 2:573092‑M1/51‑135 (MQ=255) agtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGttt > 1:1255946‑M1/51‑135 (MQ=255) agtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGttt < 2:1444042‑M2/72‑1 (MQ=255) ctatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTAATATgtttt > 2:2556206‑M2/63‑134 (MQ=255) ctatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTAATATgtttt > 1:2502038‑M2/63‑134 (MQ=255) ctatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTAATATgtttt > 1:2704364‑M2/63‑134 (MQ=255) atatcgatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAATTAATTGGGATACTTCGAAGGTTACTTCTATGACTAATATgtttt > 1:1873239‑M2/63‑134 (MQ=255) tgtagatttaattaattgggctaagtctaatgttacttatatgaattcTGTGTTTCATAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGttt > 2:2264314‑M1/49‑133 (MQ=255) gtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACtt > 2:1350129‑M1/48‑115 (MQ=255) gtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTACAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTATAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCa < 2:2496648‑M1/88‑1 (MQ=255) gtAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTCATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCa > 2:3090685/1‑135 (MQ=255) agatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAgg < 2:509033‑M1/90‑1 (MQ=255) aGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGaa < 1:839034/105‑1 (MQ=40) aGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAgg > 1:1531047/1‑135 (MQ=255) gatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttactaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAggg < 1:25680‑M2/78‑1 (MQ=255) gatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGttt < 1:3781040‑M2/72‑1 (MQ=255) gatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGtt < 2:2643280‑M2/71‑1 (MQ=255) gatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAggg < 2:2422734‑M2/78‑1 (MQ=255) gatgtaagtaattgggagacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAggg < 1:1470656‑M2/78‑1 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAggg < 2:870959/135‑1 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGGAGACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAATATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAggg < 2:1690148/135‑1 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATTACTGCTATGTTTGAAtggg > 2:3863239/1‑135 (MQ=255) taagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTa > 1:242357‑M2/54‑135 (MQ=255) gtaaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTaa > 1:2028615/1‑133 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGTATGCTATGTTTGCAggg < 2:3291157‑M1/91‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt < 1:3905833‑M1/100‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt < 1:1316899‑M1/100‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGCGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGGTTAATCt < 2:1587350‑M1/100‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTAATATGtt < 2:2765137‑M2/71‑1 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTTCAGGGGTTAAATCt > 2:1526877/1‑135 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAg < 2:3402890/124‑1 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt > 2:3792732/1‑135 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt > 2:10345/1‑135 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt > 1:1001382/1‑135 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATc < 2:629355/133‑1 (MQ=255) ggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAggg < 2:3919390‑M1/91‑1 (MQ=255) ggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAggg > 2:829513‑M1/31‑121 (MQ=255) tcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGAt > 1:78396‑M1/24‑135 (MQ=255) caaatgttacgaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGa < 2:2731149‑M2/98‑1 (MQ=255) aaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATgta < 1:929962‑M1/115‑1 (MQ=255) ttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg > 1:70559‑M1/13‑135 (MQ=255) gaatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg < 1:2950735‑M2/110‑1 (MQ=255) tctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTAtgaat < 1:2756772‑M1/76‑3 (MQ=255) tctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTgg < 2:3147665‑M1/124‑1 (MQ=255) tctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg > 1:2069072‑M1/12‑134 (MQ=255) aatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTa > 2:1095363‑M2/25‑118 (MQ=255) aatatgacttctatgttttatggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTgg > 2:2826052‑M2/25‑135 (MQ=255) aTTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGAt < 2:1978183/123‑1 (MQ=40) gTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGt > 1:582153/1‑135 (MQ=35) atGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAg < 2:1726231/135‑1 (MQ=38) ggcTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGaa < 1:1047857‑M2/47‑1 (MQ=255) ggtgtggcTCATTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacgtctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtccaacgttacgt < 1:3475294‑M1/133‑90 (MQ=255) aTTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTtata < 1:2873068/135‑1 (MQ=255) gCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggct > 2:1820182‑M1/1‑40 (MQ=255) gCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggct > 1:3280550‑M1/1‑40 (MQ=255) gCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggct < 1:1820161‑M1/75‑36 (MQ=255) gCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCaaatgttacgaa > 2:2994185‑M1/1‑40 (MQ=255) gCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCaaatgttacgaa < 1:3003646‑M1/52‑13 (MQ=255) gCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTg < 1:1401618/135‑1 (MQ=255) ctctTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttact > 1:3432014‑M1/1‑39 (MQ=255) ctTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGttt > 2:3580305/1‑65 (MQ=40) aaCGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaa > 2:3225387‑M1/1‑33 (MQ=255) aCGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgctgtg > 1:225738‑M1/1‑32 (MQ=255) aCGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 1:417222‑M1/1‑32 (MQ=255) aGATGTAAGTACAGGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTTAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGTGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACGGAtatgttttatggctg < 1:2630896‑M2/135‑16 (MQ=255) aGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTg > 2:2345734/1‑119 (MQ=255) aGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTg < 1:2345734/119‑1 (MQ=255) aGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTg < 1:3858868/119‑1 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgt < 2:1182718‑M2/135‑17 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatga < 2:3718856‑M1/117‑96 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaagg > 1:990162‑M1/1‑22 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattg < 1:1595307‑M1/91‑70 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt < 2:2029023‑M1/67‑46 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttct > 2:1287161‑M1/1‑14 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttactt > 2:2101907‑M1/1‑14 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtccaacgttacgt < 1:3700741‑M1/103‑90 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacg < 1:506880‑M1/90‑77 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacg < 2:689351‑M1/90‑77 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgta > 1:643811‑M1/1‑14 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggct > 2:937332‑M1/1‑14 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggct < 1:2163655‑M1/49‑36 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACt > 1:1935340/1‑99 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:3633606‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:3107836‑M2/134‑25 (MQ=255) tGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTCACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacg > 2:344946‑M2/1‑107 (MQ=255) ggATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:1767316‑M2/1‑105 (MQ=255) cGTCaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctc < 1:3349823‑M1/46‑43 (MQ=255) tCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagat < 1:1734479‑M2/135‑38 (MQ=255) | GCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_47/652‑882 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |