New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_30 | = 330 | 546 (1.100) | 508 (0.980) | 109/248 | 0.1 | 65.0% | intergenic (+78/+111) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Mobile element protein/hypothetical protein |
? | AssemblyC74_contig_36 | = 1754 | 0 (0.000) | intergenic (+133/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | hypothetical protein/– |
Only 100 of 574 total aligned reads displayed.
GAAAAAGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_36/1620‑1754 | gAAAAAGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGTCCCATAAATAACAAGGTTAATTATACGACAACTTTTTTTCTGTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCAAGTAATTTGAATAATCt > 2:1523009/1‑135 (MQ=255) gAAAAAGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCt > 1:2440787/1‑135 (MQ=255) gAAAAAGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCt > 1:2179833/1‑135 (MQ=255) gAAAAAGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCt > 1:3432866/1‑135 (MQ=255) gAAAAAGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCt > 1:2060450/1‑135 (MQ=255) gAAAAAGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCt > 1:1990572/1‑135 (MQ=255) gAAAAAGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCt > 1:1730207/1‑135 (MQ=255) gAAAAAGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCt > 2:2367244/1‑135 (MQ=255) gAAAAAGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCt > 2:2157132/1‑135 (MQ=255) gAAAAAGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCt > 2:20357/1‑135 (MQ=255) gAAAAAGTAAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATTAAGGTTTATGGACCATAAATAACAAGGTTAATTATAAGAAAACATTTATTCTTTATAATCTTTAATTCGATAATACTTTCCATAAATTAGAATAATCt > 2:34656/1‑135 (MQ=17) aaaGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAATACTATCCAGTAAATTGAATAATCTt < 1:972512‑M2/133‑2 (MQ=255) aaaGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtgg > 2:1988972‑M2/1‑132 (MQ=255) aaaGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCAATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTt < 1:2601873‑M2/133‑2 (MQ=255) aaGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtgg < 1:3646546‑M2/134‑4 (MQ=255) aaTGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtca < 1:2248393‑M2/135‑14 (MQ=255) aaTGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtc > 2:3908888‑M2/1‑122 (MQ=255) tGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaa > 2:1905440‑M2/1‑120 (MQ=255) tGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaa > 1:3151969‑M2/1‑120 (MQ=255) tGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaa > 2:1079209‑M2/1‑120 (MQ=255) tCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatc > 1:1685755‑M2/1‑118 (MQ=255) tCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatc > 1:3326933‑M2/1‑118 (MQ=255) tCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatc > 1:509752‑M2/1‑118 (MQ=255) tCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatc > 1:537583‑M2/1‑118 (MQ=255) tCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatc > 1:2702252‑M2/1‑118 (MQ=255) acaATTGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCACATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTGAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcacatc > 2:1432526‑M2/2‑118 (MQ=255) cAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaat < 2:1683899‑M2/133‑17 (MQ=255) ggCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggact > 1:230158‑M2/1‑113 (MQ=255) ggCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggact > 1:904024‑M2/1‑113 (MQ=255) ccATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatc > 1:1590654‑M2/1‑111 (MQ=255) ccATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatc > 2:559956‑M2/1‑111 (MQ=255) aTTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgat > 2:637112‑M2/1‑109 (MQ=255) aTTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgat > 2:2598175‑M2/1‑109 (MQ=255) aTTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgat > 2:3646546‑M2/1‑109 (MQ=255) aTTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgat > 2:3523834‑M2/1‑109 (MQ=255) ttCAAAAATGTAGTTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggcactttgtcaaatcggactgataa > 2:2855920‑M2/1‑108 (MQ=255) aaaaaTGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggt < 1:323639‑M2/135‑31 (MQ=255) aaaaaTGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggt < 2:1846085‑M2/135‑31 (MQ=255) aaaaaTGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAAATCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggt > 2:460352‑M2/1‑105 (MQ=255) aaaaaTGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGAAAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggt < 2:3395525‑M2/135‑31 (MQ=255) aaaaTGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtc < 1:1410849‑M2/135‑32 (MQ=255) tGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatct > 1:2655758‑M2/1‑100 (MQ=255) tGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatct > 2:1164271‑M2/1‑100 (MQ=255) gTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaa < 1:48411‑M2/135‑41 (MQ=255) tttGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacat < 1:3728611‑M2/135‑44 (MQ=255) ggCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatc < 2:3241475‑M2/123‑35 (MQ=255) gCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaa < 2:224755‑M2/135‑48 (MQ=255) ataaataaCAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagtta > 2:2634688‑M2/1‑84 (MQ=255) taaataaCAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttag > 2:95624‑M2/1‑83 (MQ=255) aataaCAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagta > 2:2181240‑M2/1‑81 (MQ=255) ataaCAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaa < 1:2929825‑M2/135‑56 (MQ=255) cAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagt > 2:128549‑M2/1‑76 (MQ=255) ttATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctt < 1:185381‑M2/135‑69 (MQ=255) ataCGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAATACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttg < 1:1211638‑M2/135‑71 (MQ=255) ataCGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataa < 1:3824769‑M2/92‑28 (MQ=255) ataCGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactg > 2:2699075‑M2/1‑65 (MQ=255) aCGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgat > 1:1247340‑M2/1‑63 (MQ=255) cGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatg < 2:3007805‑M2/135‑74 (MQ=255) aCAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtt < 2:278971‑M2/135‑76 (MQ=255) aCAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtt < 2:2302524‑M2/135‑76 (MQ=255) aCAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaat < 2:1581371‑M2/76‑17 (MQ=255) cAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgttt < 1:828232‑M2/135‑77 (MQ=255) cAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgttt < 1:1161843‑M2/135‑77 (MQ=255) aaCTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttt > 1:2520500‑M2/1‑58 (MQ=255) aaCTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttt > 2:813739‑M2/1‑58 (MQ=255) tttttttCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgttttttt < 1:1107669‑M2/135‑81 (MQ=255) tttttttCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgttttttt > 2:1389226‑M2/1‑55 (MQ=255) ttttatCTTTATAATCTTTAATTCGATAATACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataatgtcatctataaaaatcaaagttagtaaaagtcaatagatttgatgttttttta < 1:28222‑M2/135‑82 (MQ=255) tttCTTTATATTCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgt > 1:3808202‑M2/1‑51 (MQ=255) tttCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgt > 1:1542580‑M2/1‑51 (MQ=255) tttCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgt > 1:2112919‑M2/1‑51 (MQ=255) ttCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtg > 2:3181876‑M2/1‑50 (MQ=255) tataATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagct > 1:3577520‑M2/1‑45 (MQ=255) ataATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctg > 2:3748766‑M2/1‑44 (MQ=255) aaTCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtg < 1:1490919‑M2/127‑86 (MQ=255) tttAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaac > 1:261871‑M2/1‑38 (MQ=255) tttAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaac > 1:2222067‑M2/1‑38 (MQ=255) aaGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgatta > 1:2017041‑M2/1‑27 (MQ=255) aGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttt > 1:1352577‑M2/1‑26 (MQ=255) gACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaa < 2:1593032‑M2/135‑111 (MQ=255) gACTTTCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaa < 2:1127012‑M2/135‑111 (MQ=255) ttCCAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaaaaat > 2:2073557‑M2/1‑21 (MQ=255) cAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaaaaatccg > 2:3814484‑M2/1‑18 (MQ=255) cAGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaaaaatccg > 2:431404‑M2/1‑18 (MQ=255) aGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaaaaatccgc < 2:1733702‑M2/135‑119 (MQ=255) aGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaaaaatccgc < 1:630650‑M2/135‑119 (MQ=255) aGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaaaaatccgc < 2:1009384‑M2/135‑119 (MQ=255) aGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagt > 2:735028‑M2/1‑17 (MQ=255) aGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagt < 1:735028‑M2/76‑60 (MQ=255) aGTAATTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttag > 1:107943‑M2/1‑17 (MQ=255) aTTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaaaaatccgcaag > 1:236661‑M2/1‑13 (MQ=255) aTTTGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaaaaatccgca > 1:3007805‑M2/1‑13 (MQ=255) tttGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccatt < 1:1025154‑M2/114‑103 (MQ=255) tGAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatatataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaaaaatccgcaagcgaa > 2:3359684‑M2/1‑10 (MQ=255) gAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaaaaatccgcaagcgcat < 2:2962246‑M2/135‑127 (MQ=255) gAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaaaaatccgcaagcgcat < 1:3496179‑M2/135‑127 (MQ=255) gAATAATCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctg > 1:441747‑M2/1‑9 (MQ=255) ataatCTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaaaaatccgcaagcgcatat < 2:1210166‑M2/135‑129 (MQ=255) cTtggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctataaacatcaaagttagtaaaagtcactagctttgatgtttttttatgtgtagctgattaacccgttgattagaaaaatccgcaagcgcatattggtg > 2:2440787‑M2/1‑2 (MQ=255) ttggctctttgtcaaatcggactgataaggtcatctatgaacatc > 2:516498‑M2/1‑1 (MQ=255) | GAAAAAGTTAGTGAATGTCAATGGCCATTCAAAAATGTAGGTTTTTGGCCCATAAATAACAAGGTTACTTATACGACAACTTTTTTTCTTTATAATCTTTAATTCGATAAGACTTTCCAGTAATTTGAATAATCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_36/1620‑1754 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |